아가로스는 한천 또는 한천을 함유하는 해조류에서 추출한 정제된 선형 갈락탄 친수성 콜로이드입니다. 구조적으로 β-D-갈락토피라노실(1-4)이 3,6-안하이드로-α-L-갈락토피라노실 잔기에 결합된 선형 중합체입니다. 겔 시약으로서, 겔 전기영동이나 블로팅(예: 노던 또는 서던)을 통한 일상적인 핵산 분석에 일반적으로 사용되며, 방사성 면역확산(RID) 실험과 같은 단백질 분석에도 적합합니다.
아가로스 겔 전기영동은 아가로스를 지지매질로 사용하는 전기영동법으로, 겔 준비, 시료 로딩, 그리고 전기영동을 포함합니다. 다른 지지매질 전기영동과 분석 원리의 주요 차이점은 "분자체"와 "전기영동"의 이중 역할을 한다는 것입니다. 겔을 전기장에 놓으면, 하전된 핵산이 겔 기공을 통해 양극으로 이동합니다. 다양한 조건에서 적절한 시간 동안 전기영동을 수행하면, 크기와 형태가 다른 핵산 단편들이 겔 내 다른 위치에 위치하게 되어 분리가 이루어집니다.
그림 1 핵산 전기영동 실험 작업 단계
그림 2 전기영동 이동 방향 다이어그램
올바른 아가로스를 선택하는 방법은?
아가로스의 기본 매개변수를 기준으로 판단합니다.
- 황산염 함량 - 순도의 지표
- 겔 강도 - 겔을 분해하는 데 필요한 외부 힘
- 겔화점 - 수용성 아가로스 용액이 냉각되어 겔을 형성하는 온도.
- 전기삼투(EEO)는 액체가 겔 내부로 침투하는 일종의 동전기 운동입니다. 아가로스 겔 내부의 음이온 그룹은 기질에 흡착되어 이동하지 않지만, 해리된 양이온은 음극으로 이동하여 전기삼투를 발생시킵니다. 전기영동에 의한 시료의 이동은 일반적으로 양극으로 이동하기 때문에, EEO로 인한 내부 대류는 분리 효율을 저해할 수 있습니다. 아가로스의 기본 특성에 따라, 고품질 아가로스 겔은 기공이 투명하고, 깨지기 쉬우며, 높은 순도(낮은 황산염 함량), 높은 겔 강도, 비교적 높은 겔점(실온에서 빠른 응고), 낮은 EEO와 같은 특성을 가져야 합니다.
아가로스의 분리 범위를 기준으로 판단:
아가로스 겔은 넓은 분리 범위를 가지며, DNA 겔 회수, DNA 분리, 그리고 DNA 재조합 여부와 플라스미드 등의 절단 여부를 확인하는 데 널리 사용됩니다. 표적 단편의 크기에 따라 아가로스 농도도 달라집니다. 고농도의 아가로스 겔은 작은 단편을 분리하는 데 적합하다는 원리에 따라, 아래 표를 참조하여 필요에 맞는 최적의 겔 농도를 찾을 수 있습니다.
|
아가로스 농도 ( % ) |
≥3 |
2-3 |
1-2 |
0.7-1 |
≤0.7 |
|
DNA 단편 크기(bp) |
≤200 |
200-700 |
700-1500 |
1500-5000 |
≥5000 |
YEASEN 고품질 아가로스 - 귀하의 요구 사항을 충족하는 다양한 응용 시나리오를 포괄합니다.
|
제품명 |
제품 번호 |
제품 사양 |
응용 프로그램 시나리오 |
|
10208ES60/76 |
100g / 500g |
일상적인 핵산 전기영동 |
제품의 장점
낮은 전기침투(EEO ≤ 0.13)로 인해 밴드 분리가 우수하고 구별이 명확하며 이동이 빠릅니다.
젤 모공은 투명하고 곧으며, 젤 강도가 높고 깨질 가능성이 적습니다.
