Шсины выбора ДНК Hieff ngs ™ Верхний Ampure xp alternative _ 12601es
Шсины выбора ДНК Hieff ngs ™ Верхний Ampure xp alternative _ 12601es
Шсины выбора ДНК Hieff ngs ™ Верхний Ampure xp alternative _ 12601es
Перевернуть изображение, чтобы увеличить Нажмите на изображение, чтобы увеличить
Шсины выбора ДНК Hieff ngs ™ Верхний Ampure xp alternative _ 12601esШсины выбора ДНК Hieff ngs ™ Верхний Ampure xp alternative _ 12601esШсины выбора ДНК Hieff ngs ™ Верхний Ampure xp alternative _ 12601es
Шсины выбора ДНК Hieff ngs ™ Верхний Ampure xp alternative _ 12601es
Бисеры для выбора ДНК Hieff NGS™ готовятся на основе принципа SPRI (твердофазная обратная иммобилизация) и применяются для очистки ДНК и выбора размера во время подготовки библиотек секвенирования следующего поколения (NGS). Бисеры для выбора ДНК Hieff NGS™ совместимы с различными наборами для подготовки библиотек ДНК и РНК и являются хорошей альтернативой AMЧистые бусины. Компоненты Номер компонента Имя 12601ES08 12601ES56 12601ES75 12601 Бисеры для отбора ДНК Hieff NGS™ 5 мл 60 мл 450 мл Технические характеристики Линия продуктов Бусины для очистки и отбора ДНК Исходный материал ДНК Совместимость ДНК Технология изоляции Магнитная...

Frequently Bought Together

Шсины выбора ДНК Hieff ngs ™ Верхний Ampure xp alternative _ 12601es

Сохранять $5.00
YeasenSku: 12601ES03
Размер: 1mL
Цена:
$30.00 $35.00
Запас:
В наличии

Бисеры для выбора ДНК Hieff NGS™ готовятся на основе принципа SPRI (твердофазная обратная иммобилизация) и применяются для очистки ДНК и выбора размера во время подготовки библиотек секвенирования следующего поколения (NGS). Бисеры для выбора ДНК Hieff NGS™ совместимы с различными наборами для подготовки библиотек ДНК и РНК и являются хорошей альтернативой AMЧистые бусины.

Компоненты

Номер компонента Имя 12601ES08 12601ES56 12601ES75
12601 Бисеры для отбора ДНК Hieff NGS™ 5 мл 60 мл 450 мл

Технические характеристики

Линия продуктов Бусины для очистки и отбора ДНК
Исходный материал ДНК
Совместимость ДНК
Технология изоляции Магнитная бусина
Тип конечного продукта ДНК
Для использования с (приложение) ДНК целан вверх, выбор размера ДНК

Доставка и хранение

Бусины поставляются с пакетами со льдом и могут храниться при температуре от 2°C до 8°C в течение одного года.

Инструкции

  • 1. Подготовка

Перед использованием выдержите селективные шарики при комнатной температуре не менее 30 минут.

  • 2. Выбор размера ДНК

Последовательность операций выбора размера показана на рисунке 1, а протокол выглядит следующим образом.

Рисунок 1. Блок-схема выбора размера ДНК

2.1 Перед каждым использованием тщательно перемешивайте гранулы путем встряхивания или пипетирования.
2.2 Добавьте первый раунд отборочных шариков к образцу (см. Таблицу 1). Тщательно перемешайте путем вортексирования или пипетирования вверх и вниз не менее 10 раз.
2.3 Инкубируйте при комнатной температуре в течение 5 мин.
2.4 Быстро центрифугируйте пробирку и поместите ее на магнитный штатив. Когда раствор станет прозрачным (примерно через 5 мин), перенесите супернатант в новую пробирку для ПЦР.
2.5 Добавьте вторую порцию отборочных шариков к образцу из шага 2.4 в соответствии с таблицей 1. Тщательно перемешайте путем встряхивания или пипетирования вверх и вниз не менее 10 раз.
2.6 Инкубируйте при комнатной температуре в течение 5 мин.
2.7 Быстро центрифугируйте пробирку и поместите ее на магнитный штатив. Когда раствор станет прозрачным (примерно через 5 мин), аспирируйте надосадочную жидкость и выбросьте ее.
2.8 Поместите пробирку в магнитный штатив и добавьте 200 мкл свежеприготовленного 80% этанола, не трогая гранулы, инкубируйте при комнатной температуре в течение 30 сек. Аспирируйте этанол и выбросьте.
2.9 Повторите шаг 2.8 один раз, чтобы выполнить в общей сложности две стирки.
2.10 Удалите остаточный этанол с помощью наконечников пипеток объемом 10 мкл. Держите пробирку в магнитном штативе, высушите на воздухе селективные бусины с открытой крышкой до тех пор, пока не появятся трещины (около 5 мин).
Примечание: Не пересушивайте гранулы для отбора проб. Это может привести к снижению эффективности восстановления ДНК-мишени.
2.11 Снимите пробирку с магнитного штатива. Добавьте соответствующее количество ddH2O (≥20 мкл) и тщательно перемешайте путем вортексирования или пипетирования вверх и вниз не менее 10 раз.
2.12 Инкубируйте при комнатной температуре в течение 5 мин.
Быстро опустите пробирку и поместите ее на магнитный штатив. Когда раствор станет прозрачным (примерно через 5 минут), перенесите 20 мкл супернатанта в новую пробирку.

