全トランスクリプトーム研究
[全トランスクリプトームシークエンシング - 非コードRNAとmRNA間の標的制御および相互作用関係の研究]
全トランスクリプトームハイスループットシーケンシングは、リボソーム除去鎖特異的ライブラリ構築法と小断片エンリッチメントスクリーニングライブラリ構築法を採用しており、コーディングRNAとノンコーディングRNAのライブラリ構築、シーケンシング、情報解析、ceRNAの統合解析などを実現しています。これにより、特定の生物学的プロセス（発達、疾患など）に関連する全RNAトランスクリプトデータ情報を迅速かつ包括的かつ正確に取得できます。データ解析を通じて、生物学的調節機構の研究を「ネットワークとマルチレベル」を組み合わせた3次元モデルへと拡張し、生物学的現象の包括的解釈に役立ちます。
全トランスクリプトームシーケンスには 2 つの方法があります。1 つは LncRNA-Seq + Small RNA であり、もう 1 つは LncRNA-Seq + Small RNA + CircRNA であり、後者は CircRNA のより包括的な情報を取得できます。
1. 2つのライブラリを用いた全トランスクリプトームシーケンス：LncRNA-Seq + Small RNA
2. 3つのライブラリを用いた全トランスクリプトームシーケンス：LncRNA-Seq + Small RNA + CircRNA
全トランスクリプトーム原材料ソリューション
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分類 |
動物カテゴリー |
植物カテゴリー |
細菌および真菌カテゴリー |
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サンプルタイプ |
動物組織/細胞 |
細胞 |
全血 |
植物組織 |
真菌組織 |
培養された細菌と真菌 |
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RNA抽出 |
磁気ビーズ法: 18605/18607/18606; カラム法: 19221/19211; トリゾール法：10606/19202 |
磁気ビーズ法：18600/18604；カラム法：19231 |
列方式: 19241; トリゾール法：19201 |
磁気ビーズ法：18534/18535/18537；カラム法：19291ES/19292ES |
磁気ビーズ法：18534/18535/18537；カラム法：19291ES/19292ES |
カラム法：19301（真菌にはリゾチーム10403を加える必要がある） |
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miRNA抽出 |
列法：19331 |
列法：19331 |
列法：19332 |
列法：19331 |
— |
— |
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miRNAライブラリ構築 |
予想通り |
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rRNA除去 |
RNase H酵素除去：12257；3分間迅速除去：12258（ヒト由来除去）；磁気ビーズ法除去：12266（哺乳類汎用型）／12267 鳥類汎用型／12268 家禽／12269 ゼブラフィッシュ／12270 ショウジョウバエ／12275 カキ／12278 プラナリア／12285 ハチ／12286 キンイロクモ／12289 マダニ／12290 ヒトスジシマカ／12287 線虫 |
RNase H酵素除去：12257；3分間迅速除去：12258（ヒト除去、病原体に適しています） |
グロビン除去を含むRNase H酵素除去：12257 + 12806；グロビンのRNase H酵素除去：13572；3分間の迅速除去：12258 + 12260 |
RNase H酵素除去：12254；磁気ビーズ法除去：12262被子植物 |
磁気ビーズ法除去：12271菌類汎用型 |
磁気ビーズ法による除去：12264 細菌ユニバーサルタイプ/12265 原核生物ユニバーサルタイプ |
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図書館建設 |
非プレミックス RNA ライブラリ構築キット: 12308 デュアルモード RNA ライブラリ構築キット (Illumina および MGI と互換性あり)。 プレミックスRNAライブラリ構築キット：12310デュアルモードRNAライブラリ構築キット（イルミナおよびMGIと互換性あり）/12340（アクチノマイシンD、dUTPなし）/12341（アクチノマイシンD、dTTPなし） |
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LncRNA研究
長鎖ノンコーディングRNA（LncRNA）は、近年大きな注目を集めている、独特の調節機能を持つノンコーディングRNAの一種です。LncRNAの長さは200塩基以上で、タンパク質をコードせず、種間の保存性も低いです。配列構造にはmRNAに類似するもの（ポリAテールや選択的スプライシングを含む）もあれば、これらの特徴を持たないものもあります。現在、LncRNAの生成と機能メカニズムは未だ完全には解明されていませんが、重要な生物学的機能（がんの発生、X染色体のサイレンシング、他の調節因子との複雑な調節ネットワークの形成など）を持つLncRNAが数多く発見されています。
LncRNAシーケンシングの技術的ルート
LncRNAシーケンシング原料溶液
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分類 |
動物カテゴリー |
植物 カテゴリ |
細菌および真菌カテゴリー |
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サンプルタイプ |
動物組織/細胞 |
細胞 |
全血 |
植物組織 |
真菌組織 |
培養された細菌と真菌 |
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RNA抽出 |
磁気ビーズ法：18605/18607/18606；カラム法：19221/19211；トリゾール法：10606/19202 |
磁気ビーズ法：18600/18604；カラム法：19231 |
カラム法：19241；トリゾール法：19201 |
磁気ビーズ法：18534/18535/18537；カラム法：19291ES/19292ES |
磁気ビーズ法：18534/18535/18537；カラム法：19291ES/19292ES |
