HIEFF NGS ™ DNA Selection Beads Superior Ampure XP Alternativ _ 12601es
HIEFF NGS ™ DNA Selection Beads Superior Ampure XP Alternativ _ 12601es
HIEFF NGS ™ DNA Selection Beads Superior Ampure XP Alternativ _ 12601es
Rulla över bilden för att zooma in Klicka på bilden för att zooma
HIEFF NGS ™ DNA Selection Beads Superior Ampure XP Alternativ _ 12601esHIEFF NGS ™ DNA Selection Beads Superior Ampure XP Alternativ _ 12601esHIEFF NGS ™ DNA Selection Beads Superior Ampure XP Alternativ _ 12601es
HIEFF NGS ™ DNA Selection Beads Superior Ampure XP Alternativ _ 12601es
Hieff NGS™ DNA-selektionspärlor framställs baserat på SPRI-principen (Solid Phase Reverse Immobilization) och kan användas för DNA-rening och storleksval under beredningen av nästa generations sekvenseringsbibliotek (NGS). Hieff NGS™ DNA Selection Beads är kompatibel med olika DNA- och RNA-biblioteksförberedande kit och är ett bra alternativ till AMPure pärlor. Komponenter Komponentnr. Namn 12601ES08 12601ES56 12601ES75 12601 Hieff NGS™ DNA-selektionspärlor 5 ml 60 ml 450 ml Specifikationer Produktlinje DNA ren och urval pärlor Utgångsmaterial DNA Kompatibilitet DNA Isoleringsteknik Magnetisk pärla Slutlig produkttyp DNA För användning med (applikation) DNA celan up, DNA storlek selektion Frakt...

Frequently Bought Together

HIEFF NGS ™ DNA Selection Beads Superior Ampure XP Alternativ _ 12601es

YeasenSku: 12601ES03
Storlek: 1mL
Pris:
$35.00
Stock:
I lager

Hieff NGS™ DNA-selektionspärlor framställs baserat på SPRI-principen (Solid Phase Reverse Immobilization) och kan användas för DNA-rening och storleksval under beredningen av nästa generations sekvenseringsbibliotek (NGS). Hieff NGS™ DNA Selection Beads är kompatibel med olika DNA- och RNA-biblioteksförberedande kit och är ett bra alternativ till AMPure pärlor.

Komponenter

Komponentnr. Namn 12601ES08 12601ES56 12601ES75
12601 Hieff NGS™ DNA-selektionspärlor 5 ml 60 ml 450 ml

Specifikationer

Produktlinje DNA ren och urval pärlor
Utgångsmaterial DNA
Kompatibilitet DNA
Isoleringsteknik Magnetisk pärla
Slutlig produkttyp DNA
För användning med (applikation) DNA celan up, DNA storlek selektion

Frakt och förvaring

Pärlorna skickas med isförpackningar och kan förvaras vid 2°C-8°C i ett år.

Instruktioner

  • 1. Förberedelse

Utjämna urvalspärlorna vid rumstemperatur i minst 30 minuter före användning.

  • 2. Val av DNA-storlek

Operationsflödet för storleksval visas i figur 1 och protokollet är som följer.

Figur 1. Flödesschemat för urval av DNA-storlek

2.1 Blanda pärlorna noggrant genom att vortexa eller pipettera upp och ner varje gång före användning.
2.2 Lägg till den första omgången av urvalspärlor till provet (se tabell 1). Blanda noggrant genom att vortexa eller pipettera upp och ner minst 10 gånger.
2.3 Inkubera i rumstemperatur i 5 min.
2.4 Snurra ner röret kort och placera det på magnetstativ. När lösningen är klar (ca 5 min), överför supernatanten till ett nytt PCR-rör.
2.5 Lägg till den andra omgången av urvalspärlor till provet från steg 2.4 enligt tabell 1. Blanda noggrant genom att vortexa eller pipettera upp och ner minst 10 gånger.
2.6 Inkubera vid rumstemperatur i 5 min.
2.7 Snurra ner röret kort och placera det på magnetstativ. När lösningen är klar (ca 5 min), aspirera supernatanten och kassera.
2.8 Håll röret i det magnetiska stativet och tillsätt 200 μL nyberedd 80 % etanol för att utan att störa pärlorna, inkubera i rumstemperatur i 30 sekunder. Aspirera etanolen och kassera.
2.9 Upprepa steg 2.8 en gång för totalt två tvättar.
2.10 Ta bort resterande etanol med 10 µL pipettspetsar. Håll röret i det magnetiska stativet, lufttorka urvalspärlorna med locket öppet tills sprickor precis uppstår (ca 5 min).
Obs: Torka inte valpärlorna för mycket. Detta kan resultera i lägre återställnings-DNA-mål.
2.11 Ta bort röret från magnetstativet. Tillsätt en lämplig mängd ddH2O (≥20 µL) och blanda noggrant genom att vortexa eller pipettera upp och ner minst 10 gånger.
2.12 Inkubera i rumstemperatur i 5 min.
Snurra ner röret kort och placera det på magnetstativet. När lösningen är klar (cirka 5 minuter), överför 20 μL av supernatanten till ett nytt rör.

