Hieff NGS ™ DNA Seçim Boncukları Üstün Ampure XP Alternatif _ 12601es
Hieff NGS ™ DNA Seçim Boncukları Üstün Ampure XP Alternatif _ 12601es
Hieff NGS ™ DNA Seçim Boncukları Üstün Ampure XP Alternatif _ 12601es
Yakınlaştırmak için görüntüyü yuvarlayın Yakınlaştırmak için resme tıklayın
Hieff NGS ™ DNA Seçim Boncukları Üstün Ampure XP Alternatif _ 12601esHieff NGS ™ DNA Seçim Boncukları Üstün Ampure XP Alternatif _ 12601esHieff NGS ™ DNA Seçim Boncukları Üstün Ampure XP Alternatif _ 12601es
Hieff NGS ™ DNA Seçim Boncukları Üstün Ampure XP Alternatif _ 12601es
Hieff NGS™ DNA Seçim Boncukları, SPRI (Katı Faz Ters İmmobilizasyon) prensibine göre hazırlanır ve yeni nesil dizileme (NGS) kütüphanelerinin hazırlanması sırasında DNA saflaştırma ve boyut seçimi için uygulanabilir. Hieff NGS™ DNA Seçim Boncukları çeşitli DNA ve RNA kütüphane hazırlama kitleriyle uyumludur ve iyi bir alternatiftir. AMPür boncuklar. Bileşenler Bileşenler No. İsim 12601ES08 12601ES56 12601ES75 12601 Hieff NGS™ DNA Seçim Boncukları 5 ml 60 ml 450 ml Özellikler Ürün Grubu DNA temizleme ve seçme Boncukları Başlangıç ​​Malzemesi DNA Uyumluluk DNA Yalıtım Teknolojisi Manyetik Boncuk Son Ürün Türü DNA (Uygulama) ile Kullanım...

Frequently Bought Together

Hieff NGS ™ DNA Seçim Boncukları Üstün Ampure XP Alternatif _ 12601es

Kaydetmek $5.00
YeasenSKU: 12601ES03
Boyut: 1mL
Fiyat:
$30.00 $35.00
Stoklamak:
Stokta var

Hieff NGS™ DNA Seçim Boncukları, SPRI (Katı Faz Ters İmmobilizasyon) prensibine göre hazırlanır ve yeni nesil dizileme (NGS) kütüphanelerinin hazırlanması sırasında DNA saflaştırma ve boyut seçimi için uygulanabilir. Hieff NGS™ DNA Seçim Boncukları çeşitli DNA ve RNA kütüphane hazırlama kitleriyle uyumludur ve iyi bir alternatiftir. AMPür boncuklar.

Bileşenler

Bileşenler No. İsim 12601ES08 12601ES56 12601ES75
12601 Hieff NGS™ DNA Seçim Boncukları 5 ml 60 ml 450 ml

Özellikler

Ürün Grubu DNA temizleme ve seçme Boncukları
Başlangıç ​​Malzemesi DNA
Uyumluluk DNA
Yalıtım Teknolojisi Manyetik Boncuk
Son Ürün Türü DNA
(Uygulama) ile Kullanım İçin DNA temizleme, DNA boyut seçimi

Nakliye ve Depolama

Boncuklar buz torbalarıyla gönderiliyor ve 2°C-8°C'de bir yıl saklanabiliyor.

Talimatlar

  • 1. Hazırlık

Seçme boncuklarını kullanmadan önce en az 30 dakika oda sıcaklığında dengeleyin.

  • 2. DNA Boyut seçimi

Boyut seçiminin işlem akışı Şekil 1’de gösterilmiş olup protokol aşağıdaki gibidir.