カラム法: 19301 (菌類にはlywallzyme 10403を追加する必要があります) |
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rRNA除去 |
RNase H酵素除去：12257；3分間迅速除去：12258（ヒト由来除去）；磁気ビーズ法除去：12266（哺乳類汎用型）／12267 鳥類汎用型／12268 家禽／12269 ゼブラフィッシュ／12270 ショウジョウバエ／12275 カキ／12278 プラナリア／12285 ハチ／12286 キンイロクモ／12289 マダニ／12290 ヒトスジシマカ／12287 線虫 |
RNase H酵素除去：12257；3分間迅速除去：12258（ヒト除去、病原体に適しています） |
グロビン除去を含むRNase H酵素除去：12257 + 12806；グロビンのRNase H酵素除去：13572；3分間の迅速除去：12258 + 12260 |
RNase H酵素除去：12254；磁気ビーズ法除去：12262被子植物 |
磁気ビーズ法除去：12271菌類汎用型 |
磁気ビーズ法による除去：12264 細菌ユニバーサルタイプ/12265 原核生物ユニバーサルタイプ |
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図書館建設 |
非プレミックス RNA ライブラリ構築キット: 12308 デュアルモード RNA ライブラリ構築キット (Illumina および MGI と互換性あり)。 プレミックスRNAライブラリ構築キット：12310デュアルモードRNAライブラリ構築キット（イルミナおよびMGIと互換性あり）/12340（アクチノマイシンD、dUTPなし） |
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真核生物トランスクリプトーム研究
真核生物のトランスクリプトーム研究では、RNA-seq技術を用いて、特定の細胞が特定の機能状態において転写できるmRNAの総量を取得します。その後、ダウンロードした生データをスプライシング・アセンブルし、遺伝子発現レベルを計測し、差異解析と機能エンリッチメント解析を実施します。これにより、生物種の大部分の遺伝子情報が得られるだけでなく、遺伝子発現の差異や機能経路の変化を全体レベルで研究し、特定の生物学的プロセスの分子メカニズムを解明することができます。
真核生物トランスクリプトームシークエンシングの技術的ルート
真核生物トランスクリプトームシークエンシング原料溶液
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分類 |
動物カテゴリー |
植物カテゴリー |
真菌カテゴリー |
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サンプルタイプ |
動物組織/細胞 |
細胞 |
全血 |
植物組織 |
真菌組織 |
培養菌類 |
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RNA抽出 |
磁気ビーズ法：18605/18607/18606；カラム法：19221/19211；トリゾール法：10606/19202 |
磁気ビーズ法：18600/18604；カラム法：19231 |
カラム法：19241；トリゾール法：19201 |
磁気ビーズ法：18534/18535/18537；カラム法：19291ES/19292ES |
磁気ビーズ法：18534/18535/18537；カラム法：19291ES/19292ES |
カラム法：19301（リゾチーム10403を添加） |
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mRNAキャプチャ |
12629 mRNA分離マスターキット |
12629 mRNA分離マスターキット |
12629 mRNA分離マスターキット |
12629 mRNA分離マスターキット |
12629 mRNA分離マスターキット |
12629 mRNA分離マスターキット |
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図書館建設 |
非プレミックスRNAライブラリキット：12308デュアルモードRNAライブラリキット（イルミナおよびMGI互換） mRNAキャプチャー機能付き非プレミックスRNAライブラリキット：12309デュアルモードRNAライブラリキット（イルミナおよびMGI互換） プレミックスRNAライブラリキット：12310デュアルモードRNAライブラリキット（イルミナおよびMGI互換）/12340（アクチノマイシンD、dUTPなし） |
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circRNA研究
[circRNAシーケンシング - circRNAの発現差が生物学的プロセスに与える影響に関する研究]
環状RNA（circRNA）は、特殊なタイプの非コードRNA解析です。シーケンシングプラットフォームを用いてシーケンシングを実施することで、参照ゲノムを持つサンプルのcircRNAを正確に同定し、その起源遺伝子を解析します。circRNAシーケンシングは、医療および農業研究分野でますます広く利用されています。ハイスループットシーケンシングを基盤とし、主流のデータベースとcircRNA同定ソフトウェアを活用することで、プロジェクト対象生物種のcircRNA情報を解析し、転写制御におけるcircRNAの重要な機能を深く探究します。
circRNA研究原料ソリューション
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分類 |
動物カテゴリー |
植物カテゴリー |
細菌および真菌カテゴリー |
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サンプルタイプ |
動物組織/細胞 |
細胞 |
全血 |
植物組織 |
真菌組織 |
培養された細菌と真菌 |
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RNA抽出 |
磁気ビーズ法：18605/18607/18606；カラム法：19221/19211；トリゾール法：10606/19202 |
磁気ビーズ法：18600/18604；カラム法：19231 |
カラム法：19241；トリゾール法：19201 |
磁気ビーズ法：18534/18535/18537；カラム法：19291ES/19292ES |
磁気ビーズ法：18534/18535/18537；カラム法：19291ES/19292ES |
