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Preparazione della libreria RNA
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Una libreria "strand-specific" è costruita tramite amplificazione PCR usando solo un filamento di cDNA retrotrascritto da RNA come stampo. Al contrario, una libreria trascrittomica convenzionale usa entrambi i filamenti di cDNA per l'amplificazione PCR. Di conseguenza, una libreria trascrittomica convenzionale non può distinguere la polarità dell'RNA, mentre una libreria "strand-specific" può distinguere efficacemente la polarità dell'RNA. Questa è la differenza fondamentale tra i due tipi di librerie.
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