  • 3.Рекомендуемые условия для выбора размера ДНК

ДНК тимуса теленка была фрагментирована с помощью ультразвука для получения фрагмента размером 100–1000 п.н., и были проведены два раунда отбора размера в соответствии с таблицей 1. Результаты были проанализированы с помощью биоанализатора Agilent 2100 (рисунок 2).

Таблица 1. Рекомендуемые условия для выбора размера ДНК

Длина фрагмента ДНК 250-350 п.н. 320-420 п.н. 450-550 п.н. 550-700 п.н. 700-900 п.н. 800-1000 п.н.
Соотношение бусин: ДНК для 1-го раунда 0,80× 0,70× 0,60× 0,55× 0,50× 0,45×
Соотношение бусин: ДНК для 2-го Круглый 0,20× 0,20× 0,20× 0,15× 0,15× 0,15×

Примечание: «×» в таблице указывает объем образца ДНК. Например, если длина вставки библиотеки составляет 250 п.н., а объем образца ДНК составляет 100 мкл, объем магнитных частиц, используемых в первом раунде сортировки, составляет 0,80×100 мкл=80 мкл; объем магнитных частиц, используемых во втором раунде сортировки, составляет 0,20×100 мкл=20 мкл.

Рисунок 2. Электрофореграмма высокочувствительного ДНК-чипа Agilent 2100

Примечания:
1. Для вашей безопасности и здоровья, пожалуйста, надевайте лабораторный халат и одноразовые перчатки во время работы.

Цитируется из «Специфическая интеграция последовательности каспозазой семейства 1 из Candidatus Nitrosopumilus koreensis» AR1. Nucleic Acids Res. 2021;49(17):9938-9952. doi:10.1093/nar/gkab725"

Цитируется из «Недавнее заражение Wolbachia изменяет микробные сообщества в популяциях диких Laodelphax striatellus. Microbiome. 2020;8(1):104. Опубликовано 2 июля 2020 г. doi:10.1186/s40168-020-00878-x»

Документы:
Цитаты и ссылки:

[1] Ван X, Юань Q, Чжан В и др. Последовательность-специфическая интеграция каспозазой семейства 1 из Candidatus Nitrosopumilus koreensis AR1. Nucleic Acids Res. 2021;49(17):9938-9952. doi:10.1093/nar/gkab725(IF:16.971)

[2] Duan XZ, Sun JT, Wang LT и др. Недавнее заражение Wolbachia изменяет микробные сообщества в популяциях диких Laodelphax striatellus. Microbiome. 2020;8(1):104. Опубликовано 2 июля 2020 г. doi:10.1186/s40168-020-00878-x(IF:11.607)

[3] Сонг Б., Альматрафи Е., Санг Ф. и др.Управление осадком, обработанным по методу Фентона, с помощью биоугля и компоста из овечьего навоза: влияние на эволюционные характеристики бактериального сообщества. J Environ Manage. 2022;316:115218. doi:10.1016/j.jenvman.2022.115218(IF:6.789)

[4] Хуан С., Мэй К., Лу Л. и др. Язвенный колит в ответ на трансплантацию фекальной микробиоты посредством модуляции кишечной микробиоты и баланса клеток Th17/Treg. Клетки. 2022;11(11):1851. Опубликовано 5 июня 2022 г. doi:10.3390/cells11111851(IF:6.600)

[5] Ghosh S, Yang X, Wang L, Zhang C, Zhao L. Активная фаза пребиотического питания изменяет микробиоту кишечника, вызывает независимое от веса облегчение гепатостеатоза и уровня сывороточного холестерина у мышей, получавших диету с высоким содержанием жиров. Comput Struct Biotechnol J. 2020;19:448-458. Опубликовано 24 декабря 2020 г. doi:10.1016/j.csbj.2020.12.011(IF:6.018)

