현대 유전체학에서는 복잡한 샘플에서 정확하고 의미 있는 정보를 추출하는 것이 매우 중요합니다. 종양 돌연변이, 유전 질환, 병원균 또는 육종 형질 등 어떤 분야를 연구하든, 라이브러리 준비의 품질이 결과의 신뢰성을 결정합니다.
기존의 라이브러리 준비는 종종 정밀성, 속도, 확장성 간의 타협을 요구합니다. 효소 단편화 기반 키트는 고성능과 간편성, 그리고 유연성을 결합하여 더 나은 솔루션을 제공합니다. Yeasen의 효소 단편화 DNA 라이브러리 준비 키트는 다양한 연구 분야의 요구를 충족하도록 설계되어 더 빠르고, 더 정확하며, 재현 가능한 결과를 제공합니다.
감염병 위협에 대한 신속한 대응
새롭게 출현하는 병원균과 재발하는 병원균은 빠르고 정확한 검출 방법을 요구합니다. Yeasen의 키트는 다음과 같은 기능을 제공합니다.
- 2시간 이내에 도서관 준비 완료
- 10분 1개 튜브 파편화 + 끝단 수리 + A-테일링
- 저농도 미생물 DNA에 대한 높은 민감도(LOD ≤ 100 pg)
- 호스트 DNA 오염을 최소화하는 매우 깨끗한 워크플로
그림 1. 삽입 DNA 및 미생물 검출에 대한 mNGS 데이터 성능
라이브러리는 Flash OnePot DNA 라이브러리 키트(Cat#12316)를 사용하여 ZymoBIOMICS 미생물 DNA 표준(Cat# D6306) 10ng을 사용하여 준비했습니다. 라이브러리를 풀링하여 Illumina MiSeq(2×150bp)에서 시퀀싱했습니다. 검출된 미생물 조성은 예상 비율과 거의 일치했습니다. 예상 조성: Cryptococcus neoformans 2%, Saccharomyces cerevisiae 2%, Bacillus subtilis 12%, Escherichia coli 12%, Enterococcus faecalis 12%, Lactobacillus fermentum 12%, Listeria monocytogenes 12%, Pseudomonas aeruginosa 12%, Staphylococcus aureus 12%, Salmonella enterica 12%.
고감도로 유전 질환 해독
단일 유전자 및 복합 질환은 균일한 표적 범위와 신뢰할 수 있는 변이 검출을 필요로 합니다. 이 키트는 다음을 제공합니다.
- GC가 풍부하고 시퀀싱하기 어려운 영역에서 일관된 적용 범위
- 저입력 DNA에서 정확한 SNP/indel 감지
- 최소 100 pg의 입력과 호환 가능
그림 2. NIPT 응용 분야에서 효율적인 cfDNA 라이브러리 준비 및 고품질 시퀀싱 성능
정밀 종양학 강화
암 유전체학은 저주파 돌연변이와 CNV의 초고감도 검출을 요구합니다. Yeasen의 효소 전처리 키트는 다음과 같은 기능을 제공합니다.
- 낮은 VAF 돌연변이의 신뢰할 수 있는 감지(최소 0.1%)
- 균일한 전체 게놈 커버리지를 통한 우수한 CNV 감지
- 정확한 종양 이질성 분석을 위한 최소화된 증폭 편향
그림 3. 종양 SNV gDNA 표준을 사용한 하이브리드 캡처 시퀀싱 성능 비교
표적 하이브리드 캡처 라이브러리는 Cancer SLC 패널을 사용하여 종양 SNV 5% gDNA 표준물질(GW-OGTM006) 100 ng과 야생형 종양 gDNA 표준물질(GW-OGTM005)을 이용하여 제조하였다. 6개의 하위 라이브러리를 캡처를 위해 풀링(6-plex)하고, 각 하위 라이브러리당 6 Gb씩 시퀀싱하였다. PCR 증폭은 7 사이클로 수행하였다.
Yeasen Lib prep 키트는 W*와 유사한 적중률과 커버리지 깊이를 보였습니다. 특히, Yeasen 키트는 0.5% 및 0.1% 대립유전자 빈도에서 모든 변이체를 탈락 없이 검출한 반면, W*는 0.1% VAF에서 G719S 변이체를 검출하지 못했습니다.
농업 및 가축 사육 강화
식물과 동물의 유전체는 크기가 크거나, 배수체이거나, 반복적일 수 있어 여러 전처리 방법에 어려움을 겪습니다. Yeasen 키트는 다음을 지원합니다.
- 광범위한 샘플 호환성 : 복잡한 게놈 전반에 걸친 균일한 단편화
- SNP 발견 및 유전자형 분석을 위한 고품질 라이브러리
- 낮은 DNA 입력 호환성(초기 단계 또는 희귀 샘플에 이상적)
그림 4. 12972를 사용한 종 전체의 일관된 라이브러리 품질 및 우수한 WGS 성능
여러 종의 DNA 샘플을 동일한 조건에서 12972를 사용하여 단편화했습니다. 생성된 라이브러리는 일관된 단편 크기(~450 bp 또는 ~320 bp)를 나타내어 종 전체에서 우수한 균일성을 나타냈습니다. 인간과 소 샘플의 10배 전체 유전체 시퀀싱(WGS)에서 12972는 공급업체 W*보다 더 높은 유전자 커버리지를 달성했으며, 거짓 키메라 비율과 헤어핀 아티팩트는 더 낮거나 유사했습니다.
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