  • 3. Rekommenderade villkor för urval av DNA-storlek

Kalvtymus-DNA:t fragmenterades genom sonikering för att framställa ett fragment på 100-1 000 bp, och två omgångar av storleksval utfördes enligt tabell 1. Resultaten analyserades med användning av Agilent 2100 Bioanalyzer (Figur 2).

Tabell 1. Rekommenderat villkor för val av DNA-storlek

Längd på DNA-fragment 250-350 bp 320-420 bp 450-550 bp 550-700 bp 700-900 bp 800-1 000 bp
Förhållande av pärlor: DNA för 1:a omgången 0,80× 0,70× 0,60× 0,55× 0,50× 0,45×
Förhållande av pärlor: DNA för 2:an Runda 0,20× 0,20× 0,20× 0,15× 0,15× 0,15×

Obs: "×" i tabellen anger volymen av prov-DNA. Till exempel, om insättningslängden på biblioteket är 250 bp och provets DNA-volym är 100 μL, är volymen magnetiska pärlor som används i den första sorteringsrundan 0,80×100 μL=80 μL; volymen av magnetiska pärlor som används i den andra sorteringsrundan är 0,20× 100 μL=20 μL.

Figur 2. Agilent 2100 högkänsligt DNA-chipelektroferogram

Anmärkningar:
1. För din säkerhet och hälsa, vänligen bär laboratorierockar och engångshandskar vid användning.

Citerad från "Sekvensspecifik integration av familj 1-kasposas från Candidatus Nitrosopumilus koreensis AR1. Nucleic Acids Res. 2021;49(17):9938-9952. doi:10.1093/nar/gkab725"

Citerad från "Recent infektion av Wolbachia förändrar mikrobiella samhällen i vilda Laodelphax striatellus populationer. Mikrobiom. 2020;8(1):104. Publicerad 2020 juli 2. doi:10.1186/s40168-020-00878-x"

Dokument:
Citat och referenser:

[1] Wang X, Yuan Q, Zhang W, et al. Sekvensspecifik integration av familj 1-kasposas från Candidatus Nitrosopumilus koreensis AR1. Nucleic Acids Res. 2021;49(17):9938-9952. doi:10.1093/nar/gkab725(IF:16.971)

[2] Duan XZ, Sun JT, Wang LT, et al. Ny infektion av Wolbachia förändrar mikrobiella samhällen i vilda Laodelphax striatellus-populationer. Mikrobiom. 2020;8(1):104. Publicerad 2020 juli. doi:10.1186/s40168-020-00878-x(IF:11.607)

[3] Song B, Almatrafi E, Sang F, et al.Hantera Fenton-behandlat sediment med biokol och fårgödselkompost: Effekter på de evolutionära egenskaperna hos bakteriesamhället. J Environ Manage. 2022;316:115218. doi:10.1016/j.jenvman.2022.115218(IF:6.789)

[4] Huang C, Mei Q, Lou L, et al. Ulcerös kolit som svar på fekal mikrobiotatransplantation via modulering av tarmmikrobiota och Th17/Treg-cellbalans. Celler. 2022;11(11):1851. Publicerad 2022 5 juni. doi:10.3390/cells11111851(IF:6.600)

[5] Ghosh S, Yang X, Wang L, Zhang C, Zhao L. Aktiv fas av prebiotisk utfodring förändrar tarmmikrobiota, inducerar viktoberoende lindring av leversteatos och serumkolesterol hos möss som matats med fettrik diet. Comput Struct Biotechnol J. 2020;19:448-458. Publicerad 2020 24 dec. doi:10.1016/j.csbj.2020.12.011(IF:6.018)

[6] Gao X, Yu B, Yu J, et al. Utvecklingsprofilering av matsmältning av kolhydrater hos smågrisar. Främre Microbiol. 2022;13:896660. Publicerad 2022 29 april. doi:10.3389/fmicb.2022.896660(IF:5.640)

