Hieff NGS ™ DNA Selection Beads Superior Ampure XP ทางเลือก _ 12601ES

บันทึก $5.00
YeasenSKU: 12601ES03

ขนาด: 1mL
ราคา:
ราคาขาย$30.00 ราคาปกติ$35.00
คลังสินค้า:
ในสต็อก

ลูกปัดคัดเลือก DNA ของ Hieff NGS™ ได้รับการเตรียมขึ้นโดยยึดตามหลักการ SPRI (Solid Phase Reverse Immobilization) และสามารถใช้สำหรับการทำให้บริสุทธิ์ DNA และการเลือกขนาดในระหว่างการเตรียมไลบรารีการจัดลำดับรุ่นถัดไป (NGS) ลูกปัดคัดเลือก DNA ของ Hieff NGS™ สามารถใช้งานร่วมกับชุดเตรียมไลบรารี DNA และ RNA ต่างๆ ได้ และเป็นทางเลือกที่ดี ลูกปัด AMPure-

ส่วนประกอบ

ส่วนประกอบ หมายเลข ชื่อ 12601ES08 12601ES56 12601ES75
12601 ลูกปัดคัดแยก DNA Hieff NGS™ 5 มล. 60 มล. 450 มล.

ข้อมูลจำเพาะ

สายผลิตภัณฑ์ DNA สะอาดและคัดเลือกลูกปัด
วัสดุเริ่มต้น ดีเอ็นเอ
ความเข้ากันได้ ดีเอ็นเอ
เทคโนโลยีการแยกตัว ลูกปัดแม่เหล็ก
ประเภทผลิตภัณฑ์ขั้นสุดท้าย ดีเอ็นเอ
สำหรับใช้กับ (แอปพลิเคชั่น) การเลือกขนาด DNA

การขนส่งและการเก็บรักษา

ลูกปัดจะถูกจัดส่งพร้อมกับถุงน้ำแข็งและสามารถเก็บไว้ที่อุณหภูมิ 2°C-8°C ได้นานหนึ่งปี

คำแนะนำ

  • 1. การเตรียมพร้อม

ให้ปรับสมดุลลูกปัดคัดแยกที่อุณหภูมิห้องเป็นเวลาอย่างน้อย 30 นาที ก่อนใช้งาน

  • 2. การเลือกขนาด DNA

ขั้นตอนการดำเนินการเลือกขนาดแสดงอยู่ในรูปที่ 1 และโปรโตคอลเป็นดังต่อไปนี้

รูปที่ 1 แผนผังขั้นตอนการเลือกขนาด DNA

2.1 ผสมลูกปัดให้เข้ากันด้วยการเขย่าหรือปิเปตขึ้นลงทุกครั้งก่อนใช้งาน
2.2 เติมลูกปัดคัดเลือกรอบแรกลงในตัวอย่าง (ดูตารางที่ 1) ผสมให้เข้ากันโดยใช้เครื่องวอร์เท็กซ์หรือปิเปตขึ้นลงอย่างน้อย 10 ครั้ง
2.3 ฟักที่อุณหภูมิห้องเป็นเวลา 5 นาที
2.4 หมุนหลอดลงสักครู่แล้ววางบนฐานแม่เหล็ก เมื่อสารละลายใส (ประมาณ 5 นาที) ให้ย้ายส่วนที่เป็นของเหลวใสกว่าลงในหลอด PCR หลอดใหม่
2.5 เติมลูกปัดคัดรอบที่ 2 ลงในตัวอย่างจากขั้นตอน 2.4 ตามตารางที่ 1 ผสมให้เข้ากันโดยใช้การเขย่าหรือปิเปตขึ้นและลงอย่างน้อย 10 ครั้ง
2.6 ฟักที่อุณหภูมิห้องเป็นเวลา 5 นาที
2.7 หมุนหลอดลงสักครู่แล้ววางบนฐานแม่เหล็ก เมื่อสารละลายใส (ประมาณ 5 นาที) ให้ดูดของเหลวส่วนบนออกแล้วทิ้งไป
2.8 วางหลอดทดลองบนฐานแม่เหล็ก แล้วเติมเอธานอล 80% ที่เตรียมใหม่ 200 μL ลงไปโดยไม่รบกวนลูกปัด ฟักที่อุณหภูมิห้องเป็นเวลา 30 วินาที ดูดเอธานอลออกแล้วทิ้งไป
2.9 ทำซ้ำขั้นตอน 2.8 หนึ่งครั้งเพื่อซักรวมสองครั้ง
2.10 กำจัดเอธานอลที่เหลือด้วยปลายปิเปตขนาด 10 µL วางหลอดทดลองบนขาตั้งแม่เหล็ก ปล่อยให้ลูกปัดที่เลือกแห้งโดยเปิดฝาทิ้งไว้จนกระทั่งมีรอยแตกร้าวปรากฏขึ้น (ประมาณ 5 นาที)
หมายเหตุ: อย่าทำให้ลูกปัดที่เลือกแห้งเกินไป เพราะอาจทำให้เป้าหมาย DNA ที่ได้รับการฟื้นฟูลดลง
2.11 ถอดหลอดออกจากฐานแม่เหล็ก เติม ddH2O (≥20 µL) ในปริมาณที่เหมาะสม และผสมให้เข้ากันโดยใช้เครื่องวอร์เท็กซ์หรือปิเปตขึ้นลงอย่างน้อย 10 ครั้ง
2.12 ฟักที่อุณหภูมิห้องเป็นเวลา 5 นาที
หมุนหลอดลงสักครู่แล้ววางบนฐานแม่เหล็ก เมื่อสารละลายใส (ประมาณ 5 นาที) ให้ถ่ายของเหลวส่วนบน 20 μL ลงในหลอดใหม่

