Hieff ngs ™ Lựa chọn DNA Hạng
Hieff ngs ™ Lựa chọn DNA Hạng
Hieff ngs ™ Lựa chọn DNA Hạng
Cuộn hình ảnh để phóng to Bấm vào hình ảnh để phóng to
Hieff ngs ™ Lựa chọn DNA HạngHieff ngs ™ Lựa chọn DNA HạngHieff ngs ™ Lựa chọn DNA Hạng
Hieff ngs ™ Lựa chọn DNA Hạng
Hạt chọn lọc DNA Hieff NGS™ được chế tạo dựa trên nguyên lý SPRI (Bất động hóa ngược pha rắn) và được áp dụng để tinh chế DNA và chọn kích thước trong quá trình chuẩn bị thư viện giải trình tự thế hệ tiếp theo (NGS). Hạt chọn lọc DNA Hieff NGS™ tương thích với nhiều bộ dụng cụ chuẩn bị thư viện DNA và RNA và là một giải pháp thay thế tốt Hạt AMPure. Thành phần Số thành phần Tên 12601ES08 12601ES56 12601ES75 12601 Hạt lựa chọn...

Frequently Bought Together

Hieff ngs ™ Lựa chọn DNA Hạng

YeasenSKU: 12601ES03
Kích cỡ: 1mL
Giá:
$35.00
Cổ phần:
Trong kho

Hạt chọn lọc DNA Hieff NGS™ được chế tạo dựa trên nguyên lý SPRI (Bất động hóa ngược pha rắn) và được áp dụng để tinh chế DNA và chọn kích thước trong quá trình chuẩn bị thư viện giải trình tự thế hệ tiếp theo (NGS). Hạt chọn lọc DNA Hieff NGS™ tương thích với nhiều bộ dụng cụ chuẩn bị thư viện DNA và RNA và là một giải pháp thay thế tốt Hạt AMPure.

Thành phần

Số thành phần Tên 12601ES08 12601ES56 12601ES75
12601 Hạt lựa chọn DNA Hieff NGS™ 5ml 60ml 450mL

Thông số kỹ thuật

Dòng sản phẩm Hạt DNA sạch và chọn lọc
Vật liệu khởi đầu ADN
Khả năng tương thích ADN
Công nghệ cách ly Hạt từ tính
Loại sản phẩm cuối cùng ADN
Để sử dụng với (Ứng dụng) DNA celan up, DNA size slection

Vận chuyển và lưu trữ

Các hạt được vận chuyển bằng túi đá và có thể bảo quản ở nhiệt độ 2°C-8°C trong một năm.

Hướng dẫn

  • 1. Chuẩn bị

Để các hạt lựa chọn ở nhiệt độ phòng trong ít nhất 30 phút trước khi sử dụng.

  • 2. Lựa chọn kích thước DNA

Luồng hoạt động lựa chọn kích thước được thể hiện ở Hình 1 và giao thức như sau.