Şekil 1. DNA Boyut Seçiminin Akış Şeması

2.1 Her kullanımdan önce boncukları vorteksleyerek veya pipetleme yoluyla yukarı aşağı hareket ettirerek iyice karıştırın.
2.2 Numuneye ilk tur seçme boncuklarını ekleyin (Tablo 1'e bakın). En az 10 kez vorteksleyerek veya pipetleme yaparak iyice karıştırın.
2.3 Oda sıcaklığında 5 dakika inkübe edin.
2.4 Tüpü kısa bir süre döndürün ve manyetik standa yerleştirin. Çözelti berraklaştığında (yaklaşık 5 dakika), üstteki sıvıyı yeni bir PCR tüpüne aktarın.
2.5 Tablo 1'e göre 2.4. adımdaki numuneye ikinci tur seçme boncuklarını ekleyin. En az 10 kez vorteksleyerek veya pipetleme yaparak iyice karıştırın.
2.6 Oda sıcaklığında 5 dakika inkübe edin.
2.7 Tüpü kısa bir süre döndürün ve manyetik standa yerleştirin. Çözelti berraklaştığında (yaklaşık 5 dakika), üstteki sıvıyı aspire edin ve atın.
2.8 Tüpü manyetik standa koyun ve boncukları bozmadan 200 μL taze hazırlanmış %80'lik etanol ekleyin, oda sıcaklığında 30 saniye inkübe edin. Etanolü aspire edin ve atın.
2.9 Toplam iki yıkama için 2.8 adımını bir kez tekrarlayın.
2.10 Kalan etanolü 10 µL pipet uçlarıyla çıkarın. Tüpü manyetik standda tutun, çatlaklar görünene kadar seçme boncuklarını kapağı açık şekilde havada kurutun (yaklaşık 5 dk).
Not: Seçim boncuklarını aşırı kurutmayın. Bu, daha düşük kurtarma DNA hedefine yol açabilir.
2.11 Tüpü manyetik standdan çıkarın. Uygun miktarda ddH2O (≥20 µL) ekleyin ve en az 10 kez vorteksleyerek veya pipetleyerek iyice karıştırın.
2.12 Oda sıcaklığında 5 dakika inkübe edin.
Tüpü kısa bir süre döndürün ve manyetik standa yerleştirin. Çözelti berraklaştığında (yaklaşık 5 dakika), 20 μL üst sıvıyı yeni bir tüpe aktarın.

  • 3.DNA Boyutu Seçimi İçin Önerilen Koşullar

Buzağı timüs DNA'sı sonikasyonla parçalanarak 100-1000 bp'lik bir parça hazırlandı ve Tablo 1'e göre iki tur boyut seçimi yapıldı. Sonuçlar Agilent 2100 Bioanalyzer kullanılarak analiz edildi (Şekil 2).

Tablo 1. DNA boyutu seçimi için önerilen koşullar

DNA parçasının uzunluğu 250-350 baz puan 320-420 baz puan 450-550 bp 550-700 baz puan 700-900 baz puan 800-1.000 bp
Boncuk Oranı: 1. Tur için DNA 0,80× 0,70× 0,60× 0,55× 0,50× 0,45×
Boncuk Oranı: 2. için DNA Yuvarlak 0,20× 0,20× 0,20× 0,15× 0,15× 0,15×

Not: Tablodaki "×" örnek DNA'nın hacmini belirtir. Örneğin, kütüphanenin insert uzunluğu 250 bp ve örnek DNA hacmi 100 μL ise, ilk sıralama turunda kullanılan manyetik boncukların hacmi 0,80×100 μL=80 μL'dir; ikinci sıralama turunda kullanılan manyetik boncukların hacmi 0,20×100 μL=20 μL'dir.

Şekil 2. Agilent 2100 yüksek hassasiyetli DNA çip elektroferogramı

Notlar:
1. Kendi güvenliğiniz ve sağlığınız için lütfen operasyon sırasında laboratuvar önlüğü ve tek kullanımlık eldiven giyin.

