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एक "स्ट्रैंड-विशिष्ट" लाइब्रेरी का निर्माण पीसीआर प्रवर्धन द्वारा किया जाता है, जिसमें टेम्पलेट के रूप में आरएनए से रिवर्स-ट्रांसक्रिप्ट किए गए सीडीएनए के केवल एक स्ट्रैंड का उपयोग किया जाता है। इसके विपरीत, एक पारंपरिक ट्रांसक्रिप्टोम लाइब्रेरी पीसीआर प्रवर्धन के लिए सीडीएनए के दोनों स्ट्रैंड का उपयोग करती है। नतीजतन, एक पारंपरिक ट्रांसक्रिप्टोम लाइब्रेरी आरएनए ध्रुवता को अलग नहीं कर सकती है, जबकि एक "स्ट्रैंड-विशिष्ट" लाइब्रेरी आरएनए ध्रुवता को प्रभावी ढंग से अलग कर सकती है। यह दो प्रकार की लाइब्रेरी के बीच मुख्य अंतर है।

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