Hình 1. Sơ đồ dòng chảy của việc lựa chọn kích thước DNA

2.1 Trộn đều các hạt bằng cách lắc hoặc hút lên xuống mỗi lần trước khi sử dụng.
2.2 Thêm vòng hạt chọn lọc đầu tiên vào mẫu (tham khảo Bảng 1). Trộn đều bằng cách lắc xoáy hoặc hút lên xuống ít nhất 10 lần.
2.3 Ủ ở nhiệt độ phòng trong 5 phút.
2.4 Xoay ống xuống một chút và đặt lên giá từ. Khi dung dịch trong (khoảng 5 phút), chuyển phần dịch nổi vào ống PCR mới.
2.5 Thêm vòng hạt chọn lọc thứ hai vào mẫu từ bước 2.4 theo Bảng 1. Trộn đều bằng cách lắc hoặc hút lên xuống ít nhất 10 lần.
2.6 Ủ ở nhiệt độ phòng trong 5 phút.
2.7 Xoay ống xuống một lát và đặt lên giá từ. Khi dung dịch trong (khoảng 5 phút), hút phần chất lỏng trong và loại bỏ.
2.8 Giữ ống trong giá từ và thêm 200 μL ethanol 80% mới pha vào mà không làm xáo trộn các hạt, ủ ở nhiệt độ phòng trong 30 giây. Hút ethanol và loại bỏ.
2.9 Lặp lại bước 2.8 một lần để giặt tổng cộng hai lần.
2.10 Loại bỏ etanol còn lại bằng đầu pipet 10 µL. Giữ ống trong giá đỡ từ tính, phơi khô các hạt lựa chọn bằng không khí với nắp mở cho đến khi các vết nứt xuất hiện (khoảng 5 phút).
Lưu ý: Không làm khô các hạt lựa chọn quá mức. Điều này có thể làm giảm mục tiêu phục hồi DNA.
2.11 Lấy ống ra khỏi giá từ. Thêm một lượng ddH2O thích hợp (≥20 µL) và trộn đều bằng cách vortex hoặc hút lên xuống ít nhất 10 lần.
2.12 Ủ ở nhiệt độ phòng trong 5 phút.
Xoay ống xuống một lát và đặt lên giá từ. Khi dung dịch trong (khoảng 5 phút), chuyển 20 μL dịch trong sang ống mới.

  • 3. Điều kiện khuyến nghị để lựa chọn kích thước DNA

DNA tuyến ức bê được phân mảnh bằng phương pháp siêu âm để chuẩn bị một đoạn có kích thước 100-1.000 bp và thực hiện hai vòng lựa chọn kích thước theo Bảng 1. Kết quả được phân tích bằng Agilent 2100 Bioanalyzer (Hình 2).

Bảng 1. Điều kiện khuyến nghị để lựa chọn kích thước DNA

Chiều dài của đoạn DNA 250-350 điểm chuẩn 320-420 điểm chuẩn 450-550 điểm chuẩn 550-700 điểm chuẩn 700-900 điểm chuẩn 800-1.000 điểm chuẩn
Tỷ lệ hạt: DNA cho vòng 1 0,80× 0,70× 0,60× 0,55× 0,50× 0,45×
Tỷ lệ hạt: DNA cho lần thứ 2 Tròn 0,20× 0,20× 0,20× 0,15× 0,15× 0,15×

Lưu ý: "×" trong bảng biểu thị thể tích của mẫu DNA. Ví dụ, nếu chiều dài chèn của thư viện là 250 bp và thể tích mẫu DNA là 100 μL, thể tích hạt từ được sử dụng trong vòng phân loại đầu tiên là 0,80×100 μL=80 μL; thể tích hạt từ được sử dụng trong vòng phân loại thứ hai là 0,20×100 μL=20 μL.

Hình 2. Điện di DNA chip độ nhạy cao Agilent 2100

Ghi chú:
1. Vì sự an toàn và sức khỏe của bạn, vui lòng mặc áo khoác phòng thí nghiệm và găng tay dùng một lần khi thực hiện thí nghiệm.

Trích từ "Tích hợp trình tự cụ thể của họ 1 casposase từ Candidatus Nitrosopumilus koreensis AR1. Nghiên cứu về axit nucleic 2021;49(17):9938-9952. doi:10.1093/nar/gkab725"

Trích từ "Nhiễm trùng gần đây do Wolbachia làm thay đổi cộng đồng vi khuẩn trong quần thể Laodelphax striatellus hoang dã. Hệ vi sinh vật. 2020;8(1):104. Xuất bản ngày 2 tháng 7 năm 2020. doi:10.1186/s40168-020-00878-x"

Tài liệu:
Trích dẫn & Tài liệu tham khảo:

[1] Wang X, Yuan Q, Zhang W, et al. Tích hợp trình tự cụ thể bởi họ 1 casposase từ Candidatus Nitrosopumilus koreensis AR1. Nghiên cứu về axit nucleic 2021;49(17):9938-9952. doi:10.1093/nar/gkab725(IF:16.971)

