Hieff NGS ™ DNA Selection Beads Superior Ampure XP Alternativ _ 12601ES
Hieff NGS ™ DNA Selection Beads Superior Ampure XP Alternativ _ 12601ES
Hieff NGS ™ DNA Selection Beads Superior Ampure XP Alternativ _ 12601ES
Rul over billedet for at zoome ind Klik på billedet for at zoome
Hieff NGS ™ DNA Selection Beads Superior Ampure XP Alternativ _ 12601ESHieff NGS ™ DNA Selection Beads Superior Ampure XP Alternativ _ 12601ESHieff NGS ™ DNA Selection Beads Superior Ampure XP Alternativ _ 12601ES
Hieff NGS ™ DNA Selection Beads Superior Ampure XP Alternativ _ 12601ES
Hieff NGS™ DNA-selektionsperler er fremstillet baseret på SPRI-princippet (Solid Phase Reverse Immobilization) og kan anvendes til DNA-oprensning og størrelsesudvælgelse under forberedelsen af ​​næste generations sekventeringsbiblioteker (NGS). Hieff NGS™ DNA Selection Beads er kompatible med forskellige DNA- og RNA-biblioteksforberedelseskit og er et godt alternativ til AMPure perler. Komponenter Komponenter nr. Navn 12601ES08 12601ES56 12601ES75 12601 Hieff NGS™ DNA-selektionsperler 5 ml 60 ml 450 ml Specifikationer Produktlinje DNA rene og udvalgte perler Udgangsmateriale DNA Kompatibilitet DNA Isoleringsteknologi Magnetisk perle Endelig produkttype DNA Til brug med (applikation) DNA celan up, DNA størrelse selektion...

Frequently Bought Together

Hieff NGS ™ DNA Selection Beads Superior Ampure XP Alternativ _ 12601ES

Spare $5.00
YeasenSKU: 12601ES03
Størrelse: 1mL
Pris:
$30.00 $35.00
Lager:
På lager

Hieff NGS™ DNA-selektionsperler er fremstillet baseret på SPRI-princippet (Solid Phase Reverse Immobilization) og kan anvendes til DNA-oprensning og størrelsesudvælgelse under forberedelsen af ​​næste generations sekventeringsbiblioteker (NGS). Hieff NGS™ DNA Selection Beads er kompatible med forskellige DNA- og RNA-biblioteksforberedelseskit og er et godt alternativ til AMPure perler.

Komponenter

Komponenter nr. Navn 12601ES08 12601ES56 12601ES75
12601 Hieff NGS™ DNA-selektionsperler 5 ml 60 ml 450 ml

Specifikationer

Produktlinje DNA rene og udvalgte perler
Udgangsmateriale DNA
Kompatibilitet DNA
Isoleringsteknologi Magnetisk perle
Endelig produkttype DNA
Til brug med (applikation) DNA celan up, DNA størrelse selektion

Forsendelse og opbevaring

Perlerne sendes med isposer og kan opbevares ved 2°C-8°C i et år.

Instruktioner

  • 1. Forberedelse

Udlign udvælgelsesperlerne ved stuetemperatur i mindst 30 minutter før brug.

  • 2. Valg af DNA-størrelse

Operationsflowet for størrelsesvalg er vist i figur 1, og protokollen er som følger.

Figur 1. Flowchartet for DNA-størrelsesudvælgelse

2.1 Bland perlerne grundigt ved at vortexe eller pipettere op og ned hver gang før brug.
2.2 Tilføj den første runde af udvælgelsesperler til prøven (se tabel 1). Bland grundigt ved at vortexe eller pipettere op og ned mindst 10 gange.
2.3 Inkuber ved stuetemperatur i 5 min.
2.4 Drej røret kort ned og anbring det på magnetisk stativ. Når opløsningen er klar (ca. 5 min), overføres supernatanten til et nyt PCR-rør.
2.5 Tilføj den anden runde af selektionsperler til prøven fra trin 2.4 i henhold til tabel 1. Bland grundigt ved at vortexe eller pipettere op og ned mindst 10 gange.
2.6 Inkuber ved stuetemperatur i 5 min.
2.7 Drej røret kort ned og placer det på magnetisk stativ. Når opløsningen er klar (ca. 5 min), aspireres supernatanten og kasseres.
2.8 Hold røret i det magnetiske stativ og tilsæt 200 μL frisklavet 80 % ethanol til uden at forstyrre perlerne, inkuber ved stuetemperatur i 30 sek. Aspirer ethanolen og kasser den.
2.9 Gentag trin 2.8 én gang for i alt to vaske.
2.10 Fjern resterende ethanol med 10 µL pipettespidser. Hold røret i det magnetiske stativ, lufttørre udvælgelsesperlerne med låget åbent, indtil der lige er revner (ca. 5 min.).
Bemærk:Tør ikke udvalgsperlerne for meget. Dette kan resultere i et lavere gendannelses-DNA-mål.
2.11 Fjern røret fra det magnetiske stativ. Tilsæt en passende mængde ddH2O (≥20 µL) og bland grundigt ved at vortexe eller pipettere op og ned mindst 10 gange.
2.12 Inkuber ved stuetemperatur i 5 min.
Drej røret kort ned og placer det på det magnetiske stativ. Når opløsningen er klar (ca. 5 minutter), overføres 20 μL af supernatanten til et nyt rør.