[6] Гао X, Ю Б, Ю Дж и др. Профилирование развития переваривания пищевых углеводов у поросят. Front Microbiol. 2022;13:896660. Опубликовано 29 апреля 2022 г. doi:10.3389/fmicb.2022.896660(IF:5.640)

[7] Ли П., Чжан И., Янь Ф., Чжоу С. Характеристики бактериофага vB_Kox_ZX8, выделенного из клинической Klebsiella oxytoca, и его терапевтический эффект на бактериемию у мышей. Front Microbiol. 2021;12:763136. Опубликовано 3 декабря 2021 г. doi:10.3389/fmicb.2021.763136(IF:5.640)

[8] Линь З., Луо П., Хуан Д., У И., Ли Ф., Лю Х. Стратегия анализа токсичности акриламида в модели Saccharomyces cerevisiae на основе мультиомики. Chem Biol Interact. 2021;349:109682. doi:10.1016/j.cbi.2021.109682(IF:5.194)

[9] Сунь X, Lv W, Ван Y и др. Ген Mrgprb2 играет роль в анафилактоидных реакциях, вызванных инъекцией хауттюйнии сердцевидной. Дж Этнофармакол. 2022;289:115053. doi:10.1016/j.jep.2022.115053(ЕСЛИ:4.360)

[10] Ma H, Lai B, Zan C, Di X, Zhu X, Wang K. GLO1 способствует лекарственной устойчивости Escherichia coli посредством индукции PER-типа β-лактамаз расширенного спектра. Infect Drug Resist. 2022;15:1573-1586. Опубликовано 5 апреля 2022 г. doi:10.2147/IDR.S358578(IF:4.003)

[11] Zhong Y, Zhao W, Tang Z и др. Сравнительный транскриптомный анализ различных стадий развития яичника красного болотного рака Procambarus clarkii. BMC Genomics. 2021;22(1):199. Опубликовано 21 марта 2021 г. doi:10.1186/s12864-021-07537-x(IF:3.969)

[12] Lian C, Yang H, Lan J и др. Сравнительный анализ геномов хлоропластов выявляет филогенетические связи и внутривидовые различия в лекарственном растении Isodon rubescens. PLoS One. 2022;17(4):e0266546. Опубликовано 6 апреля 2022 г. doi:10.1371/journal.pone.0266546(IF:3.240)

[13] Дяо Г., Хуан Дж., Чжэн Х. и др. Простагландин E2 выполняет двойную роль в регуляции миграции дендритных клеток. Int J Mol Med. 2021;47(1):207-218. doi:10.3892/ijmm.2020.4801(IF:3.098)

[14] Bing XL, Zhao DS, Peng CW, Huang HJ, Hong XY. Сходства и пространственные вариации бактериальных и грибковых сообществ в популяциях полевых рисовых цикад (Hemiptera: Delphacidae). Insect Sci. 2020;27(5):947-963. doi:10.1111/1744-7917.12782(IF:2.791)

[15] Ли X, Чжоу С, Чжан Дж, Чжоу З, Сюн Ц. Направленные изменения в кишечном бактериальном сообществе у личинок черной львинки (Hermetia illucens). Животные (Базель). 2021;11(12):3475. Опубликовано 6 декабря 2021 г. doi:10.3390/ani11123475(IF:2.752)

[16] Yang J, Peng Y, Kong W. Идентификация и полная последовательность генома криптического вируса шелковицы 1. Arch Virol. 2022;167(2):687-690. doi:10.1007/s00705-021-05350-1(IF:2.574)

[17] Чанг И., Ся Х., Суй Л. и др. Эндофитная колонизация энтомопатогенных грибов повышает устойчивость растений к болезням за счет изменения эндофитного бактериального сообщества. J Basic Microbiol. 2021;61(12):1098-1112. doi:10.1002/jobm.202100494(IF:2.281)

[18] Ding CY, Ma YM, Li B и др. Идентификация и функциональный анализ дифференциально экспрессируемых генов у Myzus persicae (Hemiptera: Aphididae) в ответ на транс-анетол. J Insect Sci. 2022;22(1):3. doi:10.1093/jisesa/ieab094(IF:1.857)

Storage

This product should be stored at 2~8℃ for 18 months.