"Candidatus Nitrosopumilus koreensis'ten aile 1 kaspozazı tarafından diziye özgü entegrasyon"dan alıntılanmıştır AR1. Nükleik Asitler Res. 2021;49(17):9938-9952. doi:10.1093/nar/gkab725"

"Wolbachia'nın son enfeksiyonu vahşi Laodelphax striatellus popülasyonlarındaki mikrobiyal toplulukları değiştiriyor. Mikrobiyom. 2020;8(1):104. 2 Temmuz 2020'de yayınlandı. doi:10.1186/s40168-020-00878-x"

Belgeler:
Alıntılar ve Referanslar:

[1] Wang X, Yuan Q, Zhang W, ve diğerleri. Candidatus Nitrosopumilus koreensis'ten aile 1 kaspozazı tarafından diziye özgü entegrasyon AR1. Nükleik Asitler Res. 2021;49(17):9938-9952. doi:10.1093/nar/gkab725(IF:16.971)

[2] Duan XZ, Sun JT, Wang LT, ve diğerleri. Wolbachia'nın son enfeksiyonu, vahşi Laodelphax striatellus popülasyonlarındaki mikrobiyal toplulukları değiştiriyor. Mikrobiyom. 2020;8(1):104. 2 Temmuz 2020'de yayınlandı. doi:10.1186/s40168-020-00878-x(IF:11.607)

[3] Song B, Almatrafi E, Sang F, ve diğerleri.Fenton ile işlenmiş tortunun biyokömür ve koyun gübresi kompostu ile yönetimi: Bakteriyel topluluğun evrimsel özellikleri üzerindeki etkiler. J Environ Manage. 2022;316:115218. doi:10.1016/j.jenvman.2022.115218(IF:6.789)

[4] Huang C, Mei Q, Lou L, ve diğerleri. Bağırsak Mikrobiyotası ve Th17/Treg Hücre Dengesinin Modülasyonu Yoluyla Dışkı Mikrobiyotası Transplantasyonuna Yanıt Olarak Ülseratif Kolit. Hücreler. 2022;11(11):1851. 5 Haziran 2022'de yayımlandı. doi:10.3390/cells11111851(IF:6.600)

[5] Ghosh S, Yang X, Wang L, Zhang C, Zhao L. Aktif faz prebiyotik beslenme bağırsak mikrobiyotasını değiştirir, yüksek yağlı diyetle beslenen farelerde hepatik steatoz ve serum kolesterolünün kilodan bağımsız olarak hafifletilmesini sağlar. Comput Struct Biotechnol J. 2020;19:448-458. 24 Aralık 2020'de yayımlandı. doi:10.1016/j.csbj.2020.12.011(IF:6.018)

[6] Gao X, Yu B, Yu J, ve diğerleri. Domuz Yavrularında Diyet Karbonhidrat Sindiriminin Gelişimsel Profili. Front Microbiol. 2022;13:896660. 29 Nisan 2022'de yayımlandı. doi:10.3389/fmicb.2022.896660(IF:5.640)

[7] Li P, Zhang Y, Yan F, Zhou X. Klinik Klebsiella oxytoca'dan İzole Edilen Bir Bakteriyofaj, vB_Kox_ZX8'in Özellikleri ve Fare Bakteriyemisi Üzerindeki Terapötik Etkisi. Front Microbiol. 2021;12:763136. 3 Aralık 2021'de yayımlandı. doi:10.3389/fmicb.2021.763136(IF:5.640)

[8] Lin Z, Luo P, Huang D, Wu Y, Li F, Liu H. Saccharomyces cerevisiae modelinde akrilamidin toksisite analizi için çoklu omik tabanlı strateji. Chem Biol Interact. 2021;349:109682. doi:10.1016/j.cbi.2021.109682(IF:5.194)

[9] Sun X, Lv W, Wang Y, ve diğerleri. Mrgprb2 geni, Houttuynia cordata enjeksiyonunun neden olduğu anafilaktoid reaksiyonlarda rol oynar. J Etnofarmakol. 2022;289:115053. doi:10.1016/j.jep.2022.115053(IF:4.360)

[10] Ma H, Lai B, Zan C, Di X, Zhu X, Wang K. GLO1, PER Tipi Genişletilmiş Spektrumlu β-Laktamazları Tetikleyerek Escherichia coli'nin İlaç Direncine Katkıda Bulunur. Enfekte İlaç Direnci. 2022;15:1573-1586. 5 Nisan 2022'de yayımlandı. doi:10.2147/IDR.S358578(IF:4.003)

