एगरोज़ एक शुद्ध रैखिक गैलेक्टन हाइड्रोफिलिक कोलाइड है जिसे अगर या अगर-युक्त समुद्री शैवाल से निकाला जाता है। संरचनात्मक रूप से, यह β-D-गैलेक्टोपाइरानोसिल (1-4) से बना एक रैखिक बहुलक है जो 3,6-एनहाइड्रो-α-L-गैलेक्टोपाइरानोसिल अवशेषों से जुड़ा हुआ है। जेल अभिकर्मक के रूप में, इसका उपयोग आमतौर पर जेल वैद्युतकणसंचलन या ब्लॉटिंग विधियों (जैसे उत्तरी या दक्षिणी) के माध्यम से नियमित न्यूक्लिक एसिड विश्लेषण के लिए किया जाता है, और यह प्रोटीन अनुप्रयोगों के लिए भी उपयुक्त है, जैसे कि रेडियल इम्यूनोडिफ्यूजन (RID) प्रयोग।
एगरोज़ जेल वैद्युतकणसंचलन एक इलेक्ट्रोफोरेटिक विधि है जो जेल की तैयारी, नमूना लोडिंग और वैद्युतकणसंचलन सहित सहायक माध्यम के रूप में एगरोज़ का उपयोग करती है। अन्य सहायक सामग्री वैद्युतकणसंचलन से विश्लेषण सिद्धांत में मुख्य अंतर यह है कि इसमें "आणविक छलनी" और "वैद्युतकणसंचलन" की दोहरी भूमिका होती है। जब जेल को विद्युत क्षेत्र में रखा जाता है, तो आवेशित न्यूक्लिक एसिड जेल के छिद्रों से होकर धनात्मक ध्रुव की ओर चले जाते हैं। उचित समय के लिए विभिन्न परिस्थितियों में वैद्युतकणसंचलन के बाद, विभिन्न आकारों और संरचनाओं के न्यूक्लिक एसिड के टुकड़े जेल में विभिन्न स्थानों पर स्थित होंगे, इस प्रकार पृथक्करण प्राप्त होगा।

चित्र 1 न्यूक्लिक एसिड इलेक्ट्रोफोरेसिस प्रयोग संचालन के चरण

चित्र.2 वैद्युतकणसंचलन प्रवास दिशा आरेख

सही एगरोज़ का चयन कैसे करें?

एगरोज़ के बुनियादी मापदंडों के आधार पर निर्णय लें:

सल्फेट सामग्री - शुद्धता का एक संकेतक;
जेल शक्ति - जेल को तोड़ने के लिए आवश्यक बाहरी बल;
जेल बिंदु - वह तापमान जिस पर पानी में घुलनशील एगरोज़ घोल ठंडा होने पर जेल बनाता है;
इलेक्ट्रोएन्डोस्मोसिस (ईईओ) — इलेक्ट्रोकाइनेटिक गति का एक प्रकार जिसमें तरल पदार्थ जेल में प्रवेश करते हैं। एगरोज़ जेल के भीतर एनायनिक समूह मैट्रिक्स पर सोख लेते हैं और पलायन नहीं करते हैं, लेकिन विघटित धनायन नकारात्मक ध्रुव की ओर पलायन करेंगे, जिससे इलेक्ट्रोओस्मोसिस उत्पन्न होगा। चूँकि नमूनों का इलेक्ट्रोफोरेटिक प्रवास आमतौर पर सकारात्मक ध्रुव की ओर बढ़ता है, इसलिए EEO के कारण होने वाला आंतरिक संवहन पृथक्करण दक्षता में बाधा उत्पन्न कर सकता है। एगरोज़ के बुनियादी मापदंडों के आधार पर, एक उच्च गुणवत्ता वाले एगरोज़ जेल में स्पष्ट छिद्र होने चाहिए, टूटने की संभावना कम होनी चाहिए, और इसमें उच्च शुद्धता (कम सल्फेट सामग्री), उच्च जेल शक्ति, अपेक्षाकृत उच्च जेल बिंदु (कमरे के तापमान पर त्वरित जमना) और कम EEO जैसी विशेषताएँ होनी चाहिए।

एगरोज़ की पृथक्करण सीमा के आधार पर निर्णय लें:

एगरोज़ जैल में पृथक्करण की एक विस्तृत सीमा होती है और इसका उपयोग आमतौर पर डीएनए जेल रिकवरी, डीएनए पृथक्करण और यह पुष्टि करने के लिए किया जाता है कि क्या डीएनए पुनर्संयोजित है, और क्या प्लास्मिड और इस तरह के अन्य पदार्थ खुले हुए हैं। लक्ष्य टुकड़ों के विभिन्न आकार एगरोज़ की विभिन्न सांद्रता के अनुरूप होते हैं। इस सिद्धांत के अनुसार कि उच्च सांद्रता छोटे टुकड़ों को अलग करने के लिए उपयुक्त है, आप अपनी आवश्यकताओं के अनुरूप इष्टतम जेल सांद्रता खोजने के लिए निम्न तालिका का संदर्भ ले सकते हैं।

एगरोज़ सांद्रता (%)	≥3	2-3	1-2	0.7-1	≤0.7
डीएनए खंड का आकार (बीपी)	≤200	200-700	700-1500	1500-5000	≥5000

येसेन उच्च गुणवत्ता वाला एगरोज़ - आपकी आवश्यकताओं को पूरा करने के लिए विभिन्न अनुप्रयोग परिदृश्यों को कवर करता है

