Hieff Ngs ™ DNA Seleksi Manik -manik Superior Ampure XP Alternatif _ 12601es
Hieff Ngs ™ DNA Seleksi Manik -manik Superior Ampure XP Alternatif _ 12601es
Hieff Ngs ™ DNA Seleksi Manik -manik Superior Ampure XP Alternatif _ 12601es
Gulung gambar untuk memperbesar Klik gambar untuk memperbesar
Hieff Ngs ™ DNA Seleksi Manik -manik Superior Ampure XP Alternatif _ 12601esHieff Ngs ™ DNA Seleksi Manik -manik Superior Ampure XP Alternatif _ 12601esHieff Ngs ™ DNA Seleksi Manik -manik Superior Ampure XP Alternatif _ 12601es
Hieff Ngs ™ DNA Seleksi Manik -manik Superior Ampure XP Alternatif _ 12601es
Hieff NGS™ DNA Selection Beads disiapkan berdasarkan prinsip SPRI (Solid Phase Reverse Immobilisasi) dan dapat digunakan untuk pemurnian DNA dan pemilihan ukuran selama persiapan pustaka sequencing generasi berikutnya (NGS). Hieff NGS™ DNA Selection Beads kompatibel dengan berbagai kit persiapan pustaka DNA dan RNA dan merupakan alternatif yang baik untuk Manik-manik AMPure. Komponen Komponen No. Nama nomor telepon 12601ES08 12601ES56 12601ES75 12601 Manik-manik Seleksi DNA Hieff NGS™ 5 ml air 60 ml air 450 ml air Spesifikasi Lini Produk Pembersihan dan pemilihan DNA Manik-manik Bahan Awal DNA Kesesuaian DNA Teknologi Isolasi...

Frequently Bought Together

Hieff Ngs ™ DNA Seleksi Manik -manik Superior Ampure XP Alternatif _ 12601es

YeasenSKU: 12601ES03
Ukuran: 1mL
Harga:
$35.00
Saham:
Dalam stok

Hieff NGS™ DNA Selection Beads disiapkan berdasarkan prinsip SPRI (Solid Phase Reverse Immobilisasi) dan dapat digunakan untuk pemurnian DNA dan pemilihan ukuran selama persiapan pustaka sequencing generasi berikutnya (NGS). Hieff NGS™ DNA Selection Beads kompatibel dengan berbagai kit persiapan pustaka DNA dan RNA dan merupakan alternatif yang baik untuk Manik-manik AMPure.

Komponen

Komponen No. Nama nomor telepon 12601ES08 12601ES56 12601ES75
12601 Manik-manik Seleksi DNA Hieff NGS™ 5 ml air 60 ml air 450 ml air

Spesifikasi

Lini Produk Pembersihan dan pemilihan DNA Manik-manik
Bahan Awal DNA
Kesesuaian DNA
Teknologi Isolasi Manik Magnetik
Jenis Produk Akhir DNA
Untuk Digunakan Dengan (Aplikasi) Pembersihan DNA, pemilihan ukuran DNA

Pengiriman dan Penyimpanan

Manik-manik tersebut dikirim dengan bungkusan es dan dapat disimpan pada suhu 2°C-8°C selama satu tahun.

Instruksi

  • 1. Persiapan

Seimbangkan manik-manik seleksi pada suhu ruangan setidaknya 30 menit sebelum digunakan.

  • 2. Pemilihan Ukuran DNA

Alur operasi pemilihan ukuran ditunjukkan pada Gambar 1 dan protokolnya adalah sebagai berikut.