  • 3.เงื่อนไขที่แนะนำสำหรับการเลือกขนาด DNA

ดีเอ็นเอจากต่อมไทมัสของลูกวัวถูกแบ่งส่วนโดยใช้คลื่นเสียงความถี่สูงเพื่อเตรียมชิ้นส่วนขนาด 100-1,000 คู่เบส และทำการคัดเลือกขนาดสองรอบตามตารางที่ 1 จากนั้นวิเคราะห์ผลลัพธ์โดยใช้เครื่อง Agilent 2100 Bioanalyzer (รูปที่ 2)

ตารางที่ 1 เงื่อนไขที่แนะนำสำหรับการเลือกขนาด DNA

ความยาวของชิ้นส่วน DNA 250-350 บ. 320-420 บ. 450-550 บ. 550-700 บ. 700-900 บ. 800-1,000 คู่
อัตราส่วนของลูกปัด: ดีเอ็นเอรอบที่ 1 0.80× 0.70× 0.60× 0.55× 0.50× 0.45×
อัตราส่วนของลูกปัด: ดีเอ็นเอสำหรับครั้งที่ 2 กลม 0.20× 0.20× 0.20× 0.15× 0.15× 0.15×

หมายเหตุ: "×" ในตารางระบุปริมาตรของตัวอย่าง DNA ตัวอย่างเช่น หากความยาวของส่วนที่แทรกในคลังข้อมูลคือ 250 bp และปริมาตรของตัวอย่าง DNA คือ 100 μL ปริมาตรของลูกปัดแม่เหล็กที่ใช้ในการคัดแยกรอบแรกคือ 0.80×100 μL=80 μL ปริมาตรของลูกปัดแม่เหล็กที่ใช้ในการคัดแยกรอบที่สองคือ 0.20×100 μL=20 μL

รูปที่ 2 อิเล็กโทรเฟอโรแกรมของชิป DNA ความไวสูง Agilent 2100

หมายเหตุ:
1. เพื่อความปลอดภัยและสุขภาพของคุณ โปรดสวมเสื้อคลุมแล็บและถุงมือแบบใช้แล้วทิ้งขณะผ่าตัด

อ้างจาก "การรวมลำดับเฉพาะโดยตระกูล 1 casposase จาก Candidatus Nitrosopumilus koreensis AR1. กรดนิวคลีอิก Res. 2021;49(17):9938-9952. doi:10.1093/nar/gkab725"

อ้างจาก "การติดเชื้อ Wolbachia เมื่อไม่นานนี้ทำให้ชุมชนจุลินทรีย์ในประชากร Laodelphax striatellus ป่าเปลี่ยนแปลงไป Microbiome 2020;8(1):104 เผยแพร่เมื่อวันที่ 2 กรกฎาคม 2020 doi:10.1186/s40168-020-00878-x"

เอกสาร:

เอกสารข้อมูลความปลอดภัย
คู่มือการใช้งาน

การอ้างอิง & เอกสารอ้างอิง:

