Frequently Bought Together
As esferas de seleção de DNA Hieff NGS™ são preparadas com base no princípio SPRI (Solid Phase Reverse Immobilization) e são aplicáveis para purificação de DNA e seleção de tamanho durante a preparação de bibliotecas de sequenciamento de próxima geração (NGS). As esferas de seleção de DNA Hieff NGS™ são compatíveis com vários kits de preparação de bibliotecas de DNA e RNA e são uma boa alternativa de Contas AMPure.
Componentes
| Componentes No. | Nome | 12601ES08 | 12601ES56 | 12601ES75 |
| 12601 | Contas de seleção de DNA Hieff NGS™ | 5 mL | 60 mL | 450 mL |
Especificações
| Linha de produtos | Contas de limpeza e seleção de DNA |
| Matéria-prima inicial | ADN |
| Compatibilidade | ADN |
| Tecnologia de isolamento | Conta magnética |
| Tipo de produto final | ADN |
| Para uso com (aplicativo) | DNA celan up, seleção de tamanho de DNA |
Envio e armazenamento
As contas são enviadas com bolsas de gelo e podem ser armazenadas entre 2°C e 8°C por um ano.
Instruções
- 1. Preparação
Equilibre as esferas de seleção em temperatura ambiente por pelo menos 30 minutos antes de usar.
- 2. Seleção do tamanho do DNA
O fluxo de operação de seleção de tamanho é mostrado na Figura 1 e o protocolo é o seguinte.
Figura 1. Fluxograma de seleção do tamanho do DNA
2.1 Misture bem as contas agitando ou pipetando para cima e para baixo sempre antes de usar.
2.2 Adicione a primeira rodada de esferas de seleção à amostra (consulte a Tabela 1). Misture bem agitando ou pipetando para cima e para baixo pelo menos 10 vezes.
2.3 Incube em temperatura ambiente por 5 min.
2.4 Centrifugue o tubo brevemente e coloque-o no suporte magnético. Quando a solução estiver límpida (cerca de 5 min), transfira o sobrenadante para um novo tubo de PCR.
2.5 Adicione a segunda rodada de esferas de seleção à amostra da etapa 2.4 de acordo com a Tabela 1. Misture bem agitando ou pipetando para cima e para baixo pelo menos 10 vezes.
2.6 Incube em temperatura ambiente por 5 min.
2.7 Centrifugue o tubo brevemente e coloque-o no suporte magnético. Quando a solução estiver límpida (cerca de 5 min), aspire o sobrenadante e descarte.
2.8 Mantenha o tubo no suporte magnético e adicione 200 μL de etanol 80% recém-preparado sem perturbar as esferas, incubar em temperatura ambiente por 30 seg. Aspire o etanol e descarte.
2.9 Repita a etapa 2.8 uma vez para um total de duas lavagens.
2.10 Remova o etanol residual com pontas de pipeta de 10 µL. Mantenha o tubo no suporte magnético, seque as esferas de seleção ao ar com a tampa aberta até que as rachaduras apareçam (cerca de 5 min).
Observação: não seque demais as esferas de seleção. Isso pode resultar em menor recuperação do DNA alvo.
2.11 Remova o tubo do suporte magnético. Adicione uma quantidade apropriada de ddH2O (≥20 µL) e misture bem agitando ou pipetando para cima e para baixo pelo menos 10 vezes.
2.12 Incube em temperatura ambiente por 5 min.
Gire o tubo brevemente e coloque-o no suporte magnético. Quando a solução estiver límpida (cerca de 5 minutos), transfira 20 μL do sobrenadante para um novo tubo.
- 3. Condições recomendadas para seleção do tamanho do DNA
O DNA do timo do bezerro foi fragmentado por sonicação para preparar um fragmento de 100-1.000 pb, e duas rodadas de seleção de tamanho foram realizadas de acordo com a Tabela 1. Os resultados foram analisados usando o Agilent 2100 Bioanalyzer (Figura 2).