Gambar 1. Diagram Alir Pemilihan Ukuran DNA

2.1 Aduk manik-manik secara menyeluruh dengan cara memutarnya atau memipetnya ke atas dan ke bawah setiap kali sebelum digunakan.
2.2 Tambahkan putaran pertama manik-manik seleksi ke dalam sampel (lihat Tabel 1). Aduk hingga merata dengan cara memutar atau memipet ke atas dan ke bawah setidaknya 10 kali.
2.3 Inkubasi pada suhu ruangan selama 5 menit.
2.4 Putar tabung reaksi sebentar dan letakkan pada dudukan magnet. Bila larutan sudah bening (sekitar 5 menit), pindahkan supernatan ke tabung PCR baru.
2.5 Tambahkan putaran kedua manik-manik seleksi ke sampel dari langkah 2.4 sesuai dengan Tabel 1. Aduk rata dengan cara memutar atau memipet ke atas dan ke bawah setidaknya 10 kali.
2.6 Inkubasi pada suhu ruangan selama 5 menit.
2.7 Putar tabung sebentar dan letakkan pada dudukan magnet. Bila larutan sudah bening (sekitar 5 menit), aspirasikan cairan supernatan dan buang.
2.8 Simpan tabung pada dudukan magnet dan tambahkan 200 μL etanol 80% yang baru disiapkan tanpa mengganggu manik-manik, inkubasi pada suhu ruangan selama 30 detik. Aspirasi etanol dan buang.
2.9 Ulangi langkah 2.8 satu kali untuk total dua kali pencucian.
2.10 Buang sisa etanol dengan ujung pipet 10 µL. Simpan tabung di dudukan magnet, keringkan manik-manik seleksi dengan tutup terbuka hingga retakan muncul (sekitar 5 menit).
Catatan: Jangan terlalu mengeringkan manik-manik seleksi. Ini dapat mengakibatkan target DNA pemulihan yang lebih rendah.
2.11 Keluarkan tabung dari dudukan magnet. Tambahkan ddH2O dalam jumlah yang sesuai (≥20 µL) dan aduk hingga merata dengan cara memutar atau memipet ke atas dan ke bawah setidaknya 10 kali.
2.12 Inkubasi pada suhu ruangan selama 5 menit.
Putar tabung sebentar dan letakkan pada dudukan magnet. Bila larutan sudah bening (sekitar 5 menit), pindahkan 20 μL supernatan ke tabung baru.

  • 3.Kondisi yang Direkomendasikan untuk Pemilihan Ukuran DNA

DNA kelenjar timus sapi difragmentasi dengan sonikasi untuk menyiapkan fragmen berukuran 100-1.000 bp, dan dilakukan dua putaran pemilihan ukuran sesuai Tabel 1. Hasilnya dianalisis menggunakan Agilent 2100 Bioanalyzer (Gambar 2).

Tabel 1. Kondisi yang direkomendasikan untuk pemilihan ukuran DNA

Panjang fragmen DNA 250-350bp 320-420bp 450-550bp 550-700bp 700-900bp 800-1.000bp
Rasio Manik-manik: DNA untuk Putaran Pertama 0,80× 0,70 kali 0,60× 0,55 kali 0,50 kali 0,45x
Rasio Manik-manik: DNA untuk ke 2 Bulat 0,20× 0,20× 0,20× 0,15× 0,15× 0,15×

Catatan: "×" dalam tabel menunjukkan volume sampel DNA. Misalnya, jika panjang sisipan pustaka adalah 250 bp dan volume sampel DNA adalah 100 μL, volume manik magnetik yang digunakan dalam putaran pertama penyortiran adalah 0,80×100 μL=80 μL; volume manik magnetik yang digunakan dalam putaran kedua penyortiran adalah 0,20×100 μL=20 μL.

Gambar 2. Elektroforogram chip DNA sensitivitas tinggi Agilent 2100

Catatan:
1. Demi keselamatan dan kesehatan Anda, harap kenakan jas lab dan sarung tangan sekali pakai saat beroperasi.