[1] Wang X, Yuan Q, Zhang W และคณะ การรวมลำดับเฉพาะโดยแฟมิลี 1 แคสโปเซสจาก Candidatus Nitrosopumilus koreensis AR1. กรดนิวคลีอิก Res. 2021;49(17):9938-9952. doi:10.1093/nar/gkab725(IF:16.971)

[2] Duan XZ, Sun JT, Wang LT และคณะ การติดเชื้อ Wolbachia เมื่อเร็ว ๆ นี้ทำให้ชุมชนจุลินทรีย์ในประชากร Laodelphax striatellus เปลี่ยนแปลงไป ไมโครไบโอม 2020;8(1):104 เผยแพร่เมื่อวันที่ 2 กรกฎาคม 2020 doi:10.1186/s40168-020-00878-x(IF:11.607)

[3] เพลง B, Almatrafi E, Sang F, และคณะการจัดการตะกอนที่ผ่านการบำบัดด้วยเฟนตันด้วยไบโอชาร์และปุ๋ยหมักมูลแกะ: ผลกระทบต่อลักษณะวิวัฒนาการของชุมชนแบคทีเรีย J Environ Manage 2022;316:115218 doi:10.1016/j.jenvman.2022.115218(IF:6.789)

[4] Huang C, Mei Q, Lou L และคณะ Ulcerative Colitis in Response to Fecal Microbiota Transplantation via Modulation of Gut Microbiota and Th17/Treg Cell Balance. Cells. 2022;11(11):1851. เผยแพร่เมื่อวันที่ 5 มิถุนายน 2022 doi:10.3390/cells11111851(IF:6.600)

[5] Ghosh S, Yang X, Wang L, Zhang C, Zhao L. การให้อาหารพรีไบโอติกแบบแอคทีฟเฟสทำให้จุลินทรีย์ในลำไส้เปลี่ยนแปลง กระตุ้นให้เกิดการบรรเทาภาวะไขมันเกาะตับและคอเลสเตอรอลในซีรั่มที่ไม่ขึ้นกับน้ำหนักในหนูที่ได้รับอาหารไขมันสูง Comput Struct Biotechnol J. 2020;19:448-458. เผยแพร่เมื่อวันที่ 24 ธันวาคม 2020 doi:10.1016/j.csbj.2020.12.011(IF:6.018)

[6] Gao X, Yu B, Yu J และคณะ Developmental Profiling of Dietary Carbohydrate Digestion in Piglets. Front Microbiol. 2022;13:896660. เผยแพร่เมื่อวันที่ 29 เมษายน 2022 doi:10.3389/fmicb.2022.896660(IF:5.640)

[7] Li P, Zhang Y, Yan F, Zhou X. ลักษณะของแบคทีเรียโฟจ vB_Kox_ZX8 ที่แยกได้จาก Klebsiella oxytoca ทางคลินิกและผลการรักษาต่อภาวะแบคทีเรียในกระแสเลือดของหนู Front Microbiol. 2021;12:763136. เผยแพร่เมื่อวันที่ 3 ธันวาคม 2021 doi:10.3389/fmicb.2021.763136(IF:5.640)

[8] Lin Z, Luo P, Huang D, Wu Y, Li F, Liu H. กลยุทธ์ที่ใช้มัลติโอมิกส์สำหรับการวิเคราะห์ความเป็นพิษของอะคริลาไมด์ในแบบจำลอง Saccharomyces cerevisiae Chem Biol Interact 2021;349:109682 doi:10.1016/j.cbi.2021.109682(IF:5.194)

[9] ซัน X, Lv W, วัง Y และคณะ ยีน Mrgprb2 มีบทบาทในปฏิกิริยาแอนาฟิแลคตอยด์ที่เกิดจากการฉีด Houttuynia cordata เจ เอทโนฟาร์มาคอล. 2022;289:115053. ดอย:10.1016/j.jep.2022.115053(IF:4.360)

[10] Ma H, Lai B, Zan C, Di X, Zhu X, Wang K. GLO1 มีส่วนสนับสนุนต่อการดื้อยาของ Escherichia coli ผ่านการเหนี่ยวนำให้เกิด β-Lactamases สเปกตรัมขยายประเภท PER Infect Drug Resist. 2022;15:1573-1586. เผยแพร่เมื่อวันที่ 5 เมษายน 2022 doi:10.2147/IDR.S358578(IF:4.003)

