Hieff™ 多用途 T4 DNA リガーゼ (600 U/µL) - 耐熱性および高忠実度 12996ES

YeasenSKU: 12996ES60

サイズ: 60 区
価格:
販売価格$175.00

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説明

ハイフ™ 多用途性T4 DNAリガーゼは、T4 DNAリガーゼのバリアントです。この酵素は、粘着末端または平滑末端分子間のライゲーション反応を触媒するのに適しています。次世代シーケンシング(NGS)におけるライブラリ調製プロセスにおいて、DNA断片とアダプターを連結するために設計された単酵素製品です。Hieff® Versatility T4 DNA リガーゼは、ハイスループット シーケンシングを通じて広範囲に検証されており、優れた品質を示します。

特徴

  • 高忠実度
  • 耐熱性

多用途T4 DNAリガーゼの開発について詳しくはこちら

仕様

ソース 組み換え大腸菌
ストレージバッファ 50 ミリメートル トリス塩酸塩1,100 mM KC1,0.1 mM EDTA、1 mM DTT、50%グリセロール、pH 7.50.2 @25℃
ユニット定義 20μLのライゲーション反応系において、6μgのλDNA-Hind IIIを16℃で30分間反応させたときに、50%以上のDNA断片のライゲーションを触媒するのに必要な酵素量を1活性単位(U)と定義する。

コンポーネント

コンポーネント 名前

12996ES60

60KU 

12996ES62

600KU 

12996-A ハイフ® 多用途T4 DNAリガーゼ(600 U/µL) 100μL 1000μL
12996-B 10×T4 DNAリガーゼバッファー 500μL 3×1500μL

ストレージ

この製品は-25~-15℃で2年間保管してください。 年。

図1. Versatility T4 DNAリガーゼの進化を示しています。(A) T4 DNAリガーゼの合理的な設計。(B) 45℃での耐熱性T4 DNAリガーゼ変異体のスクリーニング。比活性が大幅に向上した変異体を特定しました。(C) DNAライブラリ調製中のアダプターダイマー形成を減らすことを目的としたT4 DNAリガーゼ変異体のスクリーニング。(D) DNAライブラリ調製法を使用して42℃で1時間熱処理した後のライブラリ収量保持の評価。


表1. Yeasen Versatile T4 DNAリガーゼは耐熱性がある。酵素を30℃で5日間処理し、DNA Lib Prep法で分析した。

図 2. Yeasen Versatile T4 DNA リガーゼは、自己ミスライゲーションによるアダプターダイマー形成が少ないことから忠実度が高く (A)、DNA Lib Prep 法で分析されています (B)。

図 3. Yeasen Versatile T4 DNA リガーゼは、DNA Lib Prep 法で分析した他のブランドの T4 リガーゼと比較して、アダプター ダイマーの形成が少なく、忠実度が高いことが示されています。

図4. Versatile T4 DNA LigaseはFFPEサンプルの偽陽性率を低減します。Versatile T4 DNA Ligaseを含むDNA Lib Prepキットを用いて、3種類の標準サンプル(FFPE、gDNA、ctDNA)のライブラリを作成し、サプライヤーW社製品と直接比較しました。データは、gDNAとctDNAの両方において、12996のソフトクリップ率と偽キメラ率は競合他社W社製品と同等であることを示しています。しかし、FFPEサンプルでは12996が顕著な優位性を示しています。

注記

1.安全のため、白衣と使い捨て手袋を着用して作業してください。

2.緩衝液中に少量の沈殿物が生じる場合がありますが、これは正常な現象です。使用前に緩衝液を転倒混和し、よく混合してください。

3.この製品は研究用途のみです。

プロトコル

1.現在主流となっているライゲーション法を用いたDNAライブラリー調製キットは、通常、末端修復およびA-テーリング後の精製工程を必要としません。DNA断片は精製することなく、直接アダプターライゲーションにかけられます。本キットは、主流のライゲーション法と互換性があります。 シームレスなアダプターライゲーション用の市販の末端修復および A テーリング システム。

氷上のマイクロ遠心管に次の反応液をセットし、ピペッティングまたは振盪により​​穏やかに混合し、軽く遠心分離し、20°C で 15 分間加熱不活化します。

 

表1. アダプターライゲーション反応系

成分

容量 μL

最終濃度

dA末端DNA

60

10×T4 DNAリガーゼバッファー

10

0.1 μM-0.5 μM

50% PEG6000

12*

1 ng -400 ng

DNAアダプター

5**

 

ハイフ® 多用途T4 DNAリガーゼ (600 U/µL)

3~5***

 

ヌクレアーゼフリー水

 100まで

-

注意 *50% PEG6000溶液はキットに含まれていませんので、ご自身でご用意ください。

**表を参照してください 2 のために アダプタの量。

***T4 DNA リガーゼの量は必要に応じて 3 ~ 5 μL ずつ追加できます。

2.アダプターの濃度はライゲーション効率とライブラリー収量に直接影響します。アダプターを過剰に使用すると、  アダプターダイマーは増加するが、使用率が低いと接続効率とライブラリー生成に影響が出る可能性がある。表2 入力 DNA の量に応じて推奨されるアダプターの量をリストします。

 

表2. 100 pg-1 μgの入力DNAに対する推奨アダプター量

入力DNA

集中

0.1 ング

0.1 μM

1 ng

0.5μM

10 ng

1μM

25 ng

2μM

100 ng~1000 ng

10μM

注意】:アダプターの量は 上記の表の要件に応じて調整できます。

 

 

 

支払いとセキュリティ

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問い合わせ

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よくある質問

この製品は研究目的のみに使用され、人間や動物の治療や診断に使用することを意図したものではありません。製品とコンテンツは、Yeasen Biotechnology が所有する特許、商標、著作権によって保護されています。商標記号は原産国を示しますが、必ずしもすべての地域で登録されているわけではありません。

特定のアプリケーションでは、追加のサードパーティの知的財産権が必要になる場合があります。

Yeasen は倫理的な科学に専念しており、私たちの研究は安全性と倫理基準を確保しながら重要な問題に取り組むべきだと考えています。