Tabela 1. Condição recomendada para seleção do tamanho do DNA
| Comprimento do fragmento de DNA | 250-350 pb | 320-420 pb | 450-550 pb | 550-700 pb | 700-900 pb | 800-1.000 pb |
| Proporção de contas: DNA para a 1ª Rodada | 0,80× | 0,70× | 0,60× | 0,55× | 0,50× | 0,45× |
| Proporção de contas: DNA para o 2º Redondo | 0,20× | 0,20× | 0,20× | 0,15× | 0,15× | 0,15× |
Nota: "×" na tabela indica o volume do DNA da amostra. Por exemplo, se o comprimento de inserção da biblioteca for 250 pb e o volume do DNA da amostra for 100 μL, o volume de esferas magnéticas usadas na primeira rodada de classificação será 0,80×100 μL=80 μL; o volume de esferas magnéticas usadas na segunda rodada de classificação será 0,20×100 μL=20 μL.
Figura 2. Eletroferograma do chip de DNA de alta sensibilidade Agilent 2100
Notas:
1. Para sua segurança e saúde, use jalecos e luvas descartáveis para a operação.
Citado de "Integração específica de sequência pela família 1 casposase de Candidatus Nitrosopumilus koreensis AR1. Ácidos Nucleicos Res. 2021;49(17):9938-9952. doi:10.1093/nar/gkab725"
Citado de "Infecção recente por Wolbachia altera comunidades microbianas em populações selvagens de Laodelphax striatellus. Microbioma. 2020;8(1):104. Publicado em 2020 Jul 2. doi:10.1186/s40168-020-00878-x"
[1] Wang X, Yuan Q, Zhang W, et al. Integração específica de sequência pela família 1 casposase de Candidatus Nitrosopumilus koreensis AR1. Ácidos Nucleicos Res. 2021;49(17):9938-9952. doi:10.1093/nar/gkab725(IF:16.971)
[2] Duan XZ, Sun JT, Wang LT, et al. A infecção recente por Wolbachia altera as comunidades microbianas em populações selvagens de Laodelphax striatellus. Microbioma. 2020;8(1):104. Publicado em 2 de julho de 2020. doi:10.1186/s40168-020-00878-x(IF:11.607)
[3] Canção B, Almatrafi E, Sang F, et al.Gerenciando sedimentos tratados com Fenton com biochar e composto de esterco de ovelha: efeitos nas características evolutivas da comunidade bacteriana. J Environ Manage. 2022;316:115218. doi:10.1016/j.jenvman.2022.115218(IF:6.789)
[4] Huang C, Mei Q, Lou L, et al. Colite ulcerativa em resposta ao transplante de microbiota fecal por meio da modulação da microbiota intestinal e do equilíbrio de células Th17/Treg. Células. 2022;11(11):1851. Publicado em 5 de junho de 2022. doi:10.3390/cells11111851(IF:6.600)
[5] Ghosh S, Yang X, Wang L, Zhang C, Zhao L. A alimentação prebiótica em fase ativa altera a microbiota intestinal, induz alívio independente do peso da esteatose hepática e do colesterol sérico em camundongos alimentados com dieta rica em gordura. Comput Struct Biotechnol J. 2020;19:448-458. Publicado em 24 de dezembro de 2020. doi:10.1016/j.csbj.2020.12.011(IF:6.018)
[6] Gao X, Yu B, Yu J, et al. Perfil de desenvolvimento da digestão de carboidratos na dieta em leitões. Front Microbiol. 2022;13:896660. Publicado em 29 de abril de 2022. doi:10.3389/fmicb.2022.896660(IF:5.640)
[7] Li P, Zhang Y, Yan F, Zhou X. Características de um bacteriófago, vB_Kox_ZX8, isolado de Klebsiella oxytoca clínica e seu efeito terapêutico na bacteremia de camundongos. Front Microbiol. 2021;12:763136. Publicado em 3 de dezembro de 2021. doi:10.3389/fmicb.2021.763136(IF:5.640)