[11] Zhong Y, Zhao W, Tang Z และคณะ การวิเคราะห์ทรานสคริปโตมิกส์เชิงเปรียบเทียบของระยะการพัฒนาที่แตกต่างกันของรังไข่ในกุ้งน้ำจืดหนองแดง Procambarus clarkii BMC Genomics 2021;22(1):199 เผยแพร่เมื่อวันที่ 21 มีนาคม 2021 doi:10.1186/s12864-021-07537-x(IF:3.969)

[12] Lian C, Yang H, Lan J และคณะ การวิเคราะห์เปรียบเทียบจีโนมคลอโรพลาสต์เผยให้เห็นความสัมพันธ์เชิงวิวัฒนาการและความหลากหลายภายในสายพันธุ์ในพืชสมุนไพร Isodon rubescens PLoS One 2022;17(4):e0266546 เผยแพร่เมื่อวันที่ 6 เมษายน 2022 doi:10.1371/journal.pone.0266546(IF:3.240)

(13) Diao G, Huang J, Zheng X และคณะ พรอสตาแกลนดิน E2 ทำหน้าที่สองอย่างในการควบคุมการเคลื่อนที่ของเซลล์เดนไดรต์ Int J Mol Med. 2021;47(1):207-218. doi:10.3892/ijmm.2020.4801(IF:3.098)

[14] Bing XL, Zhao DS, Peng CW, Huang HJ, Hong XY. ความคล้ายคลึงและการเปลี่ยนแปลงเชิงพื้นที่ของชุมชนแบคทีเรียและเชื้อราในประชากรเพลี้ยกระโดดในนาข้าว (Hemiptera: Delphacidae) Insect Sci. 2020;27(5):947-963. doi:10.1111/1744-7917.12782(IF:2.791)

[15] Li X, Zhou S, Zhang J, Zhou Z, Xiong Q. Directional Changes in the Intestinal Bacterial Community in Black Soldier Fly (Hermetia illucens) Larvae. Animals (Basel). 2021;11(12):3475. เผยแพร่เมื่อวันที่ 6 ธันวาคม 2021 doi:10.3390/ani11123475(IF:2.752)

[16] Yang J, Peng Y, Kong W. การระบุและลำดับจีโนมที่สมบูรณ์ของไวรัสมัลเบอร์รี่คริปติก 1 Arch Virol. 2022;167(2):687-690. doi:10.1007/s00705-021-05350-1(IF:2.574)

[17] Chang Y, Xia X, Sui L และคณะ การตั้งอาณานิคมของเชื้อราก่อโรคในแมลงแบบเอ็นโดไฟต์ช่วยเพิ่มความต้านทานโรคพืชโดยการเปลี่ยนแปลงชุมชนแบคทีเรียในเอ็นโดไฟต์ J Basic Microbiol. 2021;61(12):1098-1112. doi:101002/งานม.202100494(IF:2.281)

[18] Ding CY, Ma YM, Li B และคณะ การระบุและวิเคราะห์การทำงานของยีนที่แสดงออกแตกต่างกันใน Myzus persicae (Hemiptera: Aphididae) ในการตอบสนองต่อ Trans-anethole J Insect Sci. 2022;22(1):3. doi:10.1093/jisesa/ieab094(IF:1.857)

Storage

This product should be stored at 2~8℃ for 18 months.