아가로스 사용 방법
아가로스 겔의 농도는 일반적으로 0.7%에서 2% 사이로 선택합니다. 농도가 높을수록 겔의 분자 기공 크기가 작아지고 DNA 이동 속도가 느려지며 분리능이 높아집니다. 반대로 농도가 낮을수록 DNA 이동 속도가 빨라지고 분리능이 낮아집니다. 다양한 실험 목적에 따라 적절한 겔 농도와 호환되는 전기영동 완충액을 선택하십시오.
|
아가로스 농도 |
효과적인 분리 범위(bp) |
권장 버퍼 |
|
0.5% |
2,000~50,000 |
1×태이 |
|
0.8% |
800-10,000 |
1×태이 |
|
1.0% |
400-8,000 |
1×태이 |
|
1.2% |
300-7,000 |
1×태이 |
|
1.5% |
200~3,000 |
1×TAE/0.5×TBE |
|
2.0% |
100~2,000 |
1×TAE/0.5×TBE |
|
3.0% |
25-1,000 |
0.5×TBE |
출판된 문헌(일부)
- Li Z, Wang M, Fang H 외. 나노플라스틱에 의해 유도된 항생제 내성 플라스미드의 고체-액체 계면 흡착은 수생태계의 유전자 오염을 악화시킨다. Environ Pollut. 2023. doi:10.1016/j.envpol.2022.120456. IF=10.366(10208ES)
- Wang M, Zhang S, Zheng G 외. Card14의 기능 획득 돌연변이는 IL-17A에 대한 각질형성세포 반응 증가를 통해 자발적인 건선 유사 피부 염증을 유발한다. Immunity. 2018;49(1):66-79.e5. doi : 10.1016/j.immuni.2018.05.012. IF =19.734
- Zhang Y, Ding H, Wang X 외. MK2는 β-TrCP 유비퀴틴 리가제를 통해 Tfcp2l1 분해를 촉진하여 마우스 배아줄기세포의 자가재생을 조절한다. Cell Rep. 2021;37(5):109949. doi:10.1016/j.celrep.2021.109949. IF =9. 423
- Zhu Z, Zhang L, Sheng R, Chen J. 미세유체 기반 양이온성 콜레스테롤 지질 siRNA 전달 나노시스템: 고효율 체외 유전자 침묵 및 세포 내 거동. Int J Mol Sci. 2022;23(7):3999. 2022년 4월 3일 출판 . doi:10.3390/ijms23073999. IF =19.924
- Zhao C, Yang D, Ye Y 외. LT-171-861에 의한 Pim-2 키나제 억제는 DNA 손상을 촉진하고, PARP 억제제와 병용 시 다발성 골수종에서 치사 효과가 증가함을 보였다. Biochem Pharmacol. 2021;190:114648. doi:10.1016/j.bcp.2021.114648. IF = 5.858
- Yu J, Yang W, Xing S 외. 아스코르브산의 형광 및 자기공명 분석을 위한 금/MnO2@BSA 혼합 나노입자. Mikrochim Acta. 2019;186(2):89. 2019년 1월 10일 게재. doi:10.1007/s00604-018-3205-8. IF = 5.479
- Zheng X, Xu W, Sun R, Yin H, Dong C, Zeng H. 티오레독신 환원효소 억제제인 에타셀렌과 셀레나이트나트륨의 인간 비소세포성 폐암 세포의 증식 억제 및 사멸 유도에 대한 상승효과. Chem Biol Interact. 2017;275:74-85. doi:10.1016/j.cbi.2017.07.020. IF =5. 194
- Zhou J, Xiong R, Zhou J 외. 담배 발암물질인 NNK에 의해 유도된 인간 기관지 상피세포 Beas-2B의 악성 형질전환에 m6A 조절인자 IGF2BP1의 관여. Toxicol Appl Pharmacol. 2022;436:115849. doi:10.1016/j.taap.2021.115849. IF =5. 219
- Zhou Y, Liu J, Cai S, Liu D, Jiang R, Wang Y. 진세노사이드 Rg1의 노화된 Sca-1⁺ 조혈세포 보호 효과. Mol Med Rep. 2015;12(3):3621-3628. doi:10.3892/mmr.2015.3884. IF = 5.952
관련 제품 선택 가이드
|
제품 포지셔닝 |
제품명 |
제품 번호 |
제품 사양 |
응용 프로그램 시나리오 |
|
핵산 염색 |
10202ES76 |
500 μL |
수용성이며 EB와 동일한 분광 특성을 가지고 있으며 300nm UV 광 여기에서 검출됩니다. |
|
|
DNA 마커 |
10501ES60/80 |
100톤/10×100톤 |
100~2000bp |
|
|
10504ES60/80 |
100톤/10×100톤 |
100-5000bp |
||
|
10507ES60/80 |
100톤/10×100톤 |
100~1,500bp |
||
|
10510ES60/80 |
100톤/10×100톤 |
250-12,000bp |
확장된 독서
YEASEN Rapid PCR Mix: 3kb 콜로니 PCR은 1초/kb의 빠른 속도와 최대 100%의 검출률을 자랑합니다!