FAQ

It can purify DNA fragments of 150bp or longer. If the purified DNA contains a large amount of fragments shorter than 150bp, please use product number 12600, which can purify DNA fragments of 50bp or longer.
You need to figure out the system on your own. The currently selected system for the selected fragments is the one described in the manual. For other fragment selections, you can refer to the selection system in the manual for adjustment.
It is not recommended to freeze for a long time, as the low temperature will damage the structure of the magnetic beads. Freezing and thawing once for NGS library sorting and purification does not significantly affect the performance for a short period of time. However, the actual result should be based on specific test results.
Keeping the magnetic beads at room temperature may have some impact on their recovery performance. It is not recommended to leave them at room temperature for too long. After use, it is advisable to store them at 4℃. The separation effect of PEG is easily affected by factors such as pH and temperature.
The DNA sorting and purification magnetic beads are based on a technology called Solid Phase Reversible Immobilization (SPRI). The buffer of the magnetic beads generally contains: magnetic beads, DNA, PEG, salt ions (mainly Na+), etc. Under the action of PEG and NaCl, the DNA molecules will undergo dehydration condensation, resulting in a change in DNA conformation and aggregation precipitation. The negatively charged ones can be eluted from the bound DNA molecules when using buffer solutions without enzymes or TE (low salt and low PEG content).
Under different PEG and salt ion concentrations, the conformations of different lengths of DNA are different. Moreover, longer DNA fragments carry more negative charges, so magnetic beads generally preferentially adsorb long DNA fragments. Sorting usually requires two rounds of magnetic bead separation. In the first round, magnetic beads bind to the DNA of larger molecular weight, and this part of the product is removed by discarding the magnetic beads. At this time, the target-sized DNA is in the supernatant; in the second round, magnetic beads bind to the larger molecular weight DNA in the remaining products, and the smaller molecular weight DNA is removed by discarding the supernatant. At this point, the target-sized DNA is on the magnetic beads, and through two rounds of magnetic bead separation, the sorting goal is achieved.
It is not recommended to use 12601. Instead, 12600 should be used. The minimum fragment that can be recovered is about 100bp. The recovery rate of 50bp or above may be affected.
 Magnetic beads can adsorb both double-stranded DNA and single-stranded DNA, but they cannot distinguish between single-stranded or double-stranded DNA. The number of times single-stranded DNA can be purified by the magnetic beads can be referred to in the manual for double-stranded DNA.
12601ES is a non-specific adsorption magnetic bead that can also bind to RNA. If you want to remove RNA, you need to treat it with RNase A.
It is not recommended to use it. Although magnetic beads can also adsorb RNA fragments, the magnetic bead buffer is designed based on DNA characteristics and is not conducive to the stability of RNA structure. For RNA purification, it is recommended to use RNA purification magnetic beads (item number 12602ES).
1) The magnetic beads and DNA were not thoroughly mixed, resulting in insufficient adsorption. It is recommended to ensure thorough mixing of the reaction system.
2) The proportion of magnetic beads is incorrect. It is recommended to select the appropriate proportion according to the instructions.
3) The incubation time is insufficient. Ensure that the incubation time is at least 5 minutes.
4) During magnetic bead separation, when the two wheels perform magnetic bead adsorption, the magnetic beads are collected. A 10 μL pipette can be connected in series before the 200 μL pipette for liquid transfer, which can prevent the collection of magnetic beads.
5) During the magnetic bead washing process, the ethanol solution was not prepared freshly, resulting in an insufficiently high ethanol concentration. It is recommended that the ethanol concentration be no less than 70%, and for small fragments, it should be no less than 80%.
6) Excessive drying: If the magnetic beads are dried for too long, the surface will crack, making it difficult to elute the DNA and resulting in a decrease in yield. It is recommended that the drying time should not be too long; the moment the surface begins to crack, drying should be stopped.
7) Insufficient volume of elution solution: The final elution solution should completely cover the magnetic beads within the tube.
8) Sample reasons: The sample purity is low and contains impurities. When there are a large amount of impurities in the sample, it may cause the magnetic beads to aggregate and harden, resulting in insufficient elution. Using a pipette, try to blow the magnetic beads apart as much as possible, extend the elution time, and increase the product recovery rate. If there are many large fragments in the sample, the large fragments will cause the magnetic beads to aggregate. During elution, you can prolong the time or, if necessary, incubate at 37 degrees to improve the yield.

Citations

Documents

Brochure
Magnetic_Beads_for_DNA_RNA_and_mRNA_Enrichment.pdf

Applications

Вам также может понравиться

Расследование

Часто задаваемые вопросы

Продукт предназначен только для исследовательских целей и не предназначен для терапевтического или диагностического использования на людях или животных. Продукты и содержимое защищены патентами, товарными знаками и авторскими правами, принадлежащими Yeasen Biotechnology. Символы товарных знаков указывают на страну происхождения, а не обязательно на регистрацию во всех регионах.

Для некоторых приложений могут потребоваться дополнительные права интеллектуальной собственности третьих лиц.

Йесен привержен этической науке, полагая, что наши исследования должны затрагивать важнейшие вопросы, обеспечивая при этом безопасность и соблюдение этических стандартов.