FAQ

It can purify DNA fragments of 150bp or longer. If the purified DNA contains a large amount of fragments shorter than 150bp, please use product number 12600, which can purify DNA fragments of 50bp or longer.
You need to figure out the system on your own. The currently selected system for the selected fragments is the one described in the manual. For other fragment selections, you can refer to the selection system in the manual for adjustment.
It is not recommended to freeze for a long time, as the low temperature will damage the structure of the magnetic beads. Freezing and thawing once for NGS library sorting and purification does not significantly affect the performance for a short period of time. However, the actual result should be based on specific test results.
Keeping the magnetic beads at room temperature may have some impact on their recovery performance. It is not recommended to leave them at room temperature for too long. After use, it is advisable to store them at 4℃. The separation effect of PEG is easily affected by factors such as pH and temperature.
The DNA sorting and purification magnetic beads are based on a technology called Solid Phase Reversible Immobilization (SPRI). The buffer of the magnetic beads generally contains: magnetic beads, DNA, PEG, salt ions (mainly Na+), etc. Under the action of PEG and NaCl, the DNA molecules will undergo dehydration condensation, resulting in a change in DNA conformation and aggregation precipitation. The negatively charged ones can be eluted from the bound DNA molecules when using buffer solutions without enzymes or TE (low salt and low PEG content).
Under different PEG and salt ion concentrations, the conformations of different lengths of DNA are different. Moreover, longer DNA fragments carry more negative charges, so magnetic beads generally preferentially adsorb long DNA fragments. Sorting usually requires two rounds of magnetic bead separation. In the first round, magnetic beads bind to the DNA of larger molecular weight, and this part of the product is removed by discarding the magnetic beads. At this time, the target-sized DNA is in the supernatant; in the second round, magnetic beads bind to the larger molecular weight DNA in the remaining products, and the smaller molecular weight DNA is removed by discarding the supernatant. At this point, the target-sized DNA is on the magnetic beads, and through two rounds of magnetic bead separation, the sorting goal is achieved.
It is not recommended to use 12601. Instead, 12600 should be used. The minimum fragment that can be recovered is about 100bp. The recovery rate of 50bp or above may be affected.
 Magnetic beads can adsorb both double-stranded DNA and single-stranded DNA, but they cannot distinguish between single-stranded or double-stranded DNA. The number of times single-stranded DNA can be purified by the magnetic beads can be referred to in the manual for double-stranded DNA.
12601ES is a non-specific adsorption magnetic bead that can also bind to RNA. If you want to remove RNA, you need to treat it with RNase A.
It is not recommended to use it. Although magnetic beads can also adsorb RNA fragments, the magnetic bead buffer is designed based on DNA characteristics and is not conducive to the stability of RNA structure. For RNA purification, it is recommended to use RNA purification magnetic beads (item number 12602ES).
1) The magnetic beads and DNA were not thoroughly mixed, resulting in insufficient adsorption. It is recommended to ensure thorough mixing of the reaction system.
2) The proportion of magnetic beads is incorrect. It is recommended to select the appropriate proportion according to the instructions.
3) The incubation time is insufficient. Ensure that the incubation time is at least 5 minutes.
4) During magnetic bead separation, when the two wheels perform magnetic bead adsorption, the magnetic beads are collected. A 10 μL pipette can be connected in series before the 200 μL pipette for liquid transfer, which can prevent the collection of magnetic beads.
5) During the magnetic bead washing process, the ethanol solution was not prepared freshly, resulting in an insufficiently high ethanol concentration. It is recommended that the ethanol concentration be no less than 70%, and for small fragments, it should be no less than 80%.
6) Excessive drying: If the magnetic beads are dried for too long, the surface will crack, making it difficult to elute the DNA and resulting in a decrease in yield. It is recommended that the drying time should not be too long; the moment the surface begins to crack, drying should be stopped.
7) Insufficient volume of elution solution: The final elution solution should completely cover the magnetic beads within the tube.
8) Sample reasons: The sample purity is low and contains impurities. When there are a large amount of impurities in the sample, it may cause the magnetic beads to aggregate and harden, resulting in insufficient elution. Using a pipette, try to blow the magnetic beads apart as much as possible, extend the elution time, and increase the product recovery rate. If there are many large fragments in the sample, the large fragments will cause the magnetic beads to aggregate. During elution, you can prolong the time or, if necessary, incubate at 37 degrees to improve the yield.

Citations

Applications

คุณอาจชอบ

การสอบถาม

คำถามที่พบบ่อย

ผลิตภัณฑ์นี้มีวัตถุประสงค์เพื่อการวิจัยเท่านั้น และไม่ได้มีวัตถุประสงค์เพื่อใช้ในการรักษาหรือวินิจฉัยโรคในมนุษย์หรือสัตว์ ผลิตภัณฑ์และเนื้อหาได้รับการคุ้มครองโดยสิทธิบัตร เครื่องหมายการค้า และลิขสิทธิ์ที่เป็นของ Yeasen เทคโนโลยีชีวภาพ สัญลักษณ์เครื่องหมายการค้าระบุประเทศต้นกำเนิด ไม่จำเป็นต้องจดทะเบียนในทุกภูมิภาค

แอปพลิเคชั่นบางตัวอาจต้องใช้สิทธิ์ในทรัพย์สินทางปัญญาของบุคคลที่สามเพิ่มเติม

Yeasen มุ่งมั่นเพื่อวิทยาศาสตร์ที่มีจริยธรรม โดยเชื่อว่าการวิจัยของเราควรจะตอบคำถามสำคัญในขณะเดียวกันก็ต้องรับประกันความปลอดภัยและมาตรฐานทางจริยธรรม