[7] Li P, Zhang Y, Yan F, Zhou X. Characteristics of a Bacteriophage, vB_Kox_ZX8, Isolated From Clinical Klebsiella oxytoca och dess terapeutiska effekt på möss bakteriemi. Främre Microbiol. 2021;12:763136. Publicerad 2021 3 dec. doi:10.3389/fmicb.2021.763136(IF:5.640)

[8] Lin Z, Luo P, Huang D, Wu Y, Li F, Liu H. Multi-omics-baserad strategi för toxicitetsanalys av akrylamid i Saccharomyces cerevisiae-modell. Chem Biol Interact. 2021;349:109682. doi:10.1016/j.cbi.2021.109682(IF:5.194)

[9] Sun X, Lv W, Wang Y, et al. Mrgprb2-genen spelar en roll i de anafylaktoida reaktioner som induceras av Houttuynia cordata-injektion. J Etnopharmacol. 2022;289:115053. doi:10.1016/j.jep.2022.115053(IF:4.360)

[10] Ma H, Lai B, Zan C, Di X, Zhu X, Wang K. GLO1 bidrar till läkemedelsresistens hos Escherichia coli genom att inducera PER-typ av β-laktamaser med utökat spektrum. Infect Drug Resist. 2022;15:1573-1586. Publicerad 2022 5 april doi:10.2147/IDR.S358578(IF:4.003)

[11] Zhong Y, Zhao W, Tang Z, et al. Jämförande transkriptomisk analys av de olika utvecklingsstadierna av äggstockar hos röd träskkräfta Procambarus clarkii. BMC Genomics. 2021;22(1):199. Publicerad 2021 21 mars. doi:10.1186/s12864-021-07537-x(IF:3.969)

[12] Lian C, Yang H, Lan J, et al. Jämförande analys av kloroplastgenom avslöjar fylogenetiska samband och intraspecifik variation i medicinalväxten Isodon rubescens. PLoS One. 2022;17(4):e0266546. Publicerad 2022 6 april. doi:10.1371/journal.pone.0266546(IF:3.240)

[13] Diao G, Huang J, Zheng X, et al. Prostaglandin E2 har en dubbel roll för att reglera migrationen av dendritiska celler. Int J Mol Med. 2021;47(1):207-218. doi:10.3892/ijmm.2020.4801(IF:3.098)

[14] Bing XL, Zhao DS, Peng CW, Huang HJ, Hong XY. Likheter och rumsliga variationer av bakterie- och svampsamhällen i populationer av åkerrisplanthoppare (Hemiptera: Delphacidae). Insect Sci. 2020;27(5):947-963. doi:10.1111/1744-7917.12782(IF:2.791)

[15] Li X, Zhou S, Zhang J, Zhou Z, Xiong Q. Riktningsförändringar i tarmbakteriegemenskapen hos svart soldatfluga (Hermetia illucens) larver. Djur (Basel). 2021;11(12):3475. Publicerad 6 december 2021. doi:10.3390/ani11123475(IF:2.752)

[16] Yang J, Peng Y, Kong W. Identifiering och fullständig genomsekvens av mullbärskryptiska virus 1. Arch Virol. 2022;167(2):687-690. doi:10.1007/s00705-021-05350-1(IF:2.574)

[17] Chang Y, Xia X, Sui L, et al. Endofytisk kolonisering av entomopatogena svampar ökar resistens mot växtsjukdomar genom att förändra det endofytiska bakteriesamhället. J Basic Microbiol. 2021;61(12):1098-1112. doi:10.1002/jobm.202100494(IF:2.281)

[18] Ding CY, Ma YM, Li B, et al. Identifiering och funktionell analys av differentiellt uttryckta gener i Myzus persicae (Hemiptera: Aphididae) som svar på transanetol. J Insect Sci. 2022;22(1):3. doi:10.1093/jisesa/ieab094(IF:1.857)

Storage

This product should be stored at 2~8℃ for 18 months.