प्रोडक्ट का नाम	उत्पाद संख्या	उत्पाद विशिष्टता	अनुप्रयोग परिदृश्य
अगारोज़	10208ईएस60/76	100 ग्राम / 500 ग्राम	नियमित न्यूक्लिक एसिड वैद्युतकणसंचलन

उत्पाद लाभ

कम इलेक्ट्रोएंडोस्मोसिस (EEO ≤ 0.13), जिसके परिणामस्वरूप उत्कृष्ट बैंड पृथक्करण, स्पष्ट विभेदन और तीव्र प्रवास होता है।

चित्र.3 विभिन्न सांद्रता वाले जैल का वैद्युतकणसंचलन आरेख

नोट: 0.75% एगरोज़ जेल 1 के साथ लोड किया गया केबी सीढ़ी; 1% एगरोज़ जेल 100 बीपी सीढ़ी के साथ भरी हुई, 1 केबी सीढ़ी, 2000 डीएनए मार्कर, 5000 डीएनए मार्कर; 2% एगरोज़ जेल 100 बीपी लैडर, 2000 डीएनए मार्कर, 5000 डीएनए मार्कर के साथ लोड किया गया। नमूना मात्रा: मार्कर शुद्ध तरल 2 μL 5 बार पतला किया गया और फिर 10 μL भरा गया। 0.75%, 1%, और 2% एगरोज़ जैल के लिए इलेक्ट्रोफोरेसिस कार्यक्रम हैं: 115 वी 45 मिनट के लिए; 130 वी 40 मिनट के लिए; 130 50 मिनट तक वी.

जेल छिद्र स्पष्ट और सीधे होते हैं, उनमें उच्च जेल शक्ति होती है तथा टूटने की संभावना कम होती है।

नोट: यह चित्र YEASEN का एक उत्पाद प्रदर्शन है अगारोज़ (कैट#10208ES60).

उच्च गुणवत्ता वाले एगरोज़ उपयोग विधि

एगरोज़ जेल की सांद्रता आमतौर पर 0.7% और 2% के बीच चुनी जाती है। सांद्रता जितनी अधिक होगी, जेल के आणविक छिद्र का आकार उतना ही छोटा होगा, डीएनए माइग्रेशन दर उतनी ही धीमी होगी, और रिज़ॉल्यूशन उतना ही अधिक होगा। इसके विपरीत, सांद्रता जितनी कम होगी, डीएनए माइग्रेशन दर उतनी ही तेज़ होगी, और रिज़ॉल्यूशन उतना ही कम होगा। विभिन्न प्रयोगात्मक उद्देश्यों के आधार पर उपयुक्त जेल सांद्रता और संगत इलेक्ट्रोफोरेसिस बफर चुनें।

एगरोज़ सांद्रता	प्रभावी पृथक्करण सीमा (बीपी)	अनुशंसित बफर
0.5%	2,000-50,000	1×टीएई
0.8%	800-10,000	1×टीएई
1.0%	400-8,000	1×टीएई
1.2%	300-7,000	1×टीएई
1.5%	200-3,000	1×टीएई/0.5×टीबीई
2.0%	100-2,000	1×टीएई/0.5×टीबीई
3.0%	25-1,000	0.5×टीबीई

टीएई बफर: TAE बफर में एसिटिक एसिड, EDTA और ट्रिस होते हैं, जो तेजी से इलेक्ट्रोफोरेसिस और बड़े डीएनए टुकड़ों को अलग करने के लिए उपयुक्त हैं। एसिटिक एसिड की उपस्थिति जेल के pH मान को कम करती है, जिससे इलेक्ट्रोफोरेसिस की गति को बढ़ाने में मदद मिलती है।

टीबीई बफर:टीबीई बफर में बोरिक एसिड, ईडीटीए और ट्रिस होते हैं, जिनमें उच्च आयन शक्ति होती है, जो छोटे डीएनए टुकड़ों के उच्च-रिज़ॉल्यूशन पृथक्करण के लिए उपयुक्त है। बोरेट आयनों की उपस्थिति जेल की स्थिरता को बढ़ाती है, जिससे पृथक्करण दक्षता में सुधार करने में मदद मिलती है। इसलिए, जब जेल की सांद्रता अधिक होती है, तो बैंड के पृथक्करण को सुविधाजनक बनाने के लिए टीबीई बफर का उपयोग किया जाना चाहिए।

प्रकाशित साहित्य (आंशिक)

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उत्पाद स्थिति	प्रोडक्ट का नाम	उत्पाद संख्या	उत्पाद विशिष्टता	अनुप्रयोग परिदृश्य
न्यूक्लिक एसिड दाग	येआर्ड न्यूक्लिक एसिड जेल स्टेन (पानी में 10,000×)	10202ES76	500 μएल	जल में घुलनशील, EB के समान वर्णक्रमीय विशेषताओं के साथ, 300 एनएम यूवी प्रकाश उत्तेजना के तहत पता लगाया गया।
डीएनए मार्कर	गोल्डबैंड DL2000 डीएनए मार्कर	10501ईएस60/80	100 टी/10×100 टी	100-2000 बी.पी.
	गोल्डबैंड DL5000 डीएनए मार्कर	10504ईएस60/80	100 टी/10×100 टी	100-5000 बी.पी.
	गोल्डबैंड 100बीपी डीएनए लैडर	10507ईएस60/80	100 टी/10×100 टी	100-1,500 बीपी
	गोल्डबैंड 1 केबी डीएनए लैडर	10510ईएस60/80	100 टी/10×100 टी	250-12,000 बीपी

Yeasen agarose- सीधे वैद्युतकणसंचलन दर्द बिंदुओं को संबोधित करते हुए, एक अच्छा जेल चला रहा है