[2] Duan XZ, Sun JT, Wang LT, et al. Nhiễm trùng gần đây do Wolbachia làm thay đổi cộng đồng vi khuẩn trong quần thể Laodelphax striatellus hoang dã. Microbiome. 2020;8(1):104. Xuất bản ngày 2 tháng 7 năm 2020. doi:10.1186/s40168-020-00878-x(IF:11.607)

[3] Song B, Almatrafi E, Sang F, et al.Quản lý trầm tích được xử lý bằng Fenton với than sinh học và phân chuồng cừu: Tác động đến đặc điểm tiến hóa của cộng đồng vi khuẩn. J Environ Manage. 2022;316:115218. doi:10.1016/j.jenvman.2022.115218(IF:6.789)

[4] Huang C, Mei Q, Lou L, et al. Viêm loét đại tràng đáp ứng với cấy ghép vi khuẩn đường ruột thông qua điều chỉnh vi khuẩn đường ruột và cân bằng tế bào Th17/Treg. Tế bào. 2022;11(11):1851. Xuất bản ngày 5 tháng 6 năm 2022. doi:10.3390/cells11111851(IF:6.600)

[5] Ghosh S, Yang X, Wang L, Zhang C, Zhao L. Cho ăn prebiotic pha hoạt động làm thay đổi hệ vi khuẩn đường ruột, gây ra sự giảm độc lập với trọng lượng của tình trạng gan nhiễm mỡ và cholesterol huyết thanh ở chuột được cho ăn chế độ nhiều chất béo. Comput Struct Biotechnol J. 2020;19:448-458. Xuất bản ngày 24 tháng 12 năm 2020. doi:10.1016/j.csbj.2020.12.011(IF:6.018)

[6] Gao X, Yu B, Yu J, et al. Hồ sơ phát triển tiêu hóa carbohydrate trong chế độ ăn ở lợn con. Front Microbiol. 2022;13:896660. Xuất bản ngày 29 tháng 4 năm 2022. doi:10.3389/fmicb.2022.896660(IF:5.640)

[7] Li P, Zhang Y, Yan F, Zhou X. Đặc điểm của một loại vi khuẩn thực khuẩn, vB_Kox_ZX8, được phân lập từ Klebsiella oxytoca lâm sàng và tác dụng điều trị của nó đối với vi khuẩn huyết ở chuột. Front Microbiol. 2021;12:763136. Xuất bản ngày 3 tháng 12 năm 2021. doi:10.3389/fmicb.2021.763136(IF:5.640)

[8] Lin Z, Luo P, Huang D, Wu Y, Li F, Liu H. Chiến lược dựa trên đa ô-míc để phân tích độc tính của acrylamide trong mô hình Saccharomyces cerevisiae. Chem Biol Interact. 2021;349:109682. doi:10.1016/j.cbi.2021.109682(IF:5.194)

[9] Sun X, Lv W, Wang Y, và những người khác. Gen Mrgprb2 đóng vai trò trong các phản ứng phản vệ do tiêm Houttuynia cordata gây ra. J Ethnopharmacol. 2022;289:115053. doi:10.1016/j.jep.2022.115053(IF:4.360)

[10] Ma H, Lai B, Zan C, Di X, Zhu X, Wang K. GLO1 góp phần vào khả năng kháng thuốc của Escherichia coli thông qua việc kích thích loại PER của β-Lactamase phổ mở rộng. Nhiễm trùng kháng thuốc. 2022;15:1573-1586. Xuất bản ngày 5 tháng 4 năm 2022. doi:10.2147/IDR.S358578(IF:4.003)

[11] Zhong Y, Zhao W, Tang Z, et al. Phân tích phiên mã so sánh các giai đoạn phát triển khác nhau của buồng trứng ở tôm càng đỏ đầm lầy Procambarus clarkii. BMC Genomics. 2021;22(1):199. Xuất bản ngày 21 tháng 3 năm 2021. doi:10.1186/s12864-021-07537-x(IF:3.969)