  • 3. Anbefalede betingelser for valg af DNA-størrelse

Kalvethymus-DNA'et blev fragmenteret ved sonikering for at fremstille et fragment på 100-1.000 bp, og to runder af størrelsesudvælgelse blev udført i henhold til tabel 1. Resultaterne blev analyseret under anvendelse af Agilent 2100 Bioanalyzer (figur 2).

Tabel 1. Anbefalet betingelse for valg af DNA-størrelse

Længde af DNA-fragment 250-350 bp 320-420 bp 450-550 bp 550-700 bp 700-900 bp 800-1.000 bp
Forholdet mellem perler: DNA til 1. runde 0,80× 0,70× 0,60× 0,55× 0,50× 0,45×
Forholdet mellem perler: DNA for 2 Rund 0,20× 0,20× 0,20× 0,15× 0,15× 0,15×

Bemærk: "×" i tabellen angiver volumen af ​​prøve-DNA. For eksempel, hvis insertlængden af ​​biblioteket er 250 bp, og prøvens DNA-volumen er 100 μL, er volumenet af magnetiske perler, der anvendes i den første sorteringsrunde, 0,80×100 μL=80 μL; volumenet af magnetiske perler brugt i anden sorteringsrunde er 0,20× 100 μL=20 μL.

Figur 2. Agilent 2100 højfølsom DNA-chip elektroferogram

Bemærkninger:
1. For din sikkerhed og sundhed skal du bære laboratoriefrakker og engangshandsker til betjening.

Citeret fra "Sekvensspecifik integration af familie 1 casposase fra Candidatus Nitrosopumilus koreensis AR1. Nucleic Acids Res. 2021;49(17):9938-9952. doi:10.1093/nar/gkab725"

Citeret fra "Nylig infektion af Wolbachia ændrer mikrobielle samfund i vilde Laodelphax striatellus-populationer. Mikrobiom. 2020;8(1):104. Udgivet 2020. jul. doi:10.1186/s40168-020-00878-x"

Dokumenter:
Citater og referencer:

[1] Wang X, Yuan Q, Zhang W, et al. Sekvensspecifik integration af familie 1 casposase fra Candidatus Nitrosopumilus koreensis AR1. Nucleic Acids Res. 2021;49(17):9938-9952. doi:10.1093/nar/gkab725(IF:16.971)

[2] Duan XZ, Sun JT, Wang LT, et al. Nylig infektion af Wolbachia ændrer mikrobielle samfund i vilde Laodelphax striatellus-populationer. Mikrobiom. 2020;8(1):104. Udgivet 2. juli 2020. doi:10.1186/s40168-020-00878-x(IF:11.607)

[3] Sang B, Almatrafi E, Sang F, et al.Håndtering af Fenton-behandlet sediment med biochar og fåregødningskompost: Effekter på bakteriesamfundets evolutionære karakteristika. J Environ Administrer. 2022;316:115218. doi:10.1016/j.jenvman.2022.115218(IF:6.789)

[4] Huang C, Mei Q, Lou L, et al. Colitis ulcerosa som svar på fækal mikrobiotatransplantation via modulering af tarmmikrobiota og Th17/Treg cellebalance. Celler. 2022;11(11):1851. Udgivet 5. juni 2022. doi:10.3390/cells11111851(IF:6.600)

[5] Ghosh S, Yang X, Wang L, Zhang C, Zhao L. Aktiv fase af præbiotisk fodring ændrer tarmmikrobiota, inducerer vægtuafhængig lindring af hepatisk steatose og serumkolesterol hos mus med højt fedtindhold. Comput Struct Biotechnol J. 2020;19:448-458. Udgivet 24. december 2020. doi:10.1016/j.csbj.2020.12.011(IF:6.018)

[6] Gao X, Yu B, Yu J, et al. Udviklingsprofilering af diætkulhydratfordøjelse hos smågrise. Front Microbiol. 2022;13:896660. Udgivet 2022 29. april doi:10.3389/fmicb.2022.896660(IF:5.640)

