説明
Taq DNAポリメラーゼの非特異的増幅は、PCR実験でよく見られる問題であり、検出結果の解釈に直接影響を及ぼし、増幅感度の低下、さらには標的断片の収量減少につながる可能性があります。Taq DNAポリメラーゼの活性中心を室温で酵素修飾剤で密封し、室温でのTaq酵素のDNAポリメラーゼ活性を阻害することが、現在、非特異的増幅を抑制する最も効果的な方法です。Yeasenが開発したデュアルシーリング抗体は、Taq DNAポリメラーゼのポリメラーゼ活性を密封するだけでなく、同時にTaq DNAポリメラーゼのエキソヌクレアーゼ活性も密封します。このデュアルアプローチにより、プライマーミスペアリングやプライマーダイマーによる非特異的増幅を効果的に防止し、材料劣化による非特異的シグナルの発生も防止できるため、試薬の特異性を二重に高めることができます。これにより、検出試薬は輸送や室温での使用に容易に対応できます。
特徴
1.非常に高い増幅特異性 - 二重シール抗体はポリメラーゼとエキソヌクレアーゼの両方の活性を同時にシールできるため、非特異的増幅を効果的に回避し、特異性を高めます。
2.優れた検出感度 - ホットスタート方式により、低存在量の遺伝子を効果的に検出し、より高い感度を実現します。
3.優れた製品安定性 - 37°C に 5 日間、または 4°C に 10 日間置いても性能が安定します。
4.ベースラインの安定性と優れた直線性 - ベースラインドリフトの問題に対処し、優れた直線性を実現します。
5.酵素活性の急速な放出 - 95°C で 20 秒間加熱することで、95% 以上の酵素活性を放出できます。
6.酵素の幅広い適用性 - 野生型と変異型の両方の Taq 酵素に適しており、抗体 1 mg あたり 4 ~ 10 KU の Taq 酵素を封入できます。
1 Taq DNAポリメラーゼエキソヌクレアーゼ活性の阻害
合成プライマープローブを、シールされていないTaq DNAポリメラーゼと、二重封鎖抗体でシールされたTaq DNAポリメラーゼの反応混合物にそれぞれ導入し、40℃で反応を行った。両方の抗体の蛍光シグナルが検出され、二重封鎖抗体がTaq DNAポリメラーゼのエキソヌクレアーゼ活性を効果的にシールできることがわかった。
図 1. 二重シール抗体エンドヌクレアーゼ活性のシール効率の検出。
02 検出感度検証
Yeasenの二重密封抗体とT社の抗体をそれぞれ使用してTaq酵素を密封し、ARMS-PCR技術で陽性サンプルを検出したところ、Yeasenの二重密封抗体で密封されたTaq酵素は、ARMS-PCR増幅においてより高感度で正確であることがわかりました。
図2. ARMS-PCRの増幅曲線。
赤:YEASEN 抗体 + Taq、青:サプライヤー A 抗体 + Taq。
03 安定性検証(4℃で10日間、37℃で5日間)。
Taq DNAポリメラーゼをそれぞれ阻害する従来のクローズド抗体とダブルクローズド抗体を用いて、ポリメラーゼをプライマーとプローブを含む完全なプレミックス溶液に調製した。この溶液を4℃で10日間、または37℃で1、3、5日間放置した後、ASFプラスミド10,000コピーを増幅した。増幅曲線とCt値に有意な変化は見られなかった。
図 3. Taq ポリメラーゼを従来のブロッキング抗体 (A) と二重ブロック抗体 (B) でブロックした後、qPCR システムで増幅した 10,000 コピーの ASF プラスミドの増幅曲線。
04 ベースライン検出
特定のプライマーを特定のバッファーおよび機器と組み合わせて使用する特定の条件下では、ベースラインドリフトと呼ばれる現象が発生する可能性があります。しかし、ダブルクローズド抗体を使用することで、ベースラインドリフトの問題を効果的に解決し、より安定したベースラインを得ることができます。
図4. qPCR分析におけるSARS-CoV-2 N遺伝子(A)とACT遺伝子(B)の増幅曲線。
05 直線性検証
二重閉鎖抗体で密封した反応混合物を用いて、ASFV/ACTデュアルプラスミドを100,000、10,000、1,000、100コピー増幅し、標準曲線を作成しました。図7に示すように、いずれも良好な直線性を示しています。
図 5. 二重ブロック反応混合物を使用して生成された ASFV 遺伝子と ACT 遺伝子の標準曲線グラフ。
06 酵素活性放出アッセイ
Yeasen社の二重閉鎖抗体(カタログ番号31303)を用いてTaq酵素を封入し、95℃で20秒間の熱ショックを与えて酵素活性を検出しました。95℃で20秒間の熱ショック後、31303は酵素活性の95%以上を放出することが観察され、これはT社の抗体と同等です。
表 1. 酵素の 95°C で 20 秒間の熱ショック。
07 マルチプレックスTaqポリメラーゼ検出
Yeasen社の二重閉鎖抗体(カタログ番号31303)を用いて、3種類のTaqポリメラーゼ(野生型および2種類の変異型)を1μg/5Uの比率で封入し、蛍光値と封入効率を測定した。その結果、様々な種類のTaqポリメラーゼにおいて、Yeasen社の二重閉鎖抗体(カタログ番号31303)は良好な封入効果を示すことがわかった。
表 2. さまざまなタイプの Taq ポリメラーゼの阻害効率。
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