説明
このキットは、RNA 断片化試薬、逆転写試薬、従来型および鎖特異的な ds-cDNA 合成試薬、およびライブラリ増幅試薬を含む、Illumina および MGI シーケンシング プラットフォーム用のトータル RNAライブラリ調製キットです。 シーケンシングライブラリを構築した後、mRNA精製キット(カタログ番号12629)またはrRNA除去キット(カタログ番号122257またはカタログ番号12254)を使用することができます。2本鎖合成モジュールには、通常のライブラリ作成と鎖特異的ライブラリ作成のニーズに対応する2種類のバッファーが搭載されています。そのうち、鎖特異的2本鎖合成バッファーでは、dTTPがdUTPに置換されているため、cDNAの2本目の鎖にdUTPを添加できます。本キットに使用されている高忠実度DNAポリメラーゼは、ウラシルを含むDNAテンプレートを増幅することができず、鎖特異的な増幅を実現します。提供されるすべての試薬は厳格な品質管理と機能検証を受けており、ライブラリ作成の安定性と再現性を最大限に保証します。
特徴
- 簡素化されたプロセス: 2 鎖合成、末端修復、および A 付加が 1 つのステップに統合されています。
- 幅広い互換性: ストランド特異的および非ストランド特異的ライブラリに対応:dNTPまたはdUTP増幅を用いて、非ストランド特異的またはストランド特異的ライブラリを調製します。また、IlluminaおよびMGIライブラリにも対応:Illumina用プライマーミックスまたはMGI用プライマーミックスを使用することで、デュアルプラットフォーム互換性を実現します。
- 高品質なライブラリの準備:優れたシーケンスデータ品質により、転写領域の範囲がより均一になります。
仕様
カタログ番号 |
サイズ |
価格 |
12308ES24 |
24トン |
695 |
12308ES96 |
96トン |
2295 |
コンポーネント
コンポーネント番号 |
名前 |
12308 ES08 |
12308 ES2 4 |
12308 ES 96 |
12308 ES 98 |
|
12308-A |
|
2× フラグメント/プライムバッファー |
80μL |
250μL |
930μL |
9.7 mL |
12308-B |
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1st Strand酵素ミックス |
16μL |
48μL |
192μL |
2mL |
12308-C |
|
鎖特異性試薬 |
50μL |
150μL |
580μL |
6.042 mL |
12308-D |
|
2nd Strand バッファー (dNTP) |
240μL |
720μL |
2×1440μL |
30mL |
12308-E |
|
2nd Strand バッファー (dUTP) |
240μL |
720μL |
2×1440μL |
30mL |
12308-F |
|
2nd Strand 酵素マスターミックス |
40μL |
120μL |
480μL |
|
12308-G |
|
ライゲーションエンハンサー |
240μL |
720μL |
2×1440μL |
30mL |
12308-H |
|
新規T4 DNAリガーゼ |
40μL |
120μL |
480μL |
5mL |
12308-I |
|
2×スーパーカナーズTM IIハイファイミックス |
200μL |
600μL |
2×1200μL |
25mL |
12308-K |
|
ヌクレアーゼフリーH 2 O |
100μL |
300μL |
1000μL |
1000mL |
12308-* |
* |
プライマーミックス |
該当なし |
該当なし |
該当なし |
該当なし |
[注記] *:プライマーミックスは、アダプターが完成したライブラリー(ショートアダプターは不要)に必要な試薬ですが、本キットには含まれていないため、別途ご用意ください。本キットの構成はIlluminaおよびMGIプラットフォームの両方に対応していますが、IlluminaまたはMGI固有のプライマーミックス(Cat# 13335 Primer Mix for IlluminaおよびCat# 13334 Primer Mix for MGI)が別途必要です。 |
ワークフロー
配送と保管
この製品は-25~-15℃で1年間保管してください。
応用
RNA ライブラリの調製、LncRNA ライブラリの調製、M6A ライブラリの調製、トランスクリプトーム解析、遺伝子発現解析、選択的スプライシング解析、融合遺伝子の検出。
数字
1. RNA断片化条件の選択
断片化システムを最適化することで、本キットのmRNA断片化効果はより濃縮され、より優れた効果を発揮します。断片化条件は以下の通りです。
94℃ 5分: 400~500bp;
94℃ 7分: 350~400bp;
94℃ 10分: 250~300bp。

図1. 異なるRNA断片化条件下での断片サイズ分析
低品質のサンプル、高いライブラリ作成成功率