Dikutip dari "Integrasi spesifik urutan oleh keluarga 1 casposase dari Candidatus Nitrosopumilus koreensis AR1. Jurnal Asam Nukleat 2021;49(17):9938-9952. doi:10.1093/nar/gkab725"

Dikutip dari "Infeksi Wolbachia baru-baru ini mengubah komunitas mikroba pada populasi Laodelphax striatellus liar. Mikrobioma. 2020;8(1):104. Diterbitkan 2 Juli 2020. doi:10.1186/s40168-020-00878-x"

Dokumen:
Kutipan & Referensi:

[1] Wang X, Yuan Q, Zhang W, et al. Integrasi spesifik urutan oleh casposase keluarga 1 dari Candidatus Nitrosopumilus koreensis AR1. Jurnal Asam Nukleat 2021;49(17):9938-9952. doi:10.1093/nar/gkab725(IF:16.971)

[2] Duan XZ, Sun JT, Wang LT, dkk. Infeksi terkini oleh Wolbachia mengubah komunitas mikroba pada populasi Laodelphax striatellus liar. Mikrobioma. 2020;8(1):104. Diterbitkan 2 Juli 2020. doi:10.1186/s40168-020-00878-x(IF:11.607)

[3] Lagu B, Almatrafi E, Sang F, dkk.Pengelolaan sedimen yang diolah Fenton dengan biochar dan kompos kotoran domba: Dampaknya terhadap karakteristik evolusi komunitas bakteri. J Environ Manage. 2022;316:115218. doi:10.1016/j.jenvman.2022.115218(IF:6.789)

[4] Huang C, Mei Q, Lou L, dkk. Kolitis Ulseratif sebagai Respon terhadap Transplantasi Mikrobiota Feses melalui Modulasi Mikrobiota Usus dan Keseimbangan Sel Th17/Treg. Sel. 2022;11(11):1851. Diterbitkan 5 Juni 2022. doi:10.3390/cells11111851(IF:6.600)

[5] Ghosh S, Yang X, Wang L, Zhang C, Zhao L. Pemberian prebiotik fase aktif mengubah mikrobiota usus, menginduksi pengurangan steatosis hati dan kolesterol serum yang tidak bergantung pada berat badan pada tikus yang diberi diet tinggi lemak. Comput Struct Biotechnol J. 2020;19:448-458. Diterbitkan 24 Desember 2020. doi:10.1016/j.csbj.2020.12.011(IF:6.018)

[6] Gao X, Yu B, Yu J, dkk. Profil Perkembangan Pencernaan Karbohidrat Makanan pada Anak Babi. Front Microbiol. 2022;13:896660. Diterbitkan 29 April 2022. doi:10.3389/fmicb.2022.896660(IF:5.640)

[7] Li P, Zhang Y, Yan F, Zhou X. Karakteristik Bakteriofag, vB_Kox_ZX8, yang Diisolasi dari Klebsiella oxytoca Klinis dan Efek Terapinya pada Bakteremia Tikus. Front Microbiol. 2021;12:763136. Diterbitkan 3 Desember 2021. doi:10.3389/fmicb.2021.763136(IF:5.640)

[8] Lin Z, Luo P, Huang D, Wu Y, Li F, Liu H. Strategi berbasis multi-omik untuk analisis toksisitas akrilamida dalam model Saccharomyces cerevisiae. Chem Biol Interact. 2021;349:109682. doi:10.1016/j.cbi.2021.109682(IF:5.194)

[9] Sun X, Lv W, Wang Y, dkk. Gen Mrgprb2 berperan dalam reaksi anafilaktoid yang disebabkan oleh injeksi Houttuynia cordata. J Etnofarmakol. 2022;289:115053. doi:10.1016/j.jep.2022.115053(IF:4.360)

[10] Ma H, Lai B, Zan C, Di X, Zhu X, Wang K. GLO1 Berkontribusi pada Resistensi Obat Escherichia coli Melalui Induksi β-Laktamase Spektrum Luas Tipe PER. Infect Drug Resist. 2022;15:1573-1586. Diterbitkan 5 April 2022. doi:10.2147/IDR.S358578(IF:4.003)