カラム法: 19301 (真菌にはリゾチーム10403を追加する必要がある) |
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rRNA除去 |
RNase H酵素除去：12257；3分間迅速除去：12258（ヒト由来除去）；磁気ビーズ法除去：12266（哺乳類汎用型）／12267 鳥類汎用型／12268 家禽／12269 ゼブラフィッシュ／12270 ショウジョウバエ／12275 カキ／12278 プラナリア／12285 ハチ／12286 キンイロクモ／12289 マダニ／12290 ヒトスジシマカ／12287 線虫 |
RNase H酵素除去：12257；3分間迅速除去：12258（ヒト除去、病原体に適しています） |
グロビン除去を含むRNase H酵素除去：12257 + 12806；グロビンのRNase H酵素除去：13572；3分間の迅速除去：12258 + 12260 |
RNase H酵素除去：12254；磁気ビーズ法除去：12262被子植物 |
磁気ビーズ法除去：12271菌類汎用型 |
磁気ビーズ法による除去：12264 細菌ユニバーサルタイプ/12265 原核生物ユニバーサルタイプ |
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直鎖RNAの消化 |
14606 線状RNA分子を除去するRNase R |
14606 線状RNA分子を除去するRNase R |
14606 線状RNA分子を除去するRNase R |
14606 線状RNA分子を除去するRNase R |
14606 線状RNA分子を除去するRNase R |
14606 線状RNA分子を除去するRNase R |
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図書館建設 |
非プレミックス RNA ライブラリ構築キット: 12308 デュアルモード RNA ライブラリ構築キット (Illumina および MGI と互換性あり)。 プレミックスRNAライブラリ構築キット：12310デュアルモードRNAライブラリ構築キット（イルミナおよびMGIと互換性あり）/12340（アクチノマイシンD、dUTPなし） |
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メタトランスクリプトーム
[メタトランスクリプトーム - 微小生態環境における活性微生物の動的変化を捉える]
メタトランスクリプトームシーケンシング：特定の環境における全ゲノムの転写と制御ルールを全体レベルで研究する。微小生態環境中の全RNAを研究対象とし、ハイスループットシーケンシングと組み合わせることで、複雑な微生物群集の変化を転写レベルで研究し、役割を果たす活性遺伝子を探索する。
メタトランスクリプトーム研究原料ソリューション
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サンプルタイプ |
培養された細菌と真菌 |
臨床サンプル |
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RNA抽出 |
カラム法: 19301 (菌類にはlywallzyme 10403を追加する必要があります) |
カラム法：19321（ウイルスDNA/RNA抽出）；磁気ビーズ法：18521（ウイルスDNA/RNA抽出）；18306（病原体DNA/RNA抽出） |
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rRNA除去 |
3分間の迅速な除去：12258（人為的除去） |
3分間の迅速な除去：12258（人為的除去） |
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図書館建設 |
オプション1. Total RNAライブラリ構築：12308ESデュアルモードRNAライブラリ構築キット（IlluminaおよびMGIと互換性あり）; オプション2. cDNA酵素消化ライブラリ構築：13488ES cDNA合成モジュール + 12316ES迅速酵素消化ライブラリ構築キット |
オプション1. Total RNAライブラリ構築：12308ESデュアルモードRNAライブラリ構築キット（IlluminaおよびMGIと互換性あり）; オプション2. cDNA酵素消化ライブラリ構築：13488ES cDNA合成モジュール + 12316ES迅速酵素消化ライブラリ構築キット |
製品の推奨
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製品名 |
カタログ番号 |
仕様 |
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12340ES24/96 |
24トン/ 96トン |
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12341ES24/96 |
24トン/ 96トン |
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12308ES24/96 |
24トン/ 96トン |
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Hieff NGS TM Ultima デュアルモード RNA ライブラリ調製キット（プレミックス版） |
12310ES24/96 |
24トン/ 96トン |
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12629ES24/96 |
24トン/ 96トン |
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12257ES24/96 |
24トン/ 96トン |
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12254ES24/96 |
24トン/ 96トン |
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Hieff NGS TMワンステップ rRNA 除去キット(ヒト、100-1,000 ng) |
12258ES24/96 |
24トン/ 96トン |
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ヒーフNGS TM MagSP rRNA除去キット（細菌（G-およびG+））精製ビーズ付き |
12264ES24/96 |
24トン/ 96トン |