Descrição do produto
Hieff NGS™ O módulo de fragmentação de DNA OnePot Pro fornece um reagente de fragmentação enzimática de nova geração projetado para Illumina® e MGI® plataformas de sequenciamento de alto rendimento . Este produto simplifica o processo de operação comparado com a interrupção mecânica complexa e também reduz muito o tempo e o custo ao realizar a fragmentação e o reparo final e dA-tailing de dsDNA em uma reação. Os produtos de fragmentação podem ser imediatamente ligados ao adaptador sem etapas de limpeza usando Hieff NGS™ Módulo de ligação de DNA de ritmo acelerado (Cat#12607) ou Hieff NGS™ Novo módulo de ligação de DNA (Cat#12626). Hieff NGS™ O módulo de fragmentação de DNA OnePot Pro pode trabalhar com uma ampla gama de entradas de DNA (genomas animais, vegetais e microbianos), variando de 500 pg-1μg na preparação da biblioteca.
Pacote Informação
| Não. | Nome | 12619ES24 | 12619ES96 |
| 12619-A | Esfregaço™ Tampão | 240 μL | 960 μL |
| 12619-B | Esfregaço™ Enzima | 120 μL | 480 μL |
Observação:
1. 12619 faz parte do kit de preparação de biblioteca de DNA Hieff NGS® OnePot Pro (Cat:12205).
2. O Esfregaço™ A enzima é misturada com enzimas envolvidas em reparo final e dA-tailing.
Envio e armazenamento
Hieff NGS™ O módulo de fragmentação de DNA OnePot Pro é enviado com bolsa de gelo e pode ser armazenado a -20℃ por 1 ano.
Cuidados
1. Este produto é compatível com uma faixa de 500 pg - 1 μg de DNA de entrada. DNA de entrada de alta qualidade (A260/A280 = 1,8-2,0) é altamente recomendado.
2. Alta concentração de quelante de íons metálicos ou outro sal restante no DNA de entrada pode afetar os experimentos subsequentes, é recomendado diluir ADN em TE amortecedor (10 mM Tris-HCl, 1 mM EDTA, pH 8,0).
Tabela 1.Diretriz para escolha do tempo de fragmentação do DNA genômico convencional
| Tamanho do pico principal do fragmento de inserção | Tempo de fragmentação | Faixa de otimização |
| 600 pb | 8 minutos | 6-12 minutos |
| 350 pb | 10 minutos | 8-14 minutos |
| 250 pb | 12 minutos | 10-15 minutos |
| 200 pb | 15 minutos | 13-18 minutos |
| 150 pb | 20 minutos | 15-25 minutos |
Tabela 2. Diretriz para escolha do tempo de fragmentação do FFPE ADN
| Tamanho do pico principal do fragmento de inserção | Tempo de fragmentação | DIN* |
| 250 pb | 9-13 minutos | > 8,0 |
| 250 pb | 8-11 minutos | 6,5-8,0 |
| 250 pb | 4-8 minutos | 4,2-6,5 |
| 250 pb | 3-6 minutos | 2,5-4,2 |
| 250 pb | 9-13 minutos | > 8,0 |
Observação: *DIN é o Número de Integridade do DNA, que um método para definir o grau de degradação do DNA FFPE usando o Agilent 2200.
3. Para DNA genômico convencional de alta qualidade, a fragmentação tempo se refere para a Tabela 1. Este produto é compatível com várias amostras com diferentes conteúdos de GC e tem viés mínimo. Para as amostras FFPE com diferentes graus de degradação, o tempo de fragmentação refere-se para a Tabela 2. Os clientes precisam ajustar o tempo de fragmentação recomendado em seu próprio sistema experimental para obter os melhores resultados.
4. O DNA pode ser digerido até o tamanho necessário de acordo com o tempo de fragmentação recomendado. Para garantir o efeito de fragmentação estável e de alta qualidade, o processo de fragmentação deve ser operado no gelo.
5. Para sua segurança e saúde, use equipamentos de proteção individual (EPI), como jalecos e luvas descartáveis, ao operar este produto.
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Perguntas frequentes
O produto é apenas para fins de pesquisa e não se destina ao uso terapêutico ou diagnóstico em humanos ou animais. Os produtos e o conteúdo são protegidos por patentes, marcas registradas e direitos autorais de propriedade da
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