[7] Li P, Zhang Y, Yan F, Zhou X. Karakteristika for en bakteriophag, vB_Kox_ZX8, isoleret fra klinisk Klebsiella oxytoca og dens terapeutiske virkning på musbakteriæmi. Front Microbiol. 2021;12:763136. Udgivet 3. december 2021. doi:10.3389/fmicb.2021.763136(IF:5.640)

[8] Lin Z, Luo P, Huang D, Wu Y, Li F, Liu H. Multi-omics baseret strategi for toksicitetsanalyse af akrylamid i Saccharomyces cerevisiae model. Chem Biol Interact. 2021;349:109682. doi:10.1016/j.cbi.2021.109682(IF:5.194)

[9] Sun X, Lv W, Wang Y, et al. Mrgprb2-genet spiller en rolle i de anafylaktoide reaktioner induceret af Houttuynia cordata-injektion. J Ethnopharmacol. 2022;289:115053. doi:10.1016/j.jep.2022.115053(IF:4.360)

[10] Ma H, Lai B, Zan C, Di X, Zhu X, Wang K. GLO1 bidrager til lægemiddelresistens af Escherichia coli gennem inducering af PER-type af udvidet spektrum β-laktamaser. Infect Drug Resist. 2022;15:1573-1586. Udgivet 5. april 2022. doi:10.2147/IDR.S358578(IF:4.003)

[11] Zhong Y, Zhao W, Tang Z, et al. Komparativ transkriptomisk analyse af de forskellige udviklingsstadier af æggestokken hos rød sumpkrebs Procambarus clarkii. BMC Genomics. 2021;22(1):199. Udgivet 2021 21. marts doi:10.1186/s12864-021-07537-x(IF:3.969)

[12] Lian C, Yang H, Lan J, et al. Sammenlignende analyse af kloroplastgenomer afslører fylogenetiske forhold og intraspecifik variation i lægeplanten Isodon rubescens. PLoS One. 2022;17(4):e0266546. Udgivet 6. april 2022. doi:10.1371/journal.pone.0266546(IF:3.240)

[13] Diao G, Huang J, Zheng X, et al. Prostaglandin E2 tjener en dobbelt rolle i reguleringen af ​​migrationen af ​​dendritiske celler. Int J Mol Med. 2021;47(1):207-218. doi:10.3892/ijmm.2020.4801(IF:3.098)

[14] Bing XL, Zhao DS, Peng CW, Huang HJ, Hong XY. Ligheder og rumlige variationer af bakterie- og svampesamfund i populationer af markrisplanthopper (Hemiptera: Delphacidae). Insect Sci. 2020;27(5):947-963. doi:10.1111/1744-7917.12782(IF:2.791)

[15] Li X, Zhou S, Zhang J, Zhou Z, Xiong Q. Retningsændringer i tarmbakteriesamfundet hos sorte soldaterflue (Hermetia illucens) larver. Dyr (Basel). 2021;11(12):3475. Udgivet 6. december 2021. doi:10.3390/ani11123475(IF:2.752)

[16] Yang J, Peng Y, Kong W. Identifikation og komplet genomsekvens af morbærkryptisk virus 1. Arch Virol. 2022;167(2):687-690. doi:10.1007/s00705-021-05350-1(IF:2.574)

[17] Chang Y, Xia X, Sui L, et al. Endofytisk kolonisering af entomopatogene svampe øger plantesygdomsresistens ved at ændre det endofytiske bakteriesamfund. J Basic Microbiol. 2021;61(12):1098-1112. doi:10.1002/jobm.202100494(IF:2.281)

[18] Ding CY, Ma YM, Li B, et al. Identifikation og funktionel analyse af differentielt udtrykte gener i Myzus persicae (Hemiptera: Aphididae) som svar på trans-anethol. J Insect Sci. 2022;22(1):3. doi:10.1093/jisesa/ieab094(IF:1.857)

Storage

This product should be stored at 2~8℃ for 18 months.