[12] Lian C, Yang H, Lan J, et al. Phân tích so sánh bộ gen lục lạp cho thấy mối quan hệ phát sinh loài và biến thể nội loài trong cây thuốc Isodon rubescens. PLoS One. 2022;17(4):e0266546. Xuất bản ngày 6 tháng 4 năm 2022. doi:10.1371/journal.pone.0266546(IF:3.240)

[13] Diao G, Huang J, Zheng X, và cộng sự. Prostaglandin E2 đóng vai trò kép trong việc điều chỉnh sự di chuyển của các tế bào dendritic. Int J Mol Med. 2021;47(1):207-218. doi:10.3892/ijmm.2020.4801(IF:3.098)

[14] Bing XL, Zhao DS, Peng CW, Huang HJ, Hong XY. Điểm tương đồng và biến thể không gian của cộng đồng vi khuẩn và nấm trong quần thể rầy nâu hại lúa (Hemiptera: Delphacidae). Insect Sci. 2020;27(5):947-963. doi:10.1111/1744-7917.12782(IF:2.791)

[15] Li X, Zhou S, Zhang J, Zhou Z, Xiong Q. Những thay đổi theo hướng của cộng đồng vi khuẩn đường ruột ở ấu trùng ruồi lính đen (Hermetia illucens). Động vật (Basel). 2021;11(12):3475. Xuất bản ngày 6 tháng 12 năm 2021. doi:10.3390/ani11123475(IF:2.752)

[16] Yang J, Peng Y, Kong W. Xác định và giải trình tự bộ gen hoàn chỉnh của virus bí ẩn dâu tằm 1. Arch Virol. 2022;167(2):687-690. doi:10.1007/s00705-021-05350-1(IF:2.574)

[17] Chang Y, Xia X, Sui L, et al. Sự xâm chiếm nội sinh của nấm gây bệnh cho côn trùng làm tăng khả năng kháng bệnh của cây bằng cách thay đổi cộng đồng vi khuẩn nội sinh. J Basic Microbiol. 2021;61(12):1098-1112. doi:10.1002/jobm.202100494(IF:2.281)

[18] Ding CY, Ma YM, Li B, et al. Xác định và phân tích chức năng của các gen biểu hiện khác biệt ở Myzus persicae (Hemiptera: Aphididae) để đáp ứng với Trans-anethole. J Insect Sci. 2022;22(1):3. doi:10.1093/jisesa/ieab094(IF:1.857)

Storage

This product should be stored at 2~8℃ for 18 months.