図 2. さまざまな DV200 ヒト FFPE RNA ライブラリの 500 ng 入力。
*DV200は、サンプル中に含まれる200ntを超えるRNA断片の割合を示します。FFPEサンプルが著しく劣化している場合、DV200値はサンプルの品質をより正確に反映します。
結論:
他のサプライヤーの N* と比較して、yeasen RNA ライブラリ調製キット: ライブラリ調製収量が高く、データ利用率が高く、rRNA 残留率が低く、エクソン比が高い。
鎖特異的なライブラリ調製、高い特異性
複数サンプルのシーケンスデータの高い一貫性
図3. 異なる開始量を持つサンプルのライブラリ調製と配列決定の一貫性(サンプルはヒトRNAサンプル)
安定性試験
図4. 凍結融解安定性(a)と室温安定性試験(b)
文書:
安全データシート
マニュアル
12308_マニュアル_Ver.EN20250523.pdf
引用と参考文献:
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M Li、H Liang、H Yang、Q Ding、R Xia、J Chen、W Zhou… - マイクロバイオーム、2024 IF:19.4
[2] プールされたCRISPRスクリーニングは癌の上皮間葉転換の抑制因子としてPボディを同定した
L Fang、L Zhang、M Wang、Y He、J Yang、Z Huang… - Cancer Research、2024 IF:12.7
[3] クロトー由来ペプチド1は転写後制御を介してクロトー発現を回復させることで線維性腎臓における細胞老化を阻害する
X Zhang、L Li、H Tan、X Hong、Q Yuan、FF Hou… - Theranostics、2024 IF:12.4
[4] 梗塞心筋修復のための外骨格部分被覆幹細胞
H He、Y Yuan、Y Wu、J Lu、X Yang、K Lu… - Advanced Materials、2023 IF: 29.4
[5] ワタ属Gossypiumの進化におけるゲノム革新と制御の再配線
M Wang、J Li、Z Qi、Y Long、L Pei、X Huang… - Nature Genetics、2022 IF:41.379
[6] MTMR3リスクアレルはIgA腎症におけるToll様受容体9誘導性IgA免疫を増強する
Y Wang、T Gan、S Qu、L Xu、Y Hu、L Liu、S Shi、J Lv… - Kidney International、2023 IF:19.6
[7] オフターゲット編集を最小限に抑えるための塩基編集の分割補完
X Xiong、K Liu、Z Li、FN Xia、XM Ruan、X He、JF Li - Nature Plants、2023 IF:18.6
[8] 腫瘍溶解性アデノウイルスを封入した人工細菌外膜小胞は、腫瘍細胞のオートファジーを増強することで癌ウイルス療法の有効性を高める。
W バン、M スン、H フアン、W フアン、S パン… - Nature Communications、2023 IF:16.6
[9] 癌細胞のIFNγに対する耐性は、二本鎖切断修復経路の活性の増強によって起こり得る
T Han、X Wang、S Shi、W Zhang、J Wang、Q Wu… - Cancer Immunology Research、2023 IF: 12.0
[10] 肝細胞癌におけるシスプラチン耐性を克服するための二重標的生体模倣ナノデリバリーシステムに基づく併用療法
Y Huang、Q Kou、Y Su、L Lu、X Li、H Jiang… - ナノバイオテクノロジージャーナル、2023 IF: 10.9
[11] PIAS3は肝細胞癌においてTGF-βシグナル経路を介してTXNIPを調節することによりフェロプトーシスを促進する
W Bao、J Wang、K Fan、Y Gao、J Chen - 薬理学研究、2023 IF:9.3
[12] サッカロミセス・セレビシエにおけるHyperTRIBEを用いたRNA結合タンパク質標的の同定
W Piao、C Li、P Sun、M Yang、Y Ding、W Song… - 国際分子科学ジャーナル、2023 IF:5.6
[13] 微生物叢はクラゲのライフサイクルの移行と刺胞細胞の動態を制御する
S Peng、L Ye、Y Li、F Wang、T Sun、L Wang、W Hao… - Iscience、2023 IF: 5.08
[14] トランスクリプトームとmiRNAプロファイルは「84K」ポプラの二次木部形成の制御ネットワークと主要な制御因子を明らかにする
H Wang、P Zhao、Y He、Y Su、X Zhou… - 国際分子科学ジャーナル、2023 IF:5.6
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よくある質問
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