FAQ

It can purify DNA fragments of 150bp or longer. If the purified DNA contains a large amount of fragments shorter than 150bp, please use product number 12600, which can purify DNA fragments of 50bp or longer.
You need to figure out the system on your own. The currently selected system for the selected fragments is the one described in the manual. For other fragment selections, you can refer to the selection system in the manual for adjustment.
It is not recommended to freeze for a long time, as the low temperature will damage the structure of the magnetic beads. Freezing and thawing once for NGS library sorting and purification does not significantly affect the performance for a short period of time. However, the actual result should be based on specific test results.
Keeping the magnetic beads at room temperature may have some impact on their recovery performance. It is not recommended to leave them at room temperature for too long. After use, it is advisable to store them at 4℃. The separation effect of PEG is easily affected by factors such as pH and temperature.
The DNA sorting and purification magnetic beads are based on a technology called Solid Phase Reversible Immobilization (SPRI). The buffer of the magnetic beads generally contains: magnetic beads, DNA, PEG, salt ions (mainly Na+), etc. Under the action of PEG and NaCl, the DNA molecules will undergo dehydration condensation, resulting in a change in DNA conformation and aggregation precipitation. The negatively charged ones can be eluted from the bound DNA molecules when using buffer solutions without enzymes or TE (low salt and low PEG content).
Under different PEG and salt ion concentrations, the conformations of different lengths of DNA are different. Moreover, longer DNA fragments carry more negative charges, so magnetic beads generally preferentially adsorb long DNA fragments. Sorting usually requires two rounds of magnetic bead separation. In the first round, magnetic beads bind to the DNA of larger molecular weight, and this part of the product is removed by discarding the magnetic beads. At this time, the target-sized DNA is in the supernatant; in the second round, magnetic beads bind to the larger molecular weight DNA in the remaining products, and the smaller molecular weight DNA is removed by discarding the supernatant. At this point, the target-sized DNA is on the magnetic beads, and through two rounds of magnetic bead separation, the sorting goal is achieved.
It is not recommended to use 12601. Instead, 12600 should be used. The minimum fragment that can be recovered is about 100bp. The recovery rate of 50bp or above may be affected.
 Magnetic beads can adsorb both double-stranded DNA and single-stranded DNA, but they cannot distinguish between single-stranded or double-stranded DNA. The number of times single-stranded DNA can be purified by the magnetic beads can be referred to in the manual for double-stranded DNA.
12601ES is a non-specific adsorption magnetic bead that can also bind to RNA. If you want to remove RNA, you need to treat it with RNase A.
It is not recommended to use it. Although magnetic beads can also adsorb RNA fragments, the magnetic bead buffer is designed based on DNA characteristics and is not conducive to the stability of RNA structure. For RNA purification, it is recommended to use RNA purification magnetic beads (item number 12602ES).
1) The magnetic beads and DNA were not thoroughly mixed, resulting in insufficient adsorption. It is recommended to ensure thorough mixing of the reaction system.
2) The proportion of magnetic beads is incorrect. It is recommended to select the appropriate proportion according to the instructions.
3) The incubation time is insufficient. Ensure that the incubation time is at least 5 minutes.
4) During magnetic bead separation, when the two wheels perform magnetic bead adsorption, the magnetic beads are collected. A 10 μL pipette can be connected in series before the 200 μL pipette for liquid transfer, which can prevent the collection of magnetic beads.
5) During the magnetic bead washing process, the ethanol solution was not prepared freshly, resulting in an insufficiently high ethanol concentration. It is recommended that the ethanol concentration be no less than 70%, and for small fragments, it should be no less than 80%.
6) Excessive drying: If the magnetic beads are dried for too long, the surface will crack, making it difficult to elute the DNA and resulting in a decrease in yield. It is recommended that the drying time should not be too long; the moment the surface begins to crack, drying should be stopped.
7) Insufficient volume of elution solution: The final elution solution should completely cover the magnetic beads within the tube.
8) Sample reasons: The sample purity is low and contains impurities. When there are a large amount of impurities in the sample, it may cause the magnetic beads to aggregate and harden, resulting in insufficient elution. Using a pipette, try to blow the magnetic beads apart as much as possible, extend the elution time, and increase the product recovery rate. If there are many large fragments in the sample, the large fragments will cause the magnetic beads to aggregate. During elution, you can prolong the time or, if necessary, incubate at 37 degrees to improve the yield.

Citations

Documents

Brochure
Magnetic_Beads_for_DNA_RNA_and_mRNA_Enrichment.pdf

Applications

Du kan også lide

Forespørgsel

FAQ

Produktet er kun til forskningsformål og er ikke beregnet til terapeutisk eller diagnostisk brug hos mennesker eller dyr. Produkter og indhold er beskyttet af patenter, varemærker og ophavsrettigheder ejet af Yeasen Biotechnology. Varemærkesymboler angiver oprindelseslandet, ikke nødvendigvis registrering i alle regioner.

Visse applikationer kan kræve yderligere tredjeparts intellektuelle ejendomsrettigheder.

Yeasen er dedikeret til etisk videnskab og mener, at vores forskning bør adressere kritiske spørgsmål og samtidig sikre sikkerhed og etiske standarder.