FAQ

It can purify DNA fragments of 150bp or longer. If the purified DNA contains a large amount of fragments shorter than 150bp, please use product number 12600, which can purify DNA fragments of 50bp or longer.
You need to figure out the system on your own. The currently selected system for the selected fragments is the one described in the manual. For other fragment selections, you can refer to the selection system in the manual for adjustment.
It is not recommended to freeze for a long time, as the low temperature will damage the structure of the magnetic beads. Freezing and thawing once for NGS library sorting and purification does not significantly affect the performance for a short period of time. However, the actual result should be based on specific test results.
Keeping the magnetic beads at room temperature may have some impact on their recovery performance. It is not recommended to leave them at room temperature for too long. After use, it is advisable to store them at 4℃. The separation effect of PEG is easily affected by factors such as pH and temperature.
The DNA sorting and purification magnetic beads are based on a technology called Solid Phase Reversible Immobilization (SPRI). The buffer of the magnetic beads generally contains: magnetic beads, DNA, PEG, salt ions (mainly Na+), etc. Under the action of PEG and NaCl, the DNA molecules will undergo dehydration condensation, resulting in a change in DNA conformation and aggregation precipitation. The negatively charged ones can be eluted from the bound DNA molecules when using buffer solutions without enzymes or TE (low salt and low PEG content).
Under different PEG and salt ion concentrations, the conformations of different lengths of DNA are different. Moreover, longer DNA fragments carry more negative charges, so magnetic beads generally preferentially adsorb long DNA fragments. Sorting usually requires two rounds of magnetic bead separation. In the first round, magnetic beads bind to the DNA of larger molecular weight, and this part of the product is removed by discarding the magnetic beads. At this time, the target-sized DNA is in the supernatant; in the second round, magnetic beads bind to the larger molecular weight DNA in the remaining products, and the smaller molecular weight DNA is removed by discarding the supernatant. At this point, the target-sized DNA is on the magnetic beads, and through two rounds of magnetic bead separation, the sorting goal is achieved.
It is not recommended to use 12601. Instead, 12600 should be used. The minimum fragment that can be recovered is about 100bp. The recovery rate of 50bp or above may be affected.
 Magnetic beads can adsorb both double-stranded DNA and single-stranded DNA, but they cannot distinguish between single-stranded or double-stranded DNA. The number of times single-stranded DNA can be purified by the magnetic beads can be referred to in the manual for double-stranded DNA.
12601ES is a non-specific adsorption magnetic bead that can also bind to RNA. If you want to remove RNA, you need to treat it with RNase A.
It is not recommended to use it. Although magnetic beads can also adsorb RNA fragments, the magnetic bead buffer is designed based on DNA characteristics and is not conducive to the stability of RNA structure. For RNA purification, it is recommended to use RNA purification magnetic beads (item number 12602ES).
1) The magnetic beads and DNA were not thoroughly mixed, resulting in insufficient adsorption. It is recommended to ensure thorough mixing of the reaction system.
2) The proportion of magnetic beads is incorrect. It is recommended to select the appropriate proportion according to the instructions.
3) The incubation time is insufficient. Ensure that the incubation time is at least 5 minutes.
4) During magnetic bead separation, when the two wheels perform magnetic bead adsorption, the magnetic beads are collected. A 10 μL pipette can be connected in series before the 200 μL pipette for liquid transfer, which can prevent the collection of magnetic beads.
5) During the magnetic bead washing process, the ethanol solution was not prepared freshly, resulting in an insufficiently high ethanol concentration. It is recommended that the ethanol concentration be no less than 70%, and for small fragments, it should be no less than 80%.
6) Excessive drying: If the magnetic beads are dried for too long, the surface will crack, making it difficult to elute the DNA and resulting in a decrease in yield. It is recommended that the drying time should not be too long; the moment the surface begins to crack, drying should be stopped.
7) Insufficient volume of elution solution: The final elution solution should completely cover the magnetic beads within the tube.
8) Sample reasons: The sample purity is low and contains impurities. When there are a large amount of impurities in the sample, it may cause the magnetic beads to aggregate and harden, resulting in insufficient elution. Using a pipette, try to blow the magnetic beads apart as much as possible, extend the elution time, and increase the product recovery rate. If there are many large fragments in the sample, the large fragments will cause the magnetic beads to aggregate. During elution, you can prolong the time or, if necessary, incubate at 37 degrees to improve the yield.

Citations

Documents

Brochure
Magnetic_Beads_for_DNA_RNA_and_mRNA_Enrichment.pdf

Applications

Du kanske också gillar

Förfrågan

Vanliga frågor

Produkten är endast avsedd för forskningsändamål och är inte avsedd för terapeutisk eller diagnostisk användning hos människor eller djur. Produkter och innehåll skyddas av patent, varumärken och upphovsrätt som ägs av Yeasen Biotechnology. Varumärkessymboler anger ursprungsland, inte nödvändigtvis registrering i alla regioner.

Vissa applikationer kan kräva ytterligare immateriella rättigheter från tredje part.

Yeasen är dedikerad till etisk vetenskap, och anser att vår forskning bör behandla kritiska frågor samtidigt som den säkerställer säkerhet och etiska standarder.