[11] Zhong Y, Zhao W, Tang Z, dkk. Analisis transkriptomik komparatif dari berbagai tahap perkembangan ovarium pada udang karang rawa merah Procambarus clarkii. BMC Genomics. 2021;22(1):199. Diterbitkan 21 Maret 2021. doi:10.1186/s12864-021-07537-x(IF:3.969)

[12] Lian C, Yang H, Lan J, dkk. Analisis komparatif genom kloroplas mengungkap hubungan filogenetik dan variasi intraspesifik pada tanaman obat Isodon rubescens. PLoS One. 2022;17(4):e0266546. Diterbitkan 6 April 2022. doi:10.1371/journal.pone.0266546(IF:3.240)

[13] Diao G, Huang J, Zheng X, dkk. Prostaglandin E2 memiliki peran ganda dalam mengatur migrasi sel dendritik. Int J Mol Med. 2021;47(1):207-218. doi:10.3892/ijmm.2020.4801(IF:3.098)

[14] Bing XL, Zhao DS, Peng CW, Huang HJ, Hong XY. Kesamaan dan variasi spasial komunitas bakteri dan jamur pada populasi wereng padi sawah (Hemiptera: Delphacidae). Insect Sci. 2020;27(5):947-963. doi:10.1111/1744-7917.12782(IF:2.791)

[15] Li X, Zhou S, Zhang J, Zhou Z, Xiong Q. Perubahan Arah dalam Komunitas Bakteri Usus pada Larva Lalat Tentara Hitam (Hermetia illucens). Hewan (Basel). 2021;11(12):3475. Diterbitkan 6 Desember 2021. doi:10.3390/ani11123475(IF:2.752)

[16] Yang J, Peng Y, Kong W. Identifikasi dan urutan genom lengkap virus kriptik mulberry 1. Arch Virol. 2022;167(2):687-690. doi:10.1007/s00705-021-05350-1(IF:2.574)

[17] Chang Y, Xia X, Sui L, dkk. Kolonisasi endofit pada jamur entomopatogen meningkatkan ketahanan tanaman terhadap penyakit dengan mengubah komunitas bakteri endofit. J Basic Microbiol. 2021;61(12):1098-1112. doi:10.1002/pekerjaanm.202100494(JIKA:2.281)

[18] Ding CY, Ma YM, Li B, dkk. Identifikasi dan Analisis Fungsional Gen yang Diekspresikan Secara Berbeda di Myzus persicae (Hemiptera: Aphididae) sebagai Respon terhadap Trans-anethole. J Insect Sci. 2022;22(1):3. doi:10.1093/jisesa/ieab094(IF:1.857)

Storage

This product should be stored at 2~8℃ for 18 months.