[11] Zhong Y, Zhao W, Tang Z, ve diğerleri. Kırmızı bataklık kereviti Procambarus clarkii'deki yumurtalığın farklı gelişim aşamalarının karşılaştırmalı transkriptomik analizi. BMC Genomics. 2021;22(1):199. 2021 Mart 21'de yayımlandı. doi:10.1186/s12864-021-07537-x(IF:3.969)

[12] Lian C, Yang H, Lan J, ve diğerleri. Kloroplast genomlarının karşılaştırmalı analizi, tıbbi bitki Isodon rubescens'te filogenetik ilişkileri ve tür içi çeşitliliği ortaya koyuyor. PLoS One. 2022;17(4):e0266546. 6 Nisan 2022'de yayımlandı. doi:10.1371/journal.pone.0266546(IF:3.240)

[13] Diao G, Huang J, Zheng X, ve diğerleri. Prostaglandin E2, dendritik hücrelerin göçünü düzenlemede ikili bir rol oynar. Int J Mol Med. 2021;47(1):207-218. doi:10.3892/ijmm.2020.4801(IF:3.098)

[14] Bing XL, Zhao DS, Peng CW, Huang HJ, Hong XY. Tarla pirinç bitki zararlısı (Hemiptera: Delphacidae) popülasyonlarındaki bakteri ve mantar topluluklarının benzerlikleri ve mekansal varyasyonları. Böcek Bilimi 2020;27(5):947-963. doi:10.1111/1744-7917.12782(IF:2.791)

[15] Li X, Zhou S, Zhang J, Zhou Z, Xiong Q. Kara Asker Sineği (Hermetia illucens) Larvalarında Bağırsak Bakteriyel Topluluğundaki Yönsel Değişiklikler. Hayvanlar (Basel). 2021;11(12):3475. 6 Aralık 2021'de yayınlandı. doi:10.3390/ani11123475(IF:2.752)

[16] Yang J, Peng Y, Kong W. Dut gizli virüsü 1'in tanımlanması ve tam genom dizisi. Arch Virol. 2022;167(2):687-690. doi:10.1007/s00705-021-05350-1(IF:2.574)

[17] Chang Y, Xia X, Sui L, ve diğerleri. Entomopatojenik mantarların endofitik kolonizasyonu, endofitik bakteri topluluğunu değiştirerek bitki hastalık direncini artırır. J Basic Microbiol. 2021;61(12):1098-1112. doi:10.1002/jobm.202100494(EĞER:2.281)

[18] Ding CY, Ma YM, Li B, ve diğerleri. Trans-anethole'e Yanıt Olarak Myzus persicae'de (Hemiptera: Aphididae) Farklı Olarak İfade Edilen Genlerin Tanımlanması ve İşlevsel Analizi. J Insect Sci. 2022;22(1):3. doi:10.1093/jisesa/ieab094(IF:1.857)

Storage

This product should be stored at 2~8℃ for 18 months.