FAQ

It can purify DNA fragments of 150bp or longer. If the purified DNA contains a large amount of fragments shorter than 150bp, please use product number 12600, which can purify DNA fragments of 50bp or longer.
You need to figure out the system on your own. The currently selected system for the selected fragments is the one described in the manual. For other fragment selections, you can refer to the selection system in the manual for adjustment.
It is not recommended to freeze for a long time, as the low temperature will damage the structure of the magnetic beads. Freezing and thawing once for NGS library sorting and purification does not significantly affect the performance for a short period of time. However, the actual result should be based on specific test results.
Keeping the magnetic beads at room temperature may have some impact on their recovery performance. It is not recommended to leave them at room temperature for too long. After use, it is advisable to store them at 4℃. The separation effect of PEG is easily affected by factors such as pH and temperature.
The DNA sorting and purification magnetic beads are based on a technology called Solid Phase Reversible Immobilization (SPRI). The buffer of the magnetic beads generally contains: magnetic beads, DNA, PEG, salt ions (mainly Na+), etc. Under the action of PEG and NaCl, the DNA molecules will undergo dehydration condensation, resulting in a change in DNA conformation and aggregation precipitation. The negatively charged ones can be eluted from the bound DNA molecules when using buffer solutions without enzymes or TE (low salt and low PEG content).
Under different PEG and salt ion concentrations, the conformations of different lengths of DNA are different. Moreover, longer DNA fragments carry more negative charges, so magnetic beads generally preferentially adsorb long DNA fragments. Sorting usually requires two rounds of magnetic bead separation. In the first round, magnetic beads bind to the DNA of larger molecular weight, and this part of the product is removed by discarding the magnetic beads. At this time, the target-sized DNA is in the supernatant; in the second round, magnetic beads bind to the larger molecular weight DNA in the remaining products, and the smaller molecular weight DNA is removed by discarding the supernatant. At this point, the target-sized DNA is on the magnetic beads, and through two rounds of magnetic bead separation, the sorting goal is achieved.
It is not recommended to use 12601. Instead, 12600 should be used. The minimum fragment that can be recovered is about 100bp. The recovery rate of 50bp or above may be affected.
 Magnetic beads can adsorb both double-stranded DNA and single-stranded DNA, but they cannot distinguish between single-stranded or double-stranded DNA. The number of times single-stranded DNA can be purified by the magnetic beads can be referred to in the manual for double-stranded DNA.
12601ES is a non-specific adsorption magnetic bead that can also bind to RNA. If you want to remove RNA, you need to treat it with RNase A.
It is not recommended to use it. Although magnetic beads can also adsorb RNA fragments, the magnetic bead buffer is designed based on DNA characteristics and is not conducive to the stability of RNA structure. For RNA purification, it is recommended to use RNA purification magnetic beads (item number 12602ES).
1) The magnetic beads and DNA were not thoroughly mixed, resulting in insufficient adsorption. It is recommended to ensure thorough mixing of the reaction system.
2) The proportion of magnetic beads is incorrect. It is recommended to select the appropriate proportion according to the instructions.
3) The incubation time is insufficient. Ensure that the incubation time is at least 5 minutes.
4) During magnetic bead separation, when the two wheels perform magnetic bead adsorption, the magnetic beads are collected. A 10 μL pipette can be connected in series before the 200 μL pipette for liquid transfer, which can prevent the collection of magnetic beads.
5) During the magnetic bead washing process, the ethanol solution was not prepared freshly, resulting in an insufficiently high ethanol concentration. It is recommended that the ethanol concentration be no less than 70%, and for small fragments, it should be no less than 80%.
6) Excessive drying: If the magnetic beads are dried for too long, the surface will crack, making it difficult to elute the DNA and resulting in a decrease in yield. It is recommended that the drying time should not be too long; the moment the surface begins to crack, drying should be stopped.
7) Insufficient volume of elution solution: The final elution solution should completely cover the magnetic beads within the tube.
8) Sample reasons: The sample purity is low and contains impurities. When there are a large amount of impurities in the sample, it may cause the magnetic beads to aggregate and harden, resulting in insufficient elution. Using a pipette, try to blow the magnetic beads apart as much as possible, extend the elution time, and increase the product recovery rate. If there are many large fragments in the sample, the large fragments will cause the magnetic beads to aggregate. During elution, you can prolong the time or, if necessary, incubate at 37 degrees to improve the yield.

Citations

Documents

Brochure
Magnetic_Beads_for_DNA_RNA_and_mRNA_Enrichment.pdf

Applications

Bạn cũng có thể thích

Cuộc điều tra

Câu hỏi thường gặp

Sản phẩm chỉ dành cho mục đích nghiên cứu và không dùng để điều trị hoặc chẩn đoán ở người hoặc động vật. Sản phẩm và nội dung được bảo vệ bởi các bằng sáng chế, nhãn hiệu và bản quyền thuộc sở hữu của Yeasen Công nghệ sinh học. Biểu tượng nhãn hiệu chỉ ra quốc gia xuất xứ, không nhất thiết phải đăng ký ở tất cả các khu vực.

Một số ứng dụng có thể yêu cầu thêm quyền sở hữu trí tuệ của bên thứ ba.

Yeasen dành riêng cho khoa học đạo đức, tin rằng nghiên cứu của chúng tôi phải giải quyết các vấn đề quan trọng đồng thời đảm bảo các tiêu chuẩn về an toàn và đạo đức.