FAQ

It can purify DNA fragments of 150bp or longer. If the purified DNA contains a large amount of fragments shorter than 150bp, please use product number 12600, which can purify DNA fragments of 50bp or longer.
You need to figure out the system on your own. The currently selected system for the selected fragments is the one described in the manual. For other fragment selections, you can refer to the selection system in the manual for adjustment.
It is not recommended to freeze for a long time, as the low temperature will damage the structure of the magnetic beads. Freezing and thawing once for NGS library sorting and purification does not significantly affect the performance for a short period of time. However, the actual result should be based on specific test results.
Keeping the magnetic beads at room temperature may have some impact on their recovery performance. It is not recommended to leave them at room temperature for too long. After use, it is advisable to store them at 4℃. The separation effect of PEG is easily affected by factors such as pH and temperature.
The DNA sorting and purification magnetic beads are based on a technology called Solid Phase Reversible Immobilization (SPRI). The buffer of the magnetic beads generally contains: magnetic beads, DNA, PEG, salt ions (mainly Na+), etc. Under the action of PEG and NaCl, the DNA molecules will undergo dehydration condensation, resulting in a change in DNA conformation and aggregation precipitation. The negatively charged ones can be eluted from the bound DNA molecules when using buffer solutions without enzymes or TE (low salt and low PEG content).
Under different PEG and salt ion concentrations, the conformations of different lengths of DNA are different. Moreover, longer DNA fragments carry more negative charges, so magnetic beads generally preferentially adsorb long DNA fragments. Sorting usually requires two rounds of magnetic bead separation. In the first round, magnetic beads bind to the DNA of larger molecular weight, and this part of the product is removed by discarding the magnetic beads. At this time, the target-sized DNA is in the supernatant; in the second round, magnetic beads bind to the larger molecular weight DNA in the remaining products, and the smaller molecular weight DNA is removed by discarding the supernatant. At this point, the target-sized DNA is on the magnetic beads, and through two rounds of magnetic bead separation, the sorting goal is achieved.
It is not recommended to use 12601. Instead, 12600 should be used. The minimum fragment that can be recovered is about 100bp. The recovery rate of 50bp or above may be affected.
 Magnetic beads can adsorb both double-stranded DNA and single-stranded DNA, but they cannot distinguish between single-stranded or double-stranded DNA. The number of times single-stranded DNA can be purified by the magnetic beads can be referred to in the manual for double-stranded DNA.
12601ES is a non-specific adsorption magnetic bead that can also bind to RNA. If you want to remove RNA, you need to treat it with RNase A.
It is not recommended to use it. Although magnetic beads can also adsorb RNA fragments, the magnetic bead buffer is designed based on DNA characteristics and is not conducive to the stability of RNA structure. For RNA purification, it is recommended to use RNA purification magnetic beads (item number 12602ES).
1) The magnetic beads and DNA were not thoroughly mixed, resulting in insufficient adsorption. It is recommended to ensure thorough mixing of the reaction system.
2) The proportion of magnetic beads is incorrect. It is recommended to select the appropriate proportion according to the instructions.
3) The incubation time is insufficient. Ensure that the incubation time is at least 5 minutes.
4) During magnetic bead separation, when the two wheels perform magnetic bead adsorption, the magnetic beads are collected. A 10 μL pipette can be connected in series before the 200 μL pipette for liquid transfer, which can prevent the collection of magnetic beads.
5) During the magnetic bead washing process, the ethanol solution was not prepared freshly, resulting in an insufficiently high ethanol concentration. It is recommended that the ethanol concentration be no less than 70%, and for small fragments, it should be no less than 80%.
6) Excessive drying: If the magnetic beads are dried for too long, the surface will crack, making it difficult to elute the DNA and resulting in a decrease in yield. It is recommended that the drying time should not be too long; the moment the surface begins to crack, drying should be stopped.
7) Insufficient volume of elution solution: The final elution solution should completely cover the magnetic beads within the tube.
8) Sample reasons: The sample purity is low and contains impurities. When there are a large amount of impurities in the sample, it may cause the magnetic beads to aggregate and harden, resulting in insufficient elution. Using a pipette, try to blow the magnetic beads apart as much as possible, extend the elution time, and increase the product recovery rate. If there are many large fragments in the sample, the large fragments will cause the magnetic beads to aggregate. During elution, you can prolong the time or, if necessary, incubate at 37 degrees to improve the yield.

Citations

Documents

Brochure
Magnetic_Beads_for_DNA_RNA_and_mRNA_Enrichment.pdf

Applications

Anda mungkin juga menyukai

Pertanyaan

FAQ

Produk ini hanya untuk keperluan penelitian dan tidak ditujukan untuk penggunaan terapeutik atau diagnostik pada manusia atau hewan. Produk dan konten dilindungi oleh paten, merek dagang, dan hak cipta milik Yeasen Bioteknologi. Simbol merek dagang menunjukkan negara asal, belum tentu pendaftaran di semua wilayah.

Aplikasi tertentu mungkin memerlukan hak kekayaan intelektual pihak ketiga tambahan.

Yeasen didedikasikan untuk ilmu etika, meyakini penelitian kami harus menjawab pertanyaan kritis sambil memastikan standar keselamatan dan etika.