FAQ

It can purify DNA fragments of 150bp or longer. If the purified DNA contains a large amount of fragments shorter than 150bp, please use product number 12600, which can purify DNA fragments of 50bp or longer.
You need to figure out the system on your own. The currently selected system for the selected fragments is the one described in the manual. For other fragment selections, you can refer to the selection system in the manual for adjustment.
It is not recommended to freeze for a long time, as the low temperature will damage the structure of the magnetic beads. Freezing and thawing once for NGS library sorting and purification does not significantly affect the performance for a short period of time. However, the actual result should be based on specific test results.
Keeping the magnetic beads at room temperature may have some impact on their recovery performance. It is not recommended to leave them at room temperature for too long. After use, it is advisable to store them at 4℃. The separation effect of PEG is easily affected by factors such as pH and temperature.
The DNA sorting and purification magnetic beads are based on a technology called Solid Phase Reversible Immobilization (SPRI). The buffer of the magnetic beads generally contains: magnetic beads, DNA, PEG, salt ions (mainly Na+), etc. Under the action of PEG and NaCl, the DNA molecules will undergo dehydration condensation, resulting in a change in DNA conformation and aggregation precipitation. The negatively charged ones can be eluted from the bound DNA molecules when using buffer solutions without enzymes or TE (low salt and low PEG content).
Under different PEG and salt ion concentrations, the conformations of different lengths of DNA are different. Moreover, longer DNA fragments carry more negative charges, so magnetic beads generally preferentially adsorb long DNA fragments. Sorting usually requires two rounds of magnetic bead separation. In the first round, magnetic beads bind to the DNA of larger molecular weight, and this part of the product is removed by discarding the magnetic beads. At this time, the target-sized DNA is in the supernatant; in the second round, magnetic beads bind to the larger molecular weight DNA in the remaining products, and the smaller molecular weight DNA is removed by discarding the supernatant. At this point, the target-sized DNA is on the magnetic beads, and through two rounds of magnetic bead separation, the sorting goal is achieved.
It is not recommended to use 12601. Instead, 12600 should be used. The minimum fragment that can be recovered is about 100bp. The recovery rate of 50bp or above may be affected.
 Magnetic beads can adsorb both double-stranded DNA and single-stranded DNA, but they cannot distinguish between single-stranded or double-stranded DNA. The number of times single-stranded DNA can be purified by the magnetic beads can be referred to in the manual for double-stranded DNA.
12601ES is a non-specific adsorption magnetic bead that can also bind to RNA. If you want to remove RNA, you need to treat it with RNase A.
It is not recommended to use it. Although magnetic beads can also adsorb RNA fragments, the magnetic bead buffer is designed based on DNA characteristics and is not conducive to the stability of RNA structure. For RNA purification, it is recommended to use RNA purification magnetic beads (item number 12602ES).
1) The magnetic beads and DNA were not thoroughly mixed, resulting in insufficient adsorption. It is recommended to ensure thorough mixing of the reaction system.
2) The proportion of magnetic beads is incorrect. It is recommended to select the appropriate proportion according to the instructions.
3) The incubation time is insufficient. Ensure that the incubation time is at least 5 minutes.
4) During magnetic bead separation, when the two wheels perform magnetic bead adsorption, the magnetic beads are collected. A 10 μL pipette can be connected in series before the 200 μL pipette for liquid transfer, which can prevent the collection of magnetic beads.
5) During the magnetic bead washing process, the ethanol solution was not prepared freshly, resulting in an insufficiently high ethanol concentration. It is recommended that the ethanol concentration be no less than 70%, and for small fragments, it should be no less than 80%.
6) Excessive drying: If the magnetic beads are dried for too long, the surface will crack, making it difficult to elute the DNA and resulting in a decrease in yield. It is recommended that the drying time should not be too long; the moment the surface begins to crack, drying should be stopped.
7) Insufficient volume of elution solution: The final elution solution should completely cover the magnetic beads within the tube.
8) Sample reasons: The sample purity is low and contains impurities. When there are a large amount of impurities in the sample, it may cause the magnetic beads to aggregate and harden, resulting in insufficient elution. Using a pipette, try to blow the magnetic beads apart as much as possible, extend the elution time, and increase the product recovery rate. If there are many large fragments in the sample, the large fragments will cause the magnetic beads to aggregate. During elution, you can prolong the time or, if necessary, incubate at 37 degrees to improve the yield.

Citations

Documents

Brochure
Magnetic_Beads_for_DNA_RNA_and_mRNA_Enrichment.pdf

Applications

Ayrıca sevebilirsiniz

Sorgu

SSS

Ürün yalnızca araştırma amaçlıdır ve insanlarda veya hayvanlarda terapötik veya teşhis amaçlı kullanım için tasarlanmamıştır. Ürünler ve içerikler, Yeasen Biotechnology'nin sahip olduğu patentler, ticari markalar ve telif haklarıyla korunmaktadır. Ticari marka sembolleri, tüm bölgelerde tescilli olmayıp, menşe ülkesini gösterir.

Bazı uygulamalar üçüncü tarafların ek fikri mülkiyet haklarına ihtiyaç duyabilir.

Yeasen, araştırmalarımızın güvenlik ve etik standartları sağlarken kritik soruları ele alması gerektiğine inanarak etik bilime kendini adamıştır.