[8] Lin Z, Luo P, Huang D, Wu Y, Li F, Liu H. Estratégia baseada em multiômicas para análise de toxicidade de acrilamida no modelo Saccharomyces cerevisiae. Chem Biol Interact. 2021;349:109682. doi:10.1016/j.cbi.2021.109682(IF:5.194)
[9] Sun X, Lv W, Wang Y, et al. O gene Mrgprb2 desempenha um papel nas reações anafilactóides induzidas pela injeção de Houttuynia cordata. J Etnofarmacol. 2022;289:115053. doi:10.1016/j.jep.2022.115053(IF:4.360)
[10] Ma H, Lai B, Zan C, Di X, Zhu X, Wang K. GLO1 contribui para a resistência a medicamentos de Escherichia coli por meio da indução do tipo PER de β-lactamases de espectro estendido. Infect Drug Resist. 2022;15:1573-1586. Publicado em 5 de abril de 2022. doi:10.2147/IDR.S358578(IF:4.003)
[11] Zhong Y, Zhao W, Tang Z, et al. Análise transcriptômica comparativa dos diferentes estágios de desenvolvimento do ovário em lagostins vermelhos do pântano Procambarus clarkii. BMC Genomics. 2021;22(1):199. Publicado em 21 de março de 2021. doi:10.1186/s12864-021-07537-x(IF:3.969)
[12] Lian C, Yang H, Lan J, et al. Análise comparativa de genomas de cloroplasto revela relações filogenéticas e variação intraespecífica na planta medicinal Isodon rubescens. PLoS One. 2022;17(4):e0266546. Publicado em 6 de abril de 2022. doi:10.1371/journal.pone.0266546(IF:3.240)
[13] Diao G, Huang J, Zheng X, et al. Prostaglandina E2 desempenha um papel duplo na regulação da migração de células dendríticas. Int J Mol Med. 2021;47(1):207-218. doi:10.3892/ijmm.2020.4801(IF:3.098)
[14] Bing XL, Zhao DS, Peng CW, Huang HJ, Hong XY. Semelhanças e variações espaciais de comunidades bacterianas e fúngicas em populações de cigarrinhas do arroz (Hemiptera: Delphacidae). Insect Sci. 2020;27(5):947-963. doi:10.1111/1744-7917.12782(IF:2.791)
[15] Li X, Zhou S, Zhang J, Zhou Z, Xiong Q. Mudanças direcionais na comunidade bacteriana intestinal em larvas de mosca-soldado-negra (Hermetia illucens). Animais (Basel). 2021;11(12):3475. Publicado em 6 de dezembro de 2021. doi:10.3390/ani11123475(IF:2.752)
[16] Yang J, Peng Y, Kong W. Identificação e sequência completa do genoma do vírus críptico da amoreira 1. Arch Virol. 2022;167(2):687-690. doi:10.1007/s00705-021-05350-1(IF:2.574)
[17] Chang Y, Xia X, Sui L, et al. A colonização endofítica de fungos entomopatogênicos aumenta a resistência das plantas a doenças ao alterar a comunidade bacteriana endofítica. 2021;61(12):1098-1112. doi:10.1002/emprego.202100494(SE:2.281)
[18] Ding CY, Ma YM, Li B, et al. Identificação e análise funcional de genes diferencialmente expressos em Myzus persicae (Hemiptera: Aphididae) em resposta ao trans-anetol. J Insect Sci. 2022;22(1):3. doi:10.1093/jisesa/ieab094(IF:1.857)
Storage
FAQ
Citations
Documents
Applications
Você também pode gostar
Investigação
Perguntas frequentes
O produto é apenas para fins de pesquisa e não se destina ao uso terapêutico ou diagnóstico em humanos ou animais. Os produtos e o conteúdo são protegidos por patentes, marcas registradas e direitos autorais de propriedade da
Certos aplicativos podem exigir direitos adicionais